ADAMTS4

ADAMTS4
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи ADAMTS4, ADAMTS-2, ADAMTS-4, ADMP-1, ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 4
Зовнішні ІД OMIM: 603876 MGI: 1339949 HomoloGene: 36169 GeneCards: ADAMTS4
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
9507
240913
Ensembl
ENSG00000158859
ENSMUSG00000006403
UniProt
O75173
Q8BNJ2
RefSeq (мРНК)
NM_005099
NM_001320336
NM_172845
RefSeq (білок)
NP_001307265
NP_005090
NP_766433
Локус (UCSC) Хр. 1: 161.18 – 161.2 Mb Хр. 1: 171.08 – 171.09 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ADAMTS4 (англ. ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 837 амінокислот, а молекулярна маса — 90 197[4].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSQTGSHPGR GLAGRWLWGA QPCLLLPIVP LSWLVWLLLL LLASLLPSAR
LASPLPREEE IVFPEKLNGS VLPGSGAPAR LLCRLQAFGE TLLLELEQDS
GVQVEGLTVQ YLGQAPELLG GAEPGTYLTG TINGDPESVA SLHWDGGALL
GVLQYRGAEL HLQPLEGGTP NSAGGPGAHI LRRKSPASGQ GPMCNVKAPL
GSPSPRPRRA KRFASLSRFV ETLVVADDKM AAFHGAGLKR YLLTVMAAAA
KAFKHPSIRN PVSLVVTRLV ILGSGEEGPQ VGPSAAQTLR SFCAWQRGLN
TPEDSDPDHF DTAILFTRQD LCGVSTCDTL GMADVGTVCD PARSCAIVED
DGLQSAFTAA HELGHVFNML HDNSKPCISL NGPLSTSRHV MAPVMAHVDP
EEPWSPCSAR FITDFLDNGY GHCLLDKPEA PLHLPVTFPG KDYDADRQCQ
LTFGPDSRHC PQLPPPCAAL WCSGHLNGHA MCQTKHSPWA DGTPCGPAQA
CMGGRCLHMD QLQDFNIPQA GGWGPWGPWG DCSRTCGGGV QFSSRDCTRP
VPRNGGKYCE GRRTRFRSCN TEDCPTGSAL TFREEQCAAY NHRTDLFKSF
PGPMDWVPRY TGVAPQDQCK LTCQAQALGY YYVLEPRVVD GTPCSPDSSS
VCVQGRCIHA GCDRIIGSKK KFDKCMVCGG DGSGCSKQSG SFRKFRYGYN
NVVTIPAGAT HILVRQQGNP GHRSIYLALK LPDGSYALNG EYTLMPSPTD
VVLPGAVSLR YSGATAASET LSGHGPLAQP LTLQVLVAGN PQDTRLRYSF
FVPRPTPSTP RPTPQDWLHR RAQILEILRR RPWAGRK

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • Wainwright S.D., Bondeson J., Hughes C.E. (2006). An alternative spliced transcript of ADAMTS4 is present in human synovium from OA patients. Matrix Biol. 25: 317—320. PMID 16723216 doi:10.1016/j.matbio.2006.03.006
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Wainwright S.D., Bondeson J., Caterson B., Hughes C.E. (2013). ADAMTS-4_v1 is a splice variant of ADAMTS-4 that is expressed as a protein in human synovium and cleaves aggrecan at the interglobular domain. Arthritis Rheum. 65: 2866—2875. PMID 23897278 doi:10.1002/art.38102

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:220 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, O75173 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також