MMP16

MMP16
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи MMP16, C8orf57, MMP-X2, MT-MMP2, MT-MMP3, MT3-MMP, matrix metallopeptidase 16
Зовнішні ІД OMIM: 602262 MGI: 1276107 HomoloGene: 55939 GeneCards: MMP16
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
4325
17389
Ensembl
ENSG00000156103
ENSMUSG00000028226
UniProt
P51512
Q9WTR0
RefSeq (мРНК)
NM_005941
NM_022564
NM_032297
NM_019724
NM_001379518
NM_001379519
RefSeq (білок)
NP_005932
NP_062698
NP_001366447
NP_001366448
Локус (UCSC) Хр. 8: 88.03 – 88.33 Mb Хр. 4: 17.85 – 18.12 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

MMP16 (англ. Matrix metallopeptidase 16) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 607 амінокислот, а молекулярна маса — 69 521[4].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MILLTFSTGR RLDFVHHSGV FFLQTLLWIL CATVCGTEQY FNVEVWLQKY
GYLPPTDPRM SVLRSAETMQ SALAAMQQFY GINMTGKVDR NTIDWMKKPR
CGVPDQTRGS SKFHIRRKRY ALTGQKWQHK HITYSIKNVT PKVGDPETRK
AIRRAFDVWQ NVTPLTFEEV PYSELENGKR DVDITIIFAS GFHGDSSPFD
GEGGFLAHAY FPGPGIGGDT HFDSDEPWTL GNPNHDGNDL FLVAVHELGH
ALGLEHSNDP TAIMAPFYQY METDNFKLPN DDLQGIQKIY GPPDKIPPPT
RPLPTVPPHR SIPPADPRKN DRPKPPRPPT GRPSYPGAKP NICDGNFNTL
AILRREMFVF KDQWFWRVRN NRVMDGYPMQ ITYFWRGLPP SIDAVYENSD
GNFVFFKGNK YWVFKDTTLQ PGYPHDLITL GSGIPPHGID SAIWWEDVGK
TYFFKGDRYW RYSEEMKTMD PGYPKPITVW KGIPESPQGA FVHKENGFTY
FYKGKEYWKF NNQILKVEPG YPRSILKDFM GCDGPTDRVK EGHSPPDDVD
IVIKLDNTAS TVKAIAIVIP CILALCLLVL VYTVFQFKRK GTPRHILYCK
RSMQEWV

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, металопротеаз. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • Takino T., Sato H., Shinagawa A., Seiki M. (1995). Identification of the second membrane-type matrix metalloproteinase (MT-MMP-2) gene from a human placenta cDNA library. MT-MMPs form a unique membrane-type subclass in the MMP family. J. Biol. Chem. 270: 23013—23020. PMID 7559440 doi:10.1074/jbc.270.39.23013
  • Matsumoto S., Katoh M., Saito S., Watanabe T., Masuho Y. (1997). Identification of soluble type of membrane-type matrix metalloproteinase-3 formed by alternatively spliced mRNA. Biochim. Biophys. Acta. 1354: 159—170. PMID 9396633 doi:10.1016/S0167-4781(97)00120-6
  • Shofuda K., Yasumitsu H., Nishihashi A., Miki K., Miyazaki K. (1997). Expression of three membrane-type matrix metalloproteinases (MT-MMPs) in rat vascular smooth muscle cells and characterization of MT3-MMPs with and without transmembrane domain. J. Biol. Chem. 272: 9749—9754. PMID 9092507 doi:10.1074/jbc.272.15.9749
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7162 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, P51512 (англ.) . Архів оригіналу за 1 червня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також