YTHDC1

YTHDC1
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	2YUD, 4R3H, 4R3I
معرفات
أسماء بديلة	YTHDC1, YT521, YT521-B, YTH domain containing 1
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 617283 MGI: MGI:2443713 HomoloGene: 15796 GeneCards: 91746
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية	• GO:0001948، GO:0016582 ربط بروتيني; • RNA binding; • N6-methyladenosine-containing RNA binding;
مكونات خلوية	• نواة; • nuclear speck; • غشاء خلوي; • بلازم نووي;
عمليات حيوية	• mRNA processing; • mRNA splice site selection; • تضفير الآر أن إيه; • regulation of mRNA splicing, via spliceosome; • mRNA export from nucleus; • dosage compensation by inactivation of X chromosome; • posttranscriptional regulation of gene expression;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
	Q96MU7
	E9Q5K9
	NM_133370، XM_005265708، NM_001330698 NM_001031732، NM_133370، XM_005265708، NM_001330698
	XM_006534863، XM_006534865، XM_006534867، XR_389269، XM_017320843، NM_001347375، NM_001347376، NM_001359907، NM_001359908، NR_153372، XM_030254395، XR_003955632، XR_004942503 NM_177680، XM_006534863، XM_006534865، XM_006534867، XR_389269، XM_017320843، NM_001347375، NM_001347376، NM_001359907، NM_001359908، NR_153372، XM_030254395، XR_003955632، XR_004942503
	NP_001317627، NP_588611، XP_005265764، XP_005265765، XP_016864321، XP_016864322 NP_001026902، NP_001317627، NP_588611، XP_005265764، XP_005265765، XP_016864321، XP_016864322
	NP_001334305، NP_808348، XP_006534926، XP_006534928، XP_006534930، XP_017176332، NP_001346836، NP_001346837، XP_030110255 NP_001334304، NP_001334305، NP_808348، XP_006534926، XP_006534928، XP_006534930، XP_017176332، NP_001346836، NP_001346837، XP_030110255
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

YTHDC1‏ (YTH domain containing 1) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين YTHDC1 في الإنسان.^[1]^[2]^[3]

الوظيفة

الأهمية السريرية

المراجع

^ "Entrez Gene: YTHDC1 YTH domain containing 1". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.
^ Stoilov P، Rafalska I، Stamm S (أكتوبر 2002). "YTH: a new domain in nuclear proteins". Trends Biochem Sci. ج. 27 ع. 10: 495–7. DOI:10.1016/S0968-0004(02)02189-8. PMID:12368078.
^ Hartmann AM، Nayler O، Schwaiger FW، Obermeier A، Stamm S (ديسمبر 1999). "The interaction and colocalization of Sam68 with the splicing-associated factor YT521-B in nuclear dots is regulated by the Src family kinase p59(fyn)". Mol Biol Cell. ج. 10 ع. 11: 3909–26. DOI:10.1091/mbc.10.11.3909. PMC:25688. PMID:10564280.

قراءة متعمقة

Imai Y، Matsuo N، Ogawa S، Tohyama M، Takagi T (1998). "Cloning of a gene, YT521, for a novel RNA splicing-related protein induced by hypoxia/reoxygenation". Brain Res. Mol. Brain Res. ج. 53 ع. 1–2: 33–40. DOI:10.1016/S0169-328X(97)00262-3. PMID:9473574.
Nayler O، Hartmann AM، Stamm S (2000). "The ER repeat protein YT521-B localizes to a novel subnuclear compartment". J. Cell Biol. ج. 150 ع. 5: 949–62. DOI:10.1083/jcb.150.5.949. PMC:2175241. PMID:10973987.
Stoss O، Olbrich M، Hartmann AM، Konig H، Memmott J، Andreadis A، Stamm S (2001). "The STAR/GSG family protein rSLM-2 regulates the selection of alternative splice sites". J. Biol. Chem. ج. 276 ع. 12: 8665–73. DOI:10.1074/jbc.M006851200. PMID:11118435.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Nagase T، Kikuno R، Ohara O (2002). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXII. The complete sequences of 50 new cDNA clones which code for large proteins". DNA Res. ج. 8 ع. 6: 319–27. DOI:10.1093/dnares/8.6.319. PMID:11853319.
Wilkinson FL، Holaska JM، Zhang Z، Sharma A، Manilal S، Holt I، Stamm S، Wilson KL، Morris GE (2003). "Emerin interacts in vitro with the splicing-associated factor, YT521-B". Eur. J. Biochem. ج. 270 ع. 11: 2459–66. DOI:10.1046/j.1432-1033.2003.03617.x. PMID:12755701.
Rafalska I، Zhang Z، Benderska N، Wolff H، Hartmann AM، Brack-Werner R، Stamm S (2005). "The intranuclear localization and function of YT521-B is regulated by tyrosine phosphorylation". Hum. Mol. Genet. ج. 13 ع. 15: 1535–49. DOI:10.1093/hmg/ddh167. PMID:15175272.
Beausoleil SA، Jedrychowski M، Schwartz D، Elias JE، Villén J، Li J، Cohn MA، Cantley LC، Gygi SP (2004). "Large-scale characterization of HeLa cell nuclear phosphoproteins". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 101 ع. 33: 12130–5. DOI:10.1073/pnas.0404720101. PMC:514446. PMID:15302935.
Stoss O، Novoyatleva T، Gencheva M، Olbrich M، Benderska N، Stamm S (2005). "p59(fyn)-mediated phosphorylation regulates the activity of the tissue-specific splicing factor rSLM-1". Mol. Cell. Neurosci. ج. 27 ع. 1: 8–21. DOI:10.1016/j.mcn.2004.04.011. PMID:15345239.
Kimura K، Wakamatsu A، Suzuki Y، Ota T، Nishikawa T، Yamashita R، Yamamoto J، Sekine M، Tsuritani K، Wakaguri H، Ishii S، Sugiyama T، Saito K، Isono Y، Irie R، Kushida N، Yoneyama T، Otsuka R، Kanda K، Yokoi T، Kondo H، Wagatsuma M، Murakawa K، Ishida S، Ishibashi T، Takahashi-Fujii A، Tanase T، Nagai K، Kikuchi H، Nakai K، Isogai T، Sugano S (2006). "Diversification of transcriptional modulation: large-scale identification and characterization of putative alternative promoters of human genes". Genome Res. ج. 16 ع. 1: 55–65. DOI:10.1101/gr.4039406. PMC:1356129. PMID:16344560.
Nousiainen M، Silljé HH، Sauer G، Nigg EA، Körner R (2006). "Phosphoproteome analysis of the human mitotic spindle". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 103 ع. 14: 5391–6. DOI:10.1073/pnas.0507066103. PMC:1459365. PMID:16565220.
Beausoleil SA، Villén J، Gerber SA، Rush J، Gygi SP (2006). "A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization". Nat. Biotechnol. ج. 24 ع. 10: 1285–92. DOI:10.1038/nbt1240. PMID:16964243.
Olsen JV، Blagoev B، Gnad F، Macek B، Kumar C، Mortensen P، Mann M (2006). "Global, in vivo, and site-specific phosphorylation dynamics in signaling networks". Cell. ج. 127 ع. 3: 635–48. DOI:10.1016/j.cell.2006.09.026. PMID:17081983.

[entrez-1] "Entrez Gene: YTHDC1 YTH domain containing 1". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.

[pmid12368078-2] Stoilov P، Rafalska I، Stamm S (أكتوبر 2002). "YTH: a new domain in nuclear proteins". Trends Biochem Sci. ج. 27 ع. 10: 495–7. DOI:10.1016/S0968-0004(02)02189-8. PMID:12368078.

[pmid10564280-3] Hartmann AM، Nayler O، Schwaiger FW، Obermeier A، Stamm S (ديسمبر 1999). "The interaction and colocalization of Sam68 with the splicing-associated factor YT521-B in nuclear dots is regulated by the Src family kinase p59(fyn)". Mol Biol Cell. ج. 10 ع. 11: 3909–26. DOI:10.1091/mbc.10.11.3909. PMC:25688. PMID:10564280.

[1]

[2]

[3]

التصنيفات الطبية	دليل الوراثة المندلية عند البشر (OMIM): 617283
المعرفات الخارجية	Ensembl Transcript ID: ENST00000344157 نظام اللغة الطبية الموحدة (UMLS CUI): C1823897