RBM8A

RBM8A
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	1P27, 2HYI, 2J0Q, 2J0S, 2XB2, 3EX7
معرفات
أسماء بديلة	RBM8A, BOV-1A, BOV-1B, BOV-1C, C1DELq21.1, DEL1q21.1, MDS014, RBM8, RBM8B, TAR, Y14, ZNRP, ZRNP1, RNA binding motif protein 8A
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 605313 MGI: MGI:1913129 HomoloGene: 3744 GeneCards: 9939
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية	• GO:0001948، GO:0016582 ربط بروتيني; • ربط حمض نووي; • RNA binding; • mRNA binding;
مكونات خلوية	• عصارة خلوية; • catalytic step 2 spliceosome; • exon-exon junction complex; • جسم الخلية العصبية; • زائدة شجرية; • spliceosomal complex; • نواة; • سيتوبلازم; • بلازم نووي; • nuclear speck; • U2-type catalytic step 1 spliceosome;
عمليات حيوية	• mRNA splicing, via spliceosome; • termination of RNA polymerase II transcription; • mRNA transport; • GO:0033168، GO:0036404، GO:1902360 معالجة (كيمياء حيوية); • mRNA processing; • regulation of alternative mRNA splicing, via spliceosome; • mRNA export from nucleus; • mRNA 3'-end processing; • regulation of translation; • RNA export from nucleus; • تفكك متوسط بلا معنى; • تضفير الآر أن إيه; • GO:0015915 نقل;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	; ; ; ;
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
	Q9Y5S9
	Q9CWZ3
	NM_005105
	NM_025875 NM_001102407، NM_025875
	NP_005096
	NP_080151 NP_001095877، NP_080151
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

RBM8A‏ (RNA binding motif protein 8A) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين RBM8A في الإنسان.^[1]^[2]^[3]

يشفر هذا الجين بروتينًا ذا وحدة ربط RNA محفوظة. يوجد هذا البروتين بشكل رئيسي في النواة، وإن كان موجودًا أيضًا في السيتوبلازم. ويرتبط بشكل تفضيلي بالرنا المرسال الناتج عن عملية التضفير، بما في ذلك الرنا المرسال النووي والرنا المرسال السيتوبلازمي المُصدَّر حديثًا. يُعتقد أن البروتين يبقى مرتبطًا بالرنا المرسال المُضفَّر كعلامة تُشير إلى مواقع الإنترونات، وبالتالي يربط بين أحداث التضفير قبل وبعد الرنا المرسال. سابقًا، كان يُعتقد أن جينين يشفران هذا البروتين، وهما RBM8A وRBM8B؛ أما الآن فيُعتقد أن موقع RBM8B هو جين كاذب. ينتج عن وجود كودونين بدء بديلين شكلان من البروتين، ويستخدم هذا الجين أيضًا مواقع متعددة لإضافة ذيل عديد الأدينين.^[4]

التفاعل

لقد ثبت أن RBM8A يتفاعل مع IPO13^[5] و MAGOH^[6] و UPF3A.^[7]

المشكلات الجينية المرتبطة

المراجع

^ "Entrez Gene: RBM8A RNA binding motif protein 8A". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.
^ Conklin DC، Rixon MW، Kuestner RE، Maurer MF، Whitmore TE، Millar RP (أكتوبر 2000). "Cloning and gene expression of a novel human ribonucleoprotein". Biochim Biophys Acta. ج. 1492 ع. 2–3: 465–9. DOI:10.1016/s0167-4781(00)00090-7. PMID:11004516.
^ Salicioni AM، Xi M، Vanderveer LA، Balsara B، Testa JR، Dunbrack RL Jr، Godwin AK (أكتوبر 2000). "Identification and structural analysis of human RBM8A and RBM8B: two highly conserved RNA-binding motif proteins that interact with OVCA1, a candidate tumor suppressor". Genomics. ج. 69 ع. 1: 54–62. DOI:10.1006/geno.2000.6315. PMID:11013075.
^ "Entrez Gene: RBM8A RNA binding motif protein 8A". مؤرشف من الأصل في 2024-06-16.
^ Mingot، J M؛ Kostka S؛ Kraft R؛ Hartmann E؛ Görlich D (يوليو 2001). "Importin 13: a novel mediator of nuclear import and export". EMBO J. England. ج. 20 ع. 14: 3685–94. DOI:10.1093/emboj/20.14.3685. ISSN:0261-4189. PMC:125545. PMID:11447110.
^ Kataoka، N؛ Diem M D؛ Kim V N؛ Yong J؛ Dreyfuss G (نوفمبر 2001). "Magoh, a human homolog of Drosophila mago nashi protein, is a component of the splicing-dependent exon–exon junction complex". EMBO J. England. ج. 20 ع. 22: 6424–33. DOI:10.1093/emboj/20.22.6424. ISSN:0261-4189. PMC:125744. PMID:11707413.
^ Kim، V N؛ Kataoka N؛ Dreyfuss G (سبتمبر 2001). "Role of the nonsense-mediated decay factor hUpf3 in the splicing-dependent exon-exon junction complex". Science. United States. ج. 293 ع. 5536: 1832–6. Bibcode:2001Sci...293.1832K. DOI:10.1126/science.1062829. ISSN:0036-8075. PMID:11546873. S2CID:12018200.
^ Klopocki E، Schulze H، Strauss G، وآخرون (فبراير 2007). "Complex Inheritance Pattern Resembling Autosomal Recessive Inheritance Involving a Microdeletion in Thrombocytopenia–Absent Radius Syndrome". Am. J. Hum. Genet. ج. 80 ع. 2: 232–40. DOI:10.1086/510919. PMC:1785342. PMID:17236129.

قراءة متعمقة

Wilson KF، Fortes P، Singh US، وآخرون (1999). "The nuclear cap-binding complex is a novel target of growth factor receptor-coupled signal transduction". J. Biol. Chem. ج. 274 ع. 7: 4166–73. DOI:10.1074/jbc.274.7.4166. PMID:9933612.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Zhao XF، Nowak NJ، Shows TB، Aplan PD (2000). "MAGOH interacts with a novel RNA-binding protein". Genomics. ج. 63 ع. 1: 145–8. DOI:10.1006/geno.1999.6064. PMID:10662555.
Kataoka N، Yong J، Kim VN، وآخرون (2000). "Pre-mRNA splicing imprints mRNA in the nucleus with a novel RNA-binding protein that persists in the cytoplasm". Mol. Cell. ج. 6 ع. 3: 673–82. DOI:10.1016/S1097-2765(00)00065-4. PMID:11030346.
Zhang QH، Ye M، Wu XY، وآخرون (2001). "Cloning and Functional Analysis of cDNAs with Open Reading Frames for 300 Previously Undefined Genes Expressed in CD34+ Hematopoietic Stem/Progenitor Cells". Genome Res. ج. 10 ع. 10: 1546–60. DOI:10.1101/gr.140200. PMC:310934. PMID:11042152.
Le Hir H، Izaurralde E، Maquat LE، Moore MJ (2001). "The spliceosome deposits multiple proteins 20–24 nucleotides upstream of mRNA exon–exon junctions". EMBO J. ج. 19 ع. 24: 6860–9. DOI:10.1093/emboj/19.24.6860. PMC:305905. PMID:11118221.
Mingot JM، Kostka S، Kraft R، وآخرون (2001). "Importin 13: a novel mediator of nuclear import and export". EMBO J. ج. 20 ع. 14: 3685–94. DOI:10.1093/emboj/20.14.3685. PMC:125545. PMID:11447110.
Kim VN، Kataoka N، Dreyfuss G (2001). "Role of the nonsense-mediated decay factor hUpf3 in the splicing-dependent exon-exon junction complex". Science. ج. 293 ع. 5536: 1832–6. Bibcode:2001Sci...293.1832K. DOI:10.1126/science.1062829. PMID:11546873.
Lykke-Andersen J، Shu MD، Steitz JA (2001). "Communication of the position of exon-exon junctions to the mRNA surveillance machinery by the protein RNPS1". Science. ج. 293 ع. 5536: 1836–9. Bibcode:2001Sci...293.1836L. DOI:10.1126/science.1062786. PMID:11546874.
Hachet O، Ephrussi A (2002). "Drosophila Y14 shuttles to the posterior of the oocyte and is required for oskar mRNA transport". Curr. Biol. ج. 11 ع. 21: 1666–74. DOI:10.1016/S0960-9822(01)00508-5. PMID:11696323.
Faurholm B، Millar RP، Katz AA (2002). "The genes encoding the type II gonadotropin-releasing hormone receptor and the ribonucleoprotein RBM8A in humans overlap in two genomic loci". Genomics. ج. 78 ع. 1–2: 15–8. DOI:10.1006/geno.2001.6650. PMID:11707068.
Kataoka N، Diem MD، Kim VN، وآخرون (2002). "Magoh, a human homolog of Drosophila mago nashi protein, is a component of the splicing-dependent exon–exon junction complex". EMBO J. ج. 20 ع. 22: 6424–33. DOI:10.1093/emboj/20.22.6424. PMC:125744. PMID:11707413.
Jurica MS، Licklider LJ، Gygi SR، وآخرون (2002). "Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis". RNA. ج. 8 ع. 4: 426–39. DOI:10.1017/S1355838202021088. PMC:1370266. PMID:11991638.
Okubo K، Mitani H، Naruse K، وآخرون (2002). "Conserved physical linkage of GnRH-R and RBM8 in the medaka and human genomes". Biochem. Biophys. Res. Commun. ج. 293 ع. 1: 327–31. DOI:10.1016/S0006-291X(02)00161-4. PMID:12054603.
Lejeune F، Ishigaki Y، Li X، Maquat LE (2002). "The exon junction complex is detected on CBP80-bound but not eIF4E-bound mRNA in mammalian cells: dynamics of mRNP remodeling". EMBO J. ج. 21 ع. 13: 3536–45. DOI:10.1093/emboj/cdf345. PMC:126094. PMID:12093754.
Strausberg RL، Feingold EA، Grouse LH، وآخرون (2003). "Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences". Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. ج. 99 ع. 26: 16899–903. Bibcode:2002PNAS...9916899M. DOI:10.1073/pnas.242603899. PMC:139241. PMID:12477932.
Gehring NH، Neu-Yilik G، Schell T، وآخرون (2003). "Y14 and hUpf3b form an NMD-activating complex". Mol. Cell. ج. 11 ع. 4: 939–49. DOI:10.1016/S1097-2765(03)00142-4. PMID:12718880.
Fribourg S، Gatfield D، Izaurralde E، Conti E (2003). "A novel mode of RBD-protein recognition in the Y14-Mago complex". Nat. Struct. Biol. ج. 10 ع. 6: 433–9. DOI:10.1038/nsb926. PMID:12730685.
Lau CK، Diem MD، Dreyfuss G، Van Duyne GD (2004). "Structure of the Y14-Magoh core of the exon junction complex". Curr. Biol. ج. 13 ع. 11: 933–41. DOI:10.1016/S0960-9822(03)00328-2. PMID:12781131.

[entrez-1] "Entrez Gene: RBM8A RNA binding motif protein 8A". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.

[pmid11004516-2] Conklin DC، Rixon MW، Kuestner RE، Maurer MF، Whitmore TE، Millar RP (أكتوبر 2000). "Cloning and gene expression of a novel human ribonucleoprotein". Biochim Biophys Acta. ج. 1492 ع. 2–3: 465–9. DOI:10.1016/s0167-4781(00)00090-7. PMID:11004516.

[pmid11013075-3] Salicioni AM، Xi M، Vanderveer LA، Balsara B، Testa JR، Dunbrack RL Jr، Godwin AK (أكتوبر 2000). "Identification and structural analysis of human RBM8A and RBM8B: two highly conserved RNA-binding motif proteins that interact with OVCA1, a candidate tumor suppressor". Genomics. ج. 69 ع. 1: 54–62. DOI:10.1006/geno.2000.6315. PMID:11013075.

[entrez2-4] "Entrez Gene: RBM8A RNA binding motif protein 8A". مؤرشف من الأصل في 2024-06-16.

[pmid11447110-5] Mingot، J M؛ Kostka S؛ Kraft R؛ Hartmann E؛ Görlich D (يوليو 2001). "Importin 13: a novel mediator of nuclear import and export". EMBO J. England. ج. 20 ع. 14: 3685–94. DOI:10.1093/emboj/20.14.3685. ISSN:0261-4189. PMC:125545. PMID:11447110.

[pmid11707413-6] Kataoka، N؛ Diem M D؛ Kim V N؛ Yong J؛ Dreyfuss G (نوفمبر 2001). "Magoh, a human homolog of Drosophila mago nashi protein, is a component of the splicing-dependent exon–exon junction complex". EMBO J. England. ج. 20 ع. 22: 6424–33. DOI:10.1093/emboj/20.22.6424. ISSN:0261-4189. PMC:125744. PMID:11707413.

[pmid11546873-7] Kim، V N؛ Kataoka N؛ Dreyfuss G (سبتمبر 2001). "Role of the nonsense-mediated decay factor hUpf3 in the splicing-dependent exon-exon junction complex". Science. United States. ج. 293 ع. 5536: 1832–6. Bibcode:2001Sci...293.1832K. DOI:10.1126/science.1062829. ISSN:0036-8075. PMID:11546873. S2CID:12018200.

[pmid17236129-8] Klopocki E، Schulze H، Strauss G، وآخرون (فبراير 2007). "Complex Inheritance Pattern Resembling Autosomal Recessive Inheritance Involving a Microdeletion in Thrombocytopenia–Absent Radius Syndrome". Am. J. Hum. Genet. ج. 80 ع. 2: 232–40. DOI:10.1086/510919. PMC:1785342. PMID:17236129.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]

[8]

التصنيفات الطبية	دليل الوراثة المندلية عند البشر (OMIM): 605313
المعرفات الخارجية	Ensembl Transcript ID: ENST00000692065 نظام اللغة الطبية الموحدة (UMLS CUI): C1419303