CDK5RAP2

CDK5RAP2
Ідентифікатори
Символи	CDK5RAP2, C48, Cep215, MCPH3, CDK5 regulatory subunit associated protein 2
Зовнішні ІД	OMIM: 608201 MGI: 2384875 HomoloGene: 49533 GeneCards: CDK5RAP2
Пов'язані генетичні захворювання
	ревматоїдний артрит
Реагує на сполуку
	Viroporin 3a
Онтологія гена
Молекулярна функція	• microtubule binding; • tubulin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein kinase binding; • calmodulin binding; • gamma-tubulin binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • mitotic spindle pole; • центросома; • комплекс Ґольджі; • spindle pole; • pericentriolar material; • центр організації мікротрубочок; • microtubule plus-end; • міжклітинні контакти; • perinuclear region of cytoplasm; • цитоскелет; • мікротрубочка; • екзосома;
Біологічний процес	• regulation of neuron differentiation; • negative regulation of centriole replication; • Нейрогенез; • negative regulation of neuron differentiation; • chromosome segregation; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • brain development; • G2/M transition of mitotic cell cycle; • microtubule bundle formation; • regulation of spindle checkpoint; • establishment of mitotic spindle orientation; • centriole replication; • microtubule organizing center organization; • microtubule cytoskeleton organization; • ciliary basal body-plasma membrane docking; • centrosome cycle; • regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle; • positive regulation of microtubule polymerization; • regulation of mitotic cell cycle spindle assembly checkpoint;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	55755
	214444
	ENSG00000136861
	ENSMUSG00000039298
	Q96SN8
	P68254; Q8K389
	NM_001011649; NM_001272039; NM_018249
	NM_145990; NM_001313762
	NP_001011649; NP_001258968; NP_060719
	NP_035869; NP_001300691; NP_666102
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CDK5RAP2 (англ. CDK5 regulatory subunit associated protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 893 амінокислот, а молекулярна маса — 215 038^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MMDLVLEEDV	TVPGTLSGCS	GLVPSVPDDL	DGINPNAGLG	NGLLPNVSEE
TVSPTRARNM	KDFENQITEL	KKENFNLKLR	IYFLEERMQQ	EFHGPTEHIY
KTNIELKVEV	ESLKRELQER	EQLLIKASKA	VESLAEAGGS	EIQRVKEDAR
KKVQQVEDLL	TKRILLLEKD	VTAAQAELEK	AFAGTETEKA	LRLRLESKLS
EMKKMHEGDL	AMALVLDEKD	RLIEELKLSL	KSKEALIQCL	KEEKSQMACP
DENVSSGELR	GLCAAPREEK	ERETEAAQME	HQKERNSFEE	RIQALEEDLR
EKEREIATEK	KNSLKRDKAI	QGLTMALKSK	EKKVEELNSE	IEKLSAAFAK
AREALQKAQT	QEFQGSEDYE	TALSGKEALS	AALRSQNLTK	STENHRLRRS
IKKITQELSD	LQQERERLEK	DLEEAHREKS	KGDCTIRDLR	NEVEKLRNEV
NEREKAMENR	YKSLLSESNK	KLHNQEQVIK	HLTESTNQKD	VLLQKFNEKD
LEVIQQNCYL	MAAEDLELRS	EGLITEKCSS	QQPPGSKTIF	SKEKKQSSDY
EELIQVLKKE	QDIYTHLVKS	LQESDSINNL	QAELNKIFAL	RKQLEQDVLS
YQNLRKTLEE	QISEIRRREE	ESFSLYSDQT	SYLSICLEEN	NRFQVEHFSQ
EELKKKVSDL	IQLVKELYTD	NQHLKKTIFD	LSCMGFQGNG	FPDRLASTEQ
TELLASKEDE	DTIKIGEDDE	INFLSDQHLQ	QSNEIMKDLS	KGGCKNGYLR
HTESKISDCD	GAHAPGCLEE	GAFINLLAPL	FNEKATLLLE	SRPDLLKVVR
ELLLGQLFLT	EQEVSGEHLD	GKTEKTPKQK	GELVHFVQTN	SFSKPHDELK
LSCEAQLVKA	GEVPKVGLKD	ASVQTVATEG	DLLRFKHEAT	REAWEEKPIN
TALSAEHRPE	NLHGVPGWQA	ALLSLPGITN	REAKKSRLPI	LIKPSRSLGN
MYRLPATQEV	VTQLQSQILE	LQGELKEFKT	CNKQLHQKLI	LAEAVMEGRP
TPDKTLLNAQ	PPVGAAYQDS	PGEQKGIKTT	SSVWRDKEMD	SDQQRSYEID
SEICPPDDLA	SLPSCKENPE	DVLSPTSVAT	YLSSKSQPSA	KVSVMGTDQS
ESINTSNETE	YLKQKIHDLE	TELEGYQNFI	FQLQKHSQCS	EAIITVLCGT
EGAQDGLSKP	KNGSDGEEMT	FSSLHQVRYV	KHVKILGPLA	PEMIDSRVLE
NLKQQLEEQE	YKLQKEQNLN	MQLFSEIHNL	QNKFRDLSPP	RYDSLVQSQA
RELSLQRQQI	KDGHGICVIS	RQHMNTMIKA	FEELLQASDV	DYCVAEGFQE
QLNQCAELLE	KLEKLFLNGK	SVGVEMNTQN	ELMERIEEDN	LTYQHLLPES
PEPSASHALS	DYETSEKSFF	SRDQKQDNET	EKTSVMVNSF	SQDLLMEHIQ
EIRTLRKRLE	ESIKTNEKLR	KQLERQGSEF	VQGSTSIFAS	GSELHSSLTS
EIHFLRKQNQ	ALNAMLIKGS	RDKQKENDKL	RESLSRKTVS	LEHLQREYAS
VKEENERLQK	EGSEKERHNQ	QLIQEVRCSG	QELSRVQEEV	KLRQQLLSQN
DKLLQSLRVE	LKAYEKLDEE	HRRLREASGE	GWKGQDPFRD	LHSLLMEIQA
LRLQLERSIE	TSSTLQSRLK	EQLARGAEKA	QEGALTLAVQ	AVSIPEVPLQ
PDKHDGDKYP	MESDNSFDLF	DSSQAVTPKS	VSETPPLSGN	DTDSLSCDSG
SSATSTPCVS	RLVTGHHLWA	SKNGRHVLGL	IEDYEALLKQ	ISQGQRLLAE
MDIQTQEAPS	STSQELGTKG	PHPAPLSKFV	SSVSTAKLTL	EEAYRRLKLL
WRVSLPEDGQ	CPLHCEQIGE	MKAEVTKLHK	KLFEQEKKLQ	NTMKLLQLSK
RQEKVIFDQL	VVTHKILRKA	RGNLELRPGG	AHPGTCSPSR	PGS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою кальмодуліну. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, апараті гольджі.

Література

Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 doi:10.1093/dnares/7.4.271
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Ching Y.-P., Qi Z., Wang J.H. (2000). Cloning of three novel neuronal Cdk5 activator binding proteins. Gene. 242: 285—294. PMID 10721722 doi:10.1016/S0378-1119(99)00499-0
Graser S., Stierhof Y.D., Nigg E.A. (2007). Cep68 and Cep215 (Cdk5rap2) are required for centrosome cohesion. J. Cell Sci. 120: 4321—4331. PMID 18042621 doi:10.1242/jcs.020248
Fong K.W., Choi Y.K., Rattner J.B., Qi R.Z. (2008). CDK5RAP2 is a pericentriolar protein that functions in centrosomal attachment of the gamma-tubulin ring complex. Mol. Biol. Cell. 19: 115—125. PMID 17959831 doi:10.1091/mbc.E07-04-0371
Haren L., Stearns T., Lueders J. (2009). Plk1-dependent recruitment of gamma-tubulin complexes to mitotic centrosomes involves multiple PCM components. PLoS ONE. 4: E5976—E5976. PMID 19543530 doi:10.1371/journal.pone.0005976

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CDK5RAP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з CDK5 regulatory subunit associated protein 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18672 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-08-22 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q96SN8 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 9

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CDK5RAP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з CDK5 regulatory subunit associated protein 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18672 (англ.) . Архів оригіналу за 22 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-08-22 у Wayback Machine.]

[UniProt-6] UniProt, Q96SN8 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

Центросома та її компоненти
Центріоль	SASS6 CENPJ CNTROB CEP104 Центрини CETN1 CETN2 CETN3 SFI1
Періцентріольний матеріал	BBS4 LCK PCM1 PCNT TNKS TNKS2 TUBE1
інші білки	CCP110 CEP55 CEP57 CEP63 CEP68 CEP70 CEP72 CEP76 CEP78 CEP90 CEP97 CEP120 CEP135 CEP152 CEP164 CEP170 CEP192 CEP215 CEP250 CEP350 CNTRL NIN NINL