NIN
NIN (англ. Ninein) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 14-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 2 090 амінокислот, а молекулярна маса — 243 249[6].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
| MDEVEQDQHE | ARLKELFDSF | DTTGTGSLGQ | EELTDLCHML | SLEEVAPVLQ | ||||
| QTLLQDNLLG | RVHFDQFKEA | LILILSRTLS | NEEHFQEPDC | SLEAQPKYVR | ||||
| GGKRYGRRSL | PEFQESVEEF | PEVTVIEPLD | EEARPSHIPA | GDCSEHWKTQ | ||||
| RSEEYEAEGQ | LRFWNPDDLN | ASQSGSSPPQ | DWIEEKLQEV | CEDLGITRDG | ||||
| HLNRKKLVSI | CEQYGLQNVD | GEMLEEVFHN | LDPDGTMSVE | DFFYGLFKNG | ||||
| KSLTPSASTP | YRQLKRHLSM | QSFDESGRRT | TTSSAMTSTI | GFRVFSCLDD | ||||
| GMGHASVERI | LDTWQEEGIE | NSQEILKALD | FSLDGNINLT | ELTLALENEL | ||||
| LVTKNSIHQA | ALASFKAEIR | HLLERVDQVV | REKEKLRSDL | DKAEKLKSLM | ||||
| ASEVDDHHAA | IERRNEYNLR | KLDEEYKERI | AALKNELRKE | REQILQQAGK | ||||
| QRLELEQEIE | KAKTEENYIR | DRLALSLKEN | SRLENELLEN | AEKLAEYENL | ||||
| TNKLQRNLEN | VLAEKFGDLD | PSSAEFFLQE | ERLTQMRNEY | ERQCRVLQDQ | ||||
| VDELQSELEE | YRAQGRVLRL | PLKNSPSEEV | EANSGGIEPE | HGLGSEECNP | ||||
| LNMSIEAELV | IEQMKEQHHR | DICCLRLELE | DKVRHYEKQL | DETVVSCKKA | ||||
| QENMKQRHEN | ETHTLEKQIS | DLKNEIAELQ | GQAAVLKEAH | HEATCRHEEE | ||||
| KKQLQVKLEE | EKTHLQEKLR | LQHEMELKAR | LTQAQASFER | EREGLQSSAW | ||||
| TEEKVRGLTQ | ELEQFHQEQL | TSLVEKHTLE | KEELRKELLE | KHQRELQEGR | ||||
| EKMETECNRR | TSQIEAQFQS | DCQKVTERCE | SALQSLEGRY | RQELKDLQEQ | ||||
| QREEKSQWEF | EKDELTQECA | EAQELLKETL | KREKTTSLVL | TQEREMLEKT | ||||
| YKEHLNSMVV | ERQQLLQDLE | DLRNVSETQQ | SLLSDQILEL | KSSHKRELRE | ||||
| REEVLCQAGA | SEQLASQRLE | RLEMEHDQER | QEMMSKLLAM | ENIHKATCET | ||||
| ADRERAEMST | EISRLQSKIK | EMQQATSPLS | MLQSGCQVIG | EEEVEGDGAL | ||||
| SLLQQGEQLL | EENGDVLLSL | QRAHEQAVKE | NVKMATEISR | LQQRLQKLEP | ||||
| GLVMSSCLDE | PATEFFGNTA | EQTEQFLQQN | RTKQVEGVTR | RHVLSDLEDD | ||||
| EVRDLGSTGT | SSVQRQEVKI | EESEASVEGF | SELENSEETR | TESWELKNQI | ||||
| SQLQEQLMML | CADCDRASEK | KQDLLFDVSV | LKKKLKMLER | IPEASPKYKL | ||||
| LYEDVSREND | CLQEELRMME | TRYDEALENN | KELTAEVFRL | QDELKKMEEV | ||||
| TETFLSLEKS | YDEVKIENEG | LNVLVLRLQG | KIEKLQESVV | QRCDCCLWEA | ||||
| SLENLEIEPD | GNILQLNQTL | EECVPRVRSV | HHVIEECKQE | NQYLEGNTQL | ||||
| LEKVKAHEIA | WLHGTIQTHQ | ERPRVQNQVI | LEENTTLLGF | QDKHFQHQAT | ||||
| IAELELEKTK | LQELTRKLKE | RVTILVKQKD | VLSHGEKEEE | LKAMMHDLQI | ||||
| TCSEMQQKVE | LLRYESEKLQ | QENSILRNEI | TTLNEEDSIS | NLKLGTLNGS | ||||
| QEEMWQKTET | VKQENAAVQK | MVENLKKQIS | ELKIKNQQLD | LENTELSQKN | ||||
| SQNQEKLQEL | NQRLTEMLCQ | KEKEPGNSAL | EEREQEKFNL | KEELERCKVQ | ||||
| SSTLVSSLEA | ELSEVKIQTH | IVQQENHLLK | DELEKMKQLH | RCPDLSDFQQ | ||||
| KISSVLSYNE | KLLKEKEALS | EELNSCVDKL | AKSSLLEHRI | ATMKQEQKSW | ||||
| EHQSASLKSQ | LVASQEKVQN | LEDTVQNVNL | QMSRMKSDLR | VTQQEKEALK | ||||
| QEVMSLHKQL | QNAGGKSWAP | EIATHPSGLH | NQQKRLSWDK | LDHLMNEEQQ | ||||
| LLWQENERLQ | TMVQNTKAEL | THSREKVRQL | ESNLLPKHQK | HLNPSGTMNP | ||||
| TEQEKLSLKR | ECDQFQKEQS | PANRKVSQMN | SLEQELETIH | LENEGLKKKQ | ||||
| VKLDEQLMEM | QHLRSTATPS | PSPHAWDLQL | LQQQACPMVP | REQFLQLQRQ | ||||
| LLQAERINQH | LQEELENRTS | ETNTPQGNQE | QLVTVMEERM | IEVEQKLKLV | ||||
| KRLLQEKVNQ | LKEQVSLPGH | LCSPTSHSSF | NSSFTSLYCH |
Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з нуклеотидами, ГТФ. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.
Література
- Hong Y.-R., Chen C.-H., Chuo M.-H., Liou S.-Y., Howng S.-L. (2000). Genomic organization and molecular characterization of the human ninein gene. Biochem. Biophys. Res. Commun. 279: 989—995. PMID 11162463 doi:10.1006/bbrc.2000.4050
- Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 doi:10.1093/dnares/7.4.271
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Dammermann A., Merdes A. (2002). Assembly of centrosomal proteins and microtubule organization depends on PCM-1. J. Cell Biol. 159: 255—266. PMID 12403812 doi:10.1083/jcb.200204023
- Fritzler M.J., Zhang M., Stinton L.M., Rattner J.B. (2003). Spectrum of centrosome autoantibodies in childhood varicella and post-varicella acute cerebellar ataxia. BMC Pediatr. 3: 11—11. PMID 14503922 doi:10.1186/1471-2431-3-11
- Kodani A., Salome Sirerol-Piquer M., Seol A., Garcia-Verdugo J.M., Reiter J.F. (2013). Kif3a interacts with Dynactin subunit p150 Glued to organize centriole subdistal appendages. EMBO J. 32: 597—607. PMID 23386061 doi:10.1038/emboj.2013.3
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з NIN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Ninein переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14906 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.
{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑ UniProt, Q8N4C6 (англ.) . Архів оригіналу за 20 липня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.