LCK

LCK
Наявні структури
PDBПошук ортологів: E9PI33 PDBe E9PI33 RCSB
Ідентифікатори
Символи LCK, LCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase, IMD22, LSK, YT16, p56lck, pp58lck
Зовнішні ІД OMIM: 153390 MGI: 96756 HomoloGene: 3911 GeneCards: LCK
Пов'язані генетичні захворювання
severe combined immunodeficiency due to LCK deficiency[1]
Реагує на сполуку
saracatinib, SU6656[2]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3932
16818
Ensembl
ENSG00000182866
ENSMUSG00000000409
UniProt
P06239
P06240
RefSeq (мРНК)
NM_001042771
NM_005356
NM_001330468
NM_001162432
NM_001162433
NM_010693
RefSeq (білок)
NP_001036236
NP_001317397
NP_005347
NP_001155904
NP_001155905
NP_034823
Локус (UCSC) Хр. 1: 32.25 – 32.29 Mb Хр. 4: 129.44 – 129.47 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

LCK (англ. LCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 509 амінокислот, а молекулярна маса — 58 001[6].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MGCGCSSHPE DDWMENIDVC ENCHYPIVPL DGKGTLLIRN GSEVRDPLVT
YEGSNPPASP LQDNLVIALH SYEPSHDGDL GFEKGEQLRI LEQSGEWWKA
QSLTTGQEGF IPFNFVAKAN SLEPEPWFFK NLSRKDAERQ LLAPGNTHGS
FLIRESESTA GSFSLSVRDF DQNQGEVVKH YKIRNLDNGG FYISPRITFP
GLHELVRHYT NASDGLCTRL SRPCQTQKPQ KPWWEDEWEV PRETLKLVER
LGAGQFGEVW MGYYNGHTKV AVKSLKQGSM SPDAFLAEAN LMKQLQHQRL
VRLYAVVTQE PIYIITEYME NGSLVDFLKT PSGIKLTINK LLDMAAQIAE
GMAFIEERNY IHRDLRAANI LVSDTLSCKI ADFGLARLIE DNEYTAREGA
KFPIKWTAPE AINYGTFTIK SDVWSFGILL TEIVTHGRIP YPGMTNPEVI
QNLERGYRMV RPDNCPEELY QLMRLCWKER PEDRPTFDYL RSVLEDFFTA
TEGQYQPQP

Кодований геном білок за функціями належить до тирозинових протеїнкіназ родини Src-протеїнкіназ. Задіяний у такому біологічному процесі як взаємодія хазяїн-вірус. Білок має сайт для зв'язування з АТФ. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі.

Література

  • Wright D.D., Sefton B.M., Kamps M.P. (1994). Oncogenic activation of the Lck protein accompanies translocation of the LCK gene in the human HSB2 T-cell leukemia. Mol. Cell. Biol. 14: 2429—2437. PMID 8139546 doi:10.1128/MCB.14.4.2429
  • Vogel L.B., Arthur R., Fujita D.J. (1995). An aberrant lck mRNA in two human T-cell lines. Biochim. Biophys. Acta. 1264: 168—172. PMID 7495859 doi:10.1016/0167-4781(95)00162-A
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Garvin A.M., Pawar S., Marth J.D., Perlmutter R.M. (1988). Structure of the murine lck gene and its rearrangement in a murine lymphoma cell line. Mol. Cell. Biol. 8: 3058—3064. PMID 2850479 doi:10.1128/MCB.8.8.3058
  • Vogel L.B., Fujita D.J. (1993). The SH3 domain of p56lck is involved in binding to phosphatidylinositol 3'-kinase from T lymphocytes. Mol. Cell. Biol. 13: 7408—7417. PMID 7504174 doi:10.1128/MCB.13.12.7408
  • Vogel L.B., Fujita D.J. (1995). p70 phosphorylation and binding to p56lck is an early event in interleukin-2-induced onset of cell cycle progression in T-lymphocytes. J. Biol. Chem. 270: 2506—2511. PMID 7852312 doi:10.1074/jbc.270.6.2506

Примітки

  1. ↑ Захворювання, генетично пов'язані з LCK переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. ↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з LCK proto-oncogene, Src family tyrosine kinase переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. ↑ Human PubMed Reference:.
  4. ↑ Mouse PubMed Reference:.
  5. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6524 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  6. ↑ UniProt, P06239 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також