CELSR1

CELSR1
Ідентифікатори
Символи CELSR1, CDHF9, FMI2, HFMI2, ME2, ADGRC1, cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1, LMPHM9
Зовнішні ІД OMIM: 604523 MGI: 1100883 HomoloGene: 7665 GeneCards: CELSR1
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
9620
12614
Ensembl
ENSG00000075275
ENSMUSG00000016028
UniProt
Q9NYQ6
O35161
RefSeq (мРНК)
NM_014246
NM_001378328
NM_009886
RefSeq (білок)
NP_055061
NP_001365257
NP_034016
Локус (UCSC) Хр. 22: 46.36 – 46.54 Mb Хр. 15: 85.78 – 85.92 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CELSR1 (англ. Cadherin EGF LAG seven-pass G-type receptor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 014 амінокислот, а молекулярна маса — 329 486[4].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAPPPPPVLP VLLLLAAAAA LPAMGLRAAA WEPRVPGGTR AFALRPGCTY
AVGAACTPRA PRELLDVGRD GRLAGRRRVS GAGRPLPLQV RLVARSAPTA
LSRRLRARTH LPGCGARARL CGTGARLCGA LCFPVPGGCA AAQHSALAAP
TTLPACRCPP RPRPRCPGRP ICLPPGGSVR LRLLCALRRA AGAVRVGLAL
EAATAGTPSA SPSPSPPLPP NLPEARAGPA RRARRGTSGR GSLKFPMPNY
QVALFENEPA GTLILQLHAH YTIEGEEERV SYYMEGLFDE RSRGYFRIDS
ATGAVSTDSV LDRETKETHV LRVKAVDYST PPRSATTYIT VLVKDTNDHS
PVFEQSEYRE RVRENLEVGY EVLTIRASDR DSPINANLRY RVLGGAWDVF
QLNESSGVVS TRAVLDREEA AEYQLLVEAN DQGRNPGPLS ATATVYIEVE
DENDNYPQFS EQNYVVQVPE DVGLNTAVLR VQATDRDQGQ NAAIHYSILS
GNVAGQFYLH SLSGILDVIN PLDFEDVQKY SLSIKAQDGG RPPLINSSGV
VSVQVLDVND NEPIFVSSPF QATVLENVPL GYPVVHIQAV DADSGENARL
HYRLVDTAST FLGGGSAGPK NPAPTPDFPF QIHNSSGWIT VCAELDREEV
EHYSFGVEAV DHGSPPMSSS TSVSITVLDV NDNDPVFTQP TYELRLNEDA
AVGSSVLTLQ ARDRDANSVI TYQLTGGNTR NRFALSSQRG GGLITLALPL
DYKQEQQYVL AVTASDGTRS HTAHVLINVT DANTHRPVFQ SSHYTVSVSE
DRPVGTSIAT LSANDEDTGE NARITYVIQD PVPQFRIDPD SGTMYTMMEL
DYENQVAYTL TIMAQDNGIP QKSDTTTLEI LILDANDNAP QFLWDFYQGS
IFEDAPPSTS ILQVSATDRD SGPNGRLLYT FQGGDDGDGD FYIEPTSGVI
RTQRRLDREN VAVYNLWALA VDRGSPTPLS ASVEIQVTIL DINDNAPMFE
KDELELFVEE NNPVGSVVAK IRANDPDEGP NAQIMYQIVE GDMRHFFQLD
LLNGDLRAMV ELDFEVRREY VLVVQATSAP LVSRATVHIL LVDQNDNPPV
LPDFQILFNN YVTNKSNSFP TGVIGCIPAH DPDVSDSLNY TFVQGNELRL
LLLDPATGEL QLSRDLDNNR PLEALMEVSV SDGIHSVTAF CTLRVTIITD
DMLTNSITVR LENMSQEKFL SPLLALFVEG VAAVLSTTKD DVFVFNVQND
TDVSSNILNV TFSALLPGGV RGQFFPSEDL QEQIYLNRTL LTTISTQRVL
PFDDNICLRE PCENYMKCVS VLRFDSSAPF LSSTTVLFRP IHPINGLRCR
CPPGFTGDYC ETEIDLCYSD PCGANGRCRS REGGYTCECF EDFTGEHCEV
DARSGRCANG VCKNGGTCVN LLIGGFHCVC PPGEYERPYC EVTTRSFPPQ
SFVTFRGLRQ RFHFTISLTF ATQERNGLLL YNGRFNEKHD FIALEIVDEQ
VQLTFSAGET TTTVAPKVPS GVSDGRWHSV QVQYYNKPNI GHLGLPHGPS
GEKMAVVTVD DCDTTMAVRF GKDIGNYSCA AQGTQTGSKK SLDLTGPLLL
GGVPNLPEDF PVHNRQFVGC MRNLSVDGKN VDMAGFIANN GTREGCAARR
NFCDGRRCQN GGTCVNRWNM YLCECPLRFG GKNCEQAMPH PQLFSGESVV
SWSDLNIIIS VPWYLGLMFR TRKEDSVLME ATSGGPTSFR LQILNNYLQF
EVSHGPSDVE SVMLSGLRVT DGEWHHLLIE LKNVKEDSEM KHLVTMTLDY
GMDQNKADIG GMLPGLTVRS VVVGGASEDK VSVRRGFRGC MQGVRMGGTP
TNVATLNMNN ALKVRVKDGC DVDDPCTSSP CPPNSRCHDA WEDYSCVCDK
GYLGINCVDA CHLNPCENMG ACVRSPGSPQ GYVCECGPSH YGPYCENKLD
LPCPRGWWGN PVCGPCHCAV SKGFDPDCNK TNGQCQCKEN YYKLLAQDTC
LPCDCFPHGS HSRTCDMATG QCACKPGVIG RQCNRCDNPF AEVTTLGCEV
IYNGCPKAFE AGIWWPQTKF GQPAAVPCPK GSVGNAVRHC SGEKGWLPPE
LFNCTTISFV DLRAMNEKLS RNETQVDGAR ALQLVRALRS ATQHTGTLFG
NDVRTAYQLL GHVLQHESWQ QGFDLAATQD ADFHEDVIHS GSALLAPATR
AAWEQIQRSE GGTAQLLRRL EGYFSNVARN VRRTYLRPFV IVTANMILAV
DIFDKFNFTG ARVPRFDTIH EEFPRELESS VSFPADFFRP PEEKEGPLLR
PAGRRTTPQT TRPGPGTERE APISRRRRHP DDAGQFAVAL VIIYRTLGQL
LPERYDPDRR SLRLPHRPII NTPMVSTLVY SEGAPLPRPL ERPVLVEFAL
LEVEERTKPV CVFWNHSLAV GGTGGWSARG CELLSRNRTH VACQCSHTAS
FAVLMDISRR ENGEVLPLKI VTYAAVSLSL AALLVAFVLL SLVRMLRSNL
HSIHKHLAVA LFLSQLVFVI GINQTENPFL CTVVAILLHY IYMSTFAWTL
VESLHVYRML TEVRNIDTGP MRFYYVVGWG IPAIVTGLAV GLDPQGYGNP
DFCWLSLQDT LIWSFAGPIG AVIIINTVTS VLSAKVSCQR KHHYYGKKGI
VSLLRTAFLL LLLISATWLL GLLAVNRDAL SFHYLFAIFS GLQGPFVLLF
HCVLNQEVRK HLKGVLGGRK LHLEDSATTR ATLLTRSLNC NTTFGDGPDM
LRTDLGESTA SLDSIVRDEG IQKLGVSSGL VRGSHGEPDA SLMPRSCKDP
PGHDSDSDSE LSLDEQSSSY ASSHSSDSED DGVGAEEKWD PARGAVHSTP
KGDAVANHVP AGWPDQSLAE SDSEDPSGKP RLKVETKVSV ELHREEQGSH
RGEYPPDQES GGAARLASSQ PPEQRKGILK NKVTYPPPLT LTEQTLKGRL
REKLADCEQS PTSSRTSSLG SGGPDCAITV KSPGREPGRD HLNGVAMNVR
TGSAQADGSD SEKP

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, білків розвитку, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

  • Wu Q., Maniatis T. (2000). Large exons encoding multiple ectodomains are a characteristic feature of protocadherin genes. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 97: 3124—3129. PMID 10716726 doi:10.1073/pnas.97.7.3124
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1850 (англ.) . Архів оригіналу за 17 жовтня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-10-17 у Wayback Machine.]
  4. UniProt, Q9NYQ6 (англ.) . Архів оригіналу за 12 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також