EIF3C

EIF3C
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3J8B, 3J8C
Ідентифікатори
Символи	EIF3C, EIF3CL, EIF3S8, eIF3-p110, eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C
Зовнішні ІД	OMIM: 603916 MGI: 1926966 HomoloGene: 2781 GeneCards: EIF3C
Онтологія гена
Молекулярна функція	• translation initiation factor binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • translation initiation factor activity; • RNA binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • eukaryotic translation initiation factor 3 complex; • eukaryotic 43S preinitiation complex; • eukaryotic 48S preinitiation complex;
Біологічний процес	• translational initiation; • Біосинтез білків; • positive regulation of translation; • positive regulation of mRNA binding; • formation of cytoplasmic translation initiation complex; • cytoplasmic translational initiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	8663
	56347
	ENSG00000184110
	ENSMUSG00000030738
	Q99613
	Q8R1B4
	NM_003752; NM_001037808; NM_001199142; NM_001267574; NM_001286478
	NM_146200
	NP_001032897; NP_001186071; NP_001254503; NP_001273407; NP_003743
	NP_666312
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EIF3C (англ. Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 913 амінокислот, а молекулярна маса — 105 344^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSRFFTTGSD	SESESSLSGE	ELVTKPVGGN	YGKQPLLLSE	DEEDTKRVVR
SAKDKRFEEL	TNLIRTIRNA	MKIRDVTKCL	EEFELLGKAY	GKAKSIVDKE
GVPRFYIRIL	ADLEDYLNEL	WEDKEGKKKM	NKNNAKALST	LRQKIRKYNR
DFESHITSYK	QNPEQSADED	AEKNEEDSEG	SSDEDEDEDG	VSAATFLKKK
SEAPSGESRK	FLKKMDDEDE	DSEDSEDDED	WDTGSTSSDS	DSEEEEGKQT
ALASRFLKKA	PTTDEDKKAA	EKKREDKAKK	KHDRKSKRLD	EEEEDNEGGE
WERVRGGVPL	VKEKPKMFAK	GTEITHAVVI	KKLNEILQAR	GKKGTDRAAQ
IELLQLLVQI	AAENNLGEGV	IVKIKFNIIA	SLYDYNPNLA	TYMKPEMWGK
CLDCINELMD	ILFANPNIFV	GENILEESEN	LHNADQPLRV	RGCILTLVER
MDEEFTKIMQ	NTDPHSQEYV	EHLKDEAQVC	AIIERVQRYL	EEKGTTEEVC
RIYLLRILHT	YYKFDYKAHQ	RQLTPPEGSS	KSEQDQAENE	GEDSAVLMER
LCKYIYAKDR	TDRIRTCAIL	CHIYHHALHS	RWYQARDLML	MSHLQDNIQH
ADPPVQILYN	RTMVQLGICA	FRQGLTKDAH	NALLDIQSSG	RAKELLGQGL
LLRSLQERNQ	EQEKVERRRQ	VPFHLHINLE	LLECVYLVSA	MLLEIPYMAA
HESDARRRMI	SKQFHHQLRV	GERQPLLGPP	ESMREHVVAA	SKAMKMGDWK
TCHSFIINEK	MNGKVWDLFP	EADKVRTMLV	RKIQEESLRT	YLFTYSSVYD
SISMETLSDM	FELDLPTVHS	IISKMIINEE	LMASLDQPTQ	TVVMHRTEPT
AQQNLALQLA	EKLGSLVENN	ERVFDHKQGT	YGGYFRDQKD	GYRKNEGYMR
RGGYRQQQSQ	TAY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до факторів ініціації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Asano K., Kinzy T.G., Merrick W.C., Hershey J.W.B. (1997). Conservation and diversity of eukaryotic translation initiation factor eIF3. J. Biol. Chem. 272: 1101—1109. PMID 8995409 doi:10.1074/jbc.272.28.17668
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Mayeur G.L., Fraser C.S., Peiretti F., Block K.L., Hershey J.W.B. (2003). Characterization of eIF3k: a newly discovered subunit of mammalian translation initiation factor eIF3. Eur. J. Biochem. 270: 4133—4139. PMID 14519125 doi:10.1046/j.1432-1033.2003.03807.x
Holz M.K., Ballif B.A., Gygi S.P., Blenis J. (2005). mTOR and S6K1 mediate assembly of the translation preinitiation complex through dynamic protein interchange and ordered phosphorylation events. Cell. 123: 569—580. PMID 16286006 doi:10.1016/j.cell.2005.10.024
Kolupaeva V.G., Unbehaun A., Lomakin I.B., Hellen C.U.T., Pestova T.V. (2005). Binding of eukaryotic initiation factor 3 to ribosomal 40S subunits and its role in ribosomal dissociation and anti-association. RNA. 11: 470—486. PMID 15703437 doi:10.1261/rna.7215305
Terenzi F., Pal S., Sen G.C. (2005). Induction and mode of action of the viral stress-inducible murine proteins, P56 and P54. Virology. 340: 116—124. PMID 16023166 doi:10.1016/j.virol.2005.06.011

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3279 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-06-18 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q99613 (англ.) . Архів оригіналу за 5 листопада 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3279 (англ.) . Архів оригіналу за 18 червня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-06-18 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q99613 (англ.) . Архів оригіналу за 5 листопада 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]