EIF4A3

EIF4A3
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2HXY, 2HYI, 2J0Q, 2J0S, 2J0U, 2XB2, 3EX7, 4C9B
Ідентифікатори
Символи	EIF4A3, DDX48, MUK34, NMP265, NUK34, RCPS, eIF4AIII, eukaryotic translation initiation factor 4A3, Fal1, eIF4A-III, eIF-4A-III
Зовнішні ІД	OMIM: 608546 MGI: 1923731 HomoloGene: 5602 GeneCards: EIF4A3
Пов'язані генетичні захворювання
	Richieri Costa-Pereira syndrome
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • selenocysteine insertion sequence binding; • GO:0008026 helicase activity; • poly(A) binding; • RNA stem-loop binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • ribonucleoprotein complex binding; • hydrolase activity; • ATP binding; • mRNA binding; • RNA binding; • translation regulator activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • nuclear speck; • catalytic step 2 spliceosome; • мембрана; • exon-exon junction complex; • soma; • дендрит (нейробіологія); • spliceosomal complex; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • ядерце; • glutamatergic synapse; • postsynaptic cytosol; • Рибонуклеопротеїни; • U2-type catalytic step 1 spliceosome;
Біологічний процес	• nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening; • mRNA transport; • negative regulation of translation; • associative learning; • GO:1904578 response to organic cyclic compound; • regulation of mRNA binding; • mRNA processing; • positive regulation of translation; • negative regulation of gene expression; • negative regulation of excitatory postsynaptic potential; • cellular response to brain-derived neurotrophic factor stimulus; • cellular response to selenite ion; • exploration behavior; • RNA secondary structure unwinding; • Сплайсинг РНК; • rRNA processing; • embryonic cranial skeleton morphogenesis; • negative regulation of selenocysteine insertion sequence binding; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; • regulation of translation; • negative regulation of selenocysteine incorporation; • mRNA splicing, via spliceosome; • RNA export from nucleus; • termination of RNA polymerase II transcription; • mRNA export from nucleus; • mRNA 3'-end processing; • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II; • positive regulation of mRNA splicing, via spliceosome; • GO:0015915 транспорт; • regulation of translation at postsynapse, modulating synaptic transmission;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	9775
	192170
	ENSG00000141543
	ENSMUSG00000025580
	P38919
	Q91VC3
	NM_014740
	NM_138669
	NP_055555
	NP_619610
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EIF4A3 (англ. Eukaryotic translation initiation factor 4A3) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 411 амінокислот, а молекулярна маса — 46 871^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATTATMATS	GSARKRLLKE	EDMTKVEFET	SEEVDVTPTF	DTMGLREDLL
RGIYAYGFEK	PSAIQQRAIK	QIIKGRDVIA	QSQSGTGKTA	TFSISVLQCL
DIQVRETQAL	ILAPTRELAV	QIQKGLLALG	DYMNVQCHAC	IGGTNVGEDI
RKLDYGQHVV	AGTPGRVFDM	IRRRSLRTRA	IKMLVLDEAD	EMLNKGFKEQ
IYDVYRYLPP	ATQVVLISAT	LPHEILEMTN	KFMTDPIRIL	VKRDELTLEG
IKQFFVAVER	EEWKFDTLCD	LYDTLTITQA	VIFCNTKRKV	DWLTEKMREA
NFTVSSMHGD	MPQKERESIM	KEFRSGASRV	LISTDVWARG	LDVPQVSLII
NYDLPNNREL	YIHRIGRSGR	YGRKGVAINF	VKNDDIRILR	DIEQYYSTQI
DEMPMNVADL	I

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ. Задіяний у таких біологічних процесах як регуляція трансляції, процесінг мРНК, сплайсінг мРНК, транспорт, процесинг рРНК, транспорт мРНК. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Jurica M.S., Licklider L.J., Gygi S.P., Grigorieff N., Moore M.J. (2002). Purification and characterization of native spliceosomes suitable for three-dimensional structural analysis. RNA. 8: 426—439. PMID 11991638 doi:10.1017/S1355838202021088
Shibuya T., Tange T.O., Sonenberg N., Moore M.J. (2004). eIF4AIII binds spliced mRNA in the exon junction complex and is essential for nonsense-mediated decay. Nat. Struct. Mol. Biol. 11: 346—351. PMID 15034551 doi:10.1038/nsmb750
Simmons H.M., Ruis B.L., Kapoor M., Hudacek A.W., Conklin K.F. (2005). Identification of NOM1, a nucleolar, eIF4A binding protein encoded within the chromosome 7q36 breakpoint region targeted in cases of pediatric acute myeloid leukemia. Gene. 347: 137—145. PMID 15715967 doi:10.1016/j.gene.2004.12.027
Tange T.O., Shibuya T., Jurica M.S., Moore M.J. (2005). Biochemical analysis of the EJC reveals two new factors and a stable tetrameric protein core. RNA. 11: 1869—1883. PMID 16314458 doi:10.1261/rna.2155905
Shibuya T., Tange T.O., Stroupe M.E., Moore M.J. (2006). Mutational analysis of human eIF4AIII identifies regions necessary for exon junction complex formation and nonsense-mediated mRNA decay. RNA. 12: 360—374. PMID 16495234 doi:10.1261/rna.2190706

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з EIF4A3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18683 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 28 лютого 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P38919 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2017. Процитовано 28 лютого 2017.

Див. також

Хромосома 17

[1] Захворювання, генетично пов'язані з EIF4A3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18683 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 28 лютого 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, P38919 (англ.) . Архів оригіналу за 24 березня 2017. Процитовано 28 лютого 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]