RPS18

RPS18
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4UG0, 4V6X, 5A2Q, 5AJ0, 4KZY, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4D5L, 4V5Z, 5FLX, 4UJD, 3J7P, 4KZZ, 4UJE, 4UJC
Ідентифікатори
Символи	RPS18, D6S218E, HKE3, KE-3, KE3, S18, ribosomal protein S18
Зовнішні ІД	OMIM: 180473 MGI: 98146 HomoloGene: 88764 GeneCards: RPS18
Онтологія гена
Молекулярна функція	• rRNA binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • RNA binding; • structural constituent of ribosome; • protein kinase binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • рибосома; • мембрана; • focal adhesion; • внутрішньоклітинний; • small ribosomal subunit; • екзосома; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • гіалоплазма; • cytosolic small ribosomal subunit; • GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення; • синапс;
Біологічний процес	• viral transcription; • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane; • translational initiation; • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay; • Біосинтез білків; • ribosome biogenesis; • rRNA processing;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	6222
	20084
ENSG00000226225; ENSG00000096150; ENSG00000231500; ENSG00000235650; ENSG00000223367;
	ENSG00000227794
	ENSMUSG00000008668
	P62269
	P62270
	NM_022551
	NM_011296; NM_138946
	NP_072045
	NP_035426
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

RPS18 (англ. Ribosomal protein S18) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 152 амінокислот, а молекулярна маса — 17 719^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSLVIPEKFQ	HILRVLNTNI	DGRRKIAFAI	TAIKGVGRRY	AHVVLRKADI
DLTKRAGELT	EDEVERVITI	MQNPRQYKIP	DWFLNRQKDV	KDGKYSQVLA
NGLDNKLRED	LERLKKIRAH	RGLRHFWGLR	VRGQHTKTTG	RRGRTVGVSK
KK

A: Аланін

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків. Задіяний у такому біологічному процесі, як ацетилювання. Білок має сайт для зв'язування з РНК, рРНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

Chassin D., Bellet D., Koman A. (1993). The human homolog of ribosomal protein S18. Nucleic Acids Res. 21: 745—745. PMID 8441687 doi:10.1093/nar/21.3.745
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10401 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P62269 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:10401 (англ.) . Процитовано 6 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-4] UniProt, P62269 (англ.) . Архів оригіналу за 26 серпня 2017. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]