EIF3F

EIF3F
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3J8B, 3J8C
Ідентифікатори
Символи	EIF3F, EIF3S5, eIF3-p47, eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F, MRT67
Зовнішні ІД	OMIM: 603914 MGI: 1913335 HomoloGene: 2783 GeneCards: EIF3F
шифр КФ	3.4.19.12
Пов'язані генетичні захворювання
	депресія клінічна
Онтологія гена
Молекулярна функція	• cysteine-type peptidase activity; • translation initiation factor activity; • thiol-dependent deubiquitinase; • GO:0070122 peptidase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • hydrolase activity; • translation initiation factor binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • eukaryotic translation initiation factor 3 complex; • мембрана; • eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m; • eukaryotic 43S preinitiation complex; • eukaryotic 48S preinitiation complex;
Біологічний процес	• протеоліз; • translational initiation; • Біосинтез білків; • IRES-dependent viral translational initiation; • protein deubiquitination; • formation of cytoplasmic translation initiation complex; • cytoplasmic translational initiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	8665
	66085
	ENSG00000175390
	ENSMUSG00000031029
	O00303
	Q9DCH4
	NM_003754
	NM_025344
	NP_003745
	NP_079620
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EIF3F (англ. Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit F) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 357 амінокислот, а молекулярна маса — 37 564^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MATPAVPVSA	PPATPTPVPA	AAPASVPAPT	PAPAAAPVPA	AAPASSSDPA
AAAAATAAPG	QTPASAQAPA	QTPAPALPGP	ALPGPFPGGR	VVRLHPVILA
SIVDSYERRN	EGAARVIGTL	LGTVDKHSVE	VTNCFSVPHN	ESEDEVAVDM
EFAKNMYELH	KKVSPNELIL	GWYATGHDIT	EHSVLIHEYY	SREAPNPIHL
TVDTSLQNGR	MSIKAYVSTL	MGVPGRTMGV	MFTPLTVKYA	YYDTERIGVD
LIMKTCFSPN	RVIGLSSDLQ	QVGGASARIQ	DALSTVLQYA	EDVLSGKVSA
DNTVGRFLMS	LVNQVPKIVP	DDFETMLNSN	INDLLMVTYL	ANLTQSQIAL
NEKLVNL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, протеаз, факторів ініціації, тіолових протеаз. Задіяний у таких біологічних процесах як біосинтез білка, убіквітинування білків. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Holz M.K., Ballif B.A., Gygi S.P., Blenis J. (2005). mTOR and S6K1 mediate assembly of the translation preinitiation complex through dynamic protein interchange and ordered phosphorylation events. Cell. 123: 569—580. PMID 16286006 doi:10.1016/j.cell.2005.10.024
Kolupaeva V.G., Unbehaun A., Lomakin I.B., Hellen C.U.T., Pestova T.V. (2005). Binding of eukaryotic initiation factor 3 to ribosomal 40S subunits and its role in ribosomal dissociation and anti-association. RNA. 11: 470—486. PMID 15703437 doi:10.1261/rna.7215305
Masutani M., Sonenberg N., Yokoyama S., Imataka H. (2007). Reconstitution reveals the functional core of mammalian eIF3. EMBO J. 26: 3373—3383. PMID 17581632 doi:10.1038/sj.emboj.7601765
Lee A.S., Kranzusch P.J., Cate J.H. (2015). eIF3 targets cell-proliferation messenger RNAs for translational activation or repression. Nature. 522: 111—114. PMID 25849773 doi:10.1038/nature14267
Lee A.S., Kranzusch P.J., Doudna J.A., Cate J.H. (2016). eIF3d is an mRNA cap-binding protein that is required for specialized translation initiation. Nature. 536: 96—99. PMID 27462815 doi:10.1038/nature18954

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з EIF3F переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3275 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 21 серпня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, O00303 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 11

[1] Захворювання, генетично пов'язані з EIF3F переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3275 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 21 серпня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, O00303 (англ.) . Архів оригіналу за 27 вересня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]