EIF3L

EIF3L
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3J8B, 3J8C
Ідентифікатори
Символи	EIF3L, EIF3EIP, EIF3S11, EIF3S6IP, HSPC021, HSPC025, MSTP005, eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L
Зовнішні ІД	MGI: 2386251 HomoloGene: 9380 GeneCards: EIF3L
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • translation initiation factor activity; • RNA binding;
Клітинна компонента	• ядерце; • мембрана; • fibrillar center; • гіалоплазма; • нуклеоплазма; • цитоплазма; • eukaryotic translation initiation factor 3 complex; • eukaryotic 43S preinitiation complex; • eukaryotic 48S preinitiation complex;
Біологічний процес	• translational initiation; • viral translational termination-reinitiation; • Біосинтез білків; • formation of cytoplasmic translation initiation complex; • cytoplasmic translational initiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	51386
	223691
	ENSG00000100129
	ENSMUSG00000033047
	Q9Y262
	Q8QZY1
	NM_001242923; NM_016091; NM_001363785
	NM_145139
	NP_001229852; NP_057175; NP_001350714
	NP_660121
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EIF3L (англ. Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit L) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 564 амінокислот, а молекулярна маса — 66 727^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSYPADDYES	EAAYDPYAYP	SDYDMHTGDP	KQDLAYERQY	EQQTYQVIPE
VIKNFIQYFH	KTVSDLIDQK	VYELQASRVS	SDVIDQKVYE	IQDIYENSWT
KLTERFFKNT	PWPEAEAIAP	QVGNDAVFLI	LYKELYYRHI	YAKVSGGPSL
EQRFESYYNY	CNLFNYILNA	DGPAPLELPN	QWLWDIIDEF	IYQFQSFSQY
RCKTAKKSEE	EIDFLRSNPK	IWNVHSVLNV	LHSLVDKSNI	NRQLEVYTSG
GDPESVAGEY	GRHSLYKMLG	YFSLVGLLRL	HSLLGDYYQA	IKVLENIELN
KKSMYSRVPE	CQVTTYYYVG	FAYLMMRRYQ	DAIRVFANIL	LYIQRTKSMF
QRTTYKYEMI	NKQNEQMHAL	LAIALTMYPM	RIDESIHLQL	REKYGDKMLR
MQKGDPQVYE	ELFSYSCPKF	LSPVVPNYDN	VHPNYHKEPF	LQQLKVFSDE
VQQQAQLSTI	RSFLKLYTTM	PVAKLAGFLD	LTEQEFRIQL	LVFKHKMKNL
VWTSGISALD	GEFQSASEVD	FYIDKDMIHI	ADTKVARRYG	DFFIRQIHKF
EELNRTLKKM	GQRP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до факторів ініціації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Morris-Desbois C., Rety S., Ferro M., Garin J., Jalinot P. (2001). The human protein HSPC021 interacts with Int-6 and is associated with eukaryotic translation initiation factor 3. J. Biol. Chem. 276: 45988—45995. PMID 11590142 doi:10.1074/jbc.M104966200
Yuan X., Zhao J., Zentgraf H., Hoffmann-Rohrer U., Grummt I. (2002). Multiple interactions between RNA polymerase I, TIF-IA and TAF(I) subunits regulate preinitiation complex assembly at the ribosomal gene promoter. EMBO Rep. 3: 1082—1087. PMID 12393749 doi:10.1093/embo-reports/kvf212
Kolupaeva V.G., Unbehaun A., Lomakin I.B., Hellen C.U.T., Pestova T.V. (2005). Binding of eukaryotic initiation factor 3 to ribosomal 40S subunits and its role in ribosomal dissociation and anti-association. RNA. 11: 470—486. PMID 15703437 doi:10.1261/rna.7215305
Masutani M., Sonenberg N., Yokoyama S., Imataka H. (2007). Reconstitution reveals the functional core of mammalian eIF3. EMBO J. 26: 3373—3383. PMID 17581632 doi:10.1038/sj.emboj.7601765
Poyry T.A., Kaminski A., Connell E.J., Fraser C.S., Jackson R.J. (2007). The mechanism of an exceptional case of reinitiation after translation of a long ORF reveals why such events do not generally occur in mammalian mRNA translation. Genes Dev. 21: 3149—3162. PMID 18056426 doi:10.1101/gad.439507

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18138 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9Y262 (англ.) . Архів оригіналу за 9 березня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 22

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18138 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9Y262 (англ.) . Архів оригіналу за 9 березня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]