EIF4A2

EIF4A2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	3BOR
Ідентифікатори
Символи	EIF4A2, BM-010, DDX2B, EIF4A, EIF4F, eIF-4A-II, eIF4A-II, eukaryotic translation initiation factor 4A2
Зовнішні ІД	OMIM: 601102 MGI: 106906 HomoloGene: 1487 GeneCards: EIF4A2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • translation initiation factor activity; • GO:0008026 helicase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • hydrolase activity; • ATP binding; • ATPase activity; • RNA binding;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • perinuclear region of cytoplasm; • eukaryotic translation initiation factor 4F complex; • ядерце;
Біологічний процес	• nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening; • RNA secondary structure unwinding; • GO:0022415 viral process; • negative regulation of RNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity; • Біосинтез білків; • regulation of translational initiation; • translational initiation; • cellular response to leukemia inhibitory factor;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1974
	13682
	ENSG00000156976
	ENSMUSG00000022884
	Q14240
	P10630
	NM_001967
	NM_001123037; NM_001123038; NM_013506; NM_001347179
	NP_001958
	NP_001116509; NP_001116510; NP_001334108; NP_038534
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EIF4A2 (англ. Eukaryotic translation initiation factor 4A2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 3-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 407 амінокислот, а молекулярна маса — 46 402^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSGGSADYNR	EHGGPEGMDP	DGVIESNWNE	IVDNFDDMNL	KESLLRGIYA
YGFEKPSAIQ	QRAIIPCIKG	YDVIAQAQSG	TGKTATFAIS	ILQQLEIEFK
ETQALVLAPT	RELAQQIQKV	ILALGDYMGA	TCHACIGGTN	VRNEMQKLQA
EAPHIVVGTP	GRVFDMLNRR	YLSPKWIKMF	VLDEADEMLS	RGFKDQIYEI
FQKLNTSIQV	VLLSATMPTD	VLEVTKKFMR	DPIRILVKKE	ELTLEGIKQF
YINVEREEWK	LDTLCDLYET	LTITQAVIFL	NTRRKVDWLT	EKMHARDFTV
SALHGDMDQK	ERDVIMREFR	SGSSRVLITT	DLLARGIDVQ	QVSLVINYDL
PTNRENYIHR	IGRGGRFGRK	GVAINFVTEE	DKRILRDIET	FYNTTVEEMP
MNVADLI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до гідролаз, геліказ, факторів ініціації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, біосинтез білка, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, РНК.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Li W., Belsham G.J., Proud C.G. (2001). Eukaryotic initiation factors 4A (eIF4A) and 4G (eIF4G) mutually interact in a 1:1 ratio in vivo. J. Biol. Chem. 276: 29111—29115. PMID 11408474 doi:10.1074/jbc.C100284200
Simmons H.M., Ruis B.L., Kapoor M., Hudacek A.W., Conklin K.F. (2005). Identification of NOM1, a nucleolar, eIF4A binding protein encoded within the chromosome 7q36 breakpoint region targeted in cases of pediatric acute myeloid leukemia. Gene. 347: 137—145. PMID 15715967 doi:10.1016/j.gene.2004.12.027
Feng P., Everly D.N. Jr., Read G.S. (2005). mRNA decay during herpes simplex virus (HSV) infections: protein-protein interactions involving the HSV virion host shutoff protein and translation factors eIF4H and eIF4A. J. Virol. 79: 9651—9664. PMID 16014927 doi:10.1128/JVI.79.15.9651-9664.2005
Sudo K., Takahashi E., Nakamura Y. (1995). Isolation and mapping of the human EIF4A2 gene homologous to the murine protein synthesis initiation factor 4A-II gene Eif4a2. Cytogenet. Cell Genet. 71: 385—388. PMID 8521730

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3284 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2015-09-12 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q14240 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 3

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3284 (англ.) . Архів оригіналу за 12 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2015-09-12 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q14240 (англ.) . Архів оригіналу за 6 серпня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]