EIF4B

EIF4B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1WI8, 2J76
Ідентифікатори
Символи	EIF4B, EIF-4B, PRO1843, eukaryotic translation initiation factor 4B
Зовнішні ІД	OMIM: 603928 MGI: 95304 HomoloGene: 83162 GeneCards: EIF4B
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • nucleic acid binding; • ribosomal small subunit binding; • GO:0008026 helicase activity; • RNA strand-exchange activity; • RNA strand annealing activity; • RNA binding; • translation initiation factor activity;
Клітинна компонента	• гіалоплазма; • eukaryotic translation initiation factor 4F complex; • Полісома;
Біологічний процес	• nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening; • regulation of translational initiation; • formation of translation preinitiation complex; • eukaryotic translation initiation factor 4F complex assembly; • Біосинтез білків; • translational initiation; • cytoplasmic translation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	1975
	75705
	ENSG00000063046
	ENSMUSG00000058655
	P23588
	Q8BGD9
	NM_001300821; NM_001417; NM_018507; NM_001330654
	NM_145625
	NP_001287750; NP_001317583; NP_001408
	NP_663600
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EIF4B (англ. Eukaryotic translation initiation factor 4B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 611 амінокислот, а молекулярна маса — 69 151^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAASAKKKNK	KGKTISLTDF	LAEDGGTGGG	STYVSKPVSW	ADETDDLEGD
VSTTWHSNDD	DVYRAPPIDR	SILPTAPRAA	REPNIDRSRL	PKSPPYTAFL
GNLPYDVTEE	SIKEFFRGLN	ISAVRLPREP	SNPERLKGFG	YAEFEDLDSL
LSALSLNEES	LGNRRIRVDV	ADQAQDKDRD	DRSFGRDRNR	DSDKTDTDWR
ARPATDSFDD	YPPRRGDDSF	GDKYRDRYDS	DRYRDGYRDG	YRDGPRRDMD
RYGGRDRYDD	RGSRDYDRGY	DSRIGSGRRA	FGSGYRRDDD	YRGGGDRYED
RYDRRDDRSW	SSRDDYSRDD	YRRDDRGPPQ	RPKLNLKPRS	TPKEDDSSAS
TSQSTRAASI	FGGAKPVDTA	AREREVEERL	QKEQEKLQRQ	LDEPKLERRP
RERHPSWRSE	ETQERERSRT	GSESSQTGTS	TTSSRNARRR	ESEKSLENET
LNKEEDCHSP	TSKPPKPDQP	LKVMPAPPPK	ENAWVKRSSN	PPARSQSSDT
EQQSPTSGGG	KVAPAQPSEE	GPGRKDENKV	DGMNAPKGQT	GNSSRGPGDG
GNRDHWKESD	RKDGKKDQDS	RSAPEPKKPE	ENPASKFSSA	SKYAALSVDG
EDENEGEDYA	E

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до факторів ініціації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Methot N., Pause A., Hershey J.W., Sonenberg N. (1994). The translation initiation factor eIF-4B contains an RNA-binding region that is distinct and independent from its ribonucleoprotein consensus sequence. Mol. Cell. Biol. 14: 2307—2316. PMID 8139536 doi:10.1128/MCB.14.4.2307
Methot N., Song M.S., Sonenberg N. (1996). A region rich in aspartic acid, arginine, tyrosine, and glycine (DRYG) mediates eukaryotic initiation factor 4B (eIF4B) self-association and interaction with eIF3. Mol. Cell. Biol. 16: 5328—5334. PMID 8816444 doi:10.1128/MCB.16.10.5328
Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240
Milburn S.C., Hershey J.W.B., Davies M.V., Kelleher K., Kaufman R.J. (1990). Cloning and expression of eukaryotic initiation factor 4B cDNA: sequence determination identifies a common RNA recognition motif. EMBO J. 9: 2783—2790. PMID 2390971

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3285 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P23588 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3285 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P23588 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]