EIF3D

EIF3D
Ідентифікатори
Символи	EIF3D, EIF3S7, eIF3-p66, eIF3-zeta, eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D
Зовнішні ІД	OMIM: 603915 MGI: 1933181 HomoloGene: 2782 GeneCards: EIF3D
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • translation initiation factor activity; • RNA binding; • mRNA cap binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • гіалоплазма; • eukaryotic translation initiation factor 3 complex, eIF3m; • мембрана; • eukaryotic translation initiation factor 3 complex; • eukaryotic 43S preinitiation complex; • eukaryotic 48S preinitiation complex;
Біологічний процес	• formation of cytoplasmic translation initiation complex; • viral translational termination-reinitiation; • translational initiation; • Біосинтез білків; • IRES-dependent viral translational initiation; • cap-dependent translational initiation; • positive regulation of translation; • positive regulation of mRNA binding; • cytoplasmic translational initiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	8664
	55944
	ENSG00000100353
	ENSMUSG00000016554
	O15371
	O70194
	NM_003753
	NM_018749
	NP_003744
	NP_061219
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EIF3D (англ. Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 22-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 548 амінокислот, а молекулярна маса — 63 973^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAKFMTPVIQ	DNPSGWGPCA	VPEQFRDMPY	QPFSKGDRLG	KVADWTGATY
QDKRYTNKYS	SQFGGGSQYA	YFHEEDESSF	QLVDTARTQK	TAYQRNRMRF
AQRNLRRDKD	RRNMLQFNLQ	ILPKSAKQKE	RERIRLQKKF	QKQFGVRQKW
DQKSQKPRDS	SVEVRSDWEV	KEEMDFPQLM	KMRYLEVSEP	QDIECCGALE
YYDKAFDRIT	TRSEKPLRSI	KRIFHTVTTT	DDPVIRKLAK	TQGNVFATDA
ILATLMSCTR	SVYSWDIVVQ	RVGSKLFFDK	RDNSDFDLLT	VSETANEPPQ
DEGNSFNSPR	NLAMEATYIN	HNFSQQCLRM	GKERYNFPNP	NPFVEDDMDK
NEIASVAYRY	RRWKLGDDID	LIVRCEHDGV	MTGANGEVSF	INIKTLNEWD
SRHCNGVDWR	QKLDSQRGAV	IATELKNNSY	KLARWTCCAL	LAGSEYLKLG
YVSRYHVKDS	SRHVILGTQQ	FKPNEFASQI	NLSVENAWGI	LRCVIDICMK
LEEGKYLILK	DPNKQVIRVY	SLPDGTFSSD	EDEEEEEEEE	EEEEEEET

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до факторів ініціації, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як біосинтез білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з РНК. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Daughenbaugh K.F., Fraser C.S., Hershey J.W., Hardy M.E. (2003). The genome-linked protein VPg of the Norwalk virus binds eIF3, suggesting its role in translation initiation complex recruitment. EMBO J. 22: 2852—2859. PMID 12773399 doi:10.1093/emboj/cdg251
Kolupaeva V.G., Unbehaun A., Lomakin I.B., Hellen C.U.T., Pestova T.V. (2005). Binding of eukaryotic initiation factor 3 to ribosomal 40S subunits and its role in ribosomal dissociation and anti-association. RNA. 11: 470—486. PMID 15703437 doi:10.1261/rna.7215305
Masutani M., Sonenberg N., Yokoyama S., Imataka H. (2007). Reconstitution reveals the functional core of mammalian eIF3. EMBO J. 26: 3373—3383. PMID 17581632 doi:10.1038/sj.emboj.7601765
Poyry T.A., Kaminski A., Connell E.J., Fraser C.S., Jackson R.J. (2007). The mechanism of an exceptional case of reinitiation after translation of a long ORF reveals why such events do not generally occur in mammalian mRNA translation. Genes Dev. 21: 3149—3162. PMID 18056426 doi:10.1101/gad.439507
Yu X., Zheng B., Chai R. (2014). Lentivirus-mediated knockdown of eukaryotic translation initiation factor 3 subunit D inhibits proliferation of HCT116 colon cancer cells. Biosci. Rep. 34: E00161—E00161. PMID 25370813 doi:10.1042/BSR20140078

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3278 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, O15371 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 22

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:3278 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, O15371 (англ.) . Архів оригіналу за 22 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]