EIF6

EIF6
Ідентифікатори
Символи	EIF6, CAB, EIF3A, ITGB4BP, b(2)gcn, eIF-6, p27(BBP), p27BBP, eukaryotic translation initiation factor 6
Зовнішні ІД	OMIM: 602912 MGI: 1196288 HomoloGene: 7135 GeneCards: EIF6
Онтологія гена
Молекулярна функція	• ribosome binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • translation initiation factor activity; • ribosomal large subunit binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • екзосома; • клітинне ядро; • нуклеоплазма; • ядерце; • гіалоплазма; • preribosome, large subunit precursor; • lamin filament; • Проміжні філаменти;
Біологічний процес	• translational initiation; • mature ribosome assembly; • Біосинтез білків; • ribosome biogenesis; • response to insulin; • maturation of LSU-rRNA; • gene silencing by miRNA; • regulation of glycolytic process; • assembly of large subunit precursor of preribosome; • maturation of 5.8S rRNA; • regulation of fatty acid biosynthetic process; • GO:1904489 regulation of reactive oxygen species metabolic process; • positive regulation of translation; • regulation of megakaryocyte differentiation; • miRNA-mediated gene silencing by inhibition of translation; • ribosomal subunit export from nucleus; • ribosomal large subunit biogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3692
	16418
	ENSG00000242372
	ENSMUSG00000027613
	P56537
	O55135
NM_001267810; NM_002212; NM_181466; NM_181467; NM_181468;
	NM_181469
	NM_010579
	NP_001254739; NP_002203; NP_852131; NP_852133
	NP_034709
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

EIF6 (англ. Eukaryotic translation initiation factor 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 245 амінокислот, а молекулярна маса — 26 599^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAVRASFENN	CEIGCFAKLT	NTYCLVAIGG	SENFYSVFEG	ELSDTIPVVH
ASIAGCRIIG	RMCVGNRHGL	LVPNNTTDQE	LQHIRNSLPD	TVQIRRVEER
LSALGNVTTC	NDYVALVHPD	LDRETEEILA	DVLKVEVFRQ	TVADQVLVGS
YCVFSNQGGL	VHPKTSIEDQ	DELSSLLQVP	LVAGTVNRGS	EVIAAGMVVN
DWCAFCGLDT	TSTELSVVES	VFKLNEAQPS	TIATSMRDSL	IDSLT

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до факторів ініціації. Задіяний у таких біологічних процесах як біосинтез білка, біогенез рибосом. Локалізований у цитоплазмі, ядрі.

Література

Si K., Chaudhuri J., Chevesich J., Maitra U. (1997). Molecular cloning and functional expression of a human cDNA encoding translation initiation factor 6. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 94: 14285—14290. PMID 9405604 doi:10.1073/pnas.94.26.14285
Donadini A., Giodini A., Sanvito F., Marchisio P.C., Biffo S. (2001). The human ITGB4BP gene is constitutively expressed in vitro, but highly modulated in vivo. Gene. 266: 35—43. PMID 11290417 doi:10.1016/S0378-1119(01)00370-5
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Basu U., Si K., Deng H., Maitra U. (2003). Phosphorylation of mammalian eukaryotic translation initiation factor 6 and its Saccharomyces cerevisiae homologue Tif6p: evidence that phosphorylation of Tif6p regulates its nucleocytoplasmic distribution and is required for yeast cell growth. Mol. Cell. Biol. 23: 6187—6199. PMID 12917340 doi:10.1128/MCB.23.17.6187-6199.2003

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6159 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 21 серпня 2017. [Архівовано 2017-10-14 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P56537 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 20

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6159 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 21 серпня 2017. [Архівовано 2017-10-14 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P56537 (англ.) . Архів оригіналу за 17 вересня 2017. Процитовано 21 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]