| Рибосомний білок S27a
|
|---|
 |
| Наявні структури |
|---|
| PDB | Пошук ортологів: PDBe RCSB |
| Список кодів PDB |
|
2KTF, 2L0F, 2L0T, 2XK5, 3AXC, 3NHE, 3NOB, 3PHW, 3TBL, 4UG0, 4V6X, 5AJ0, 4R62, 5FLX, 4UJD, 4KZZ, 4UJC, 3J7P, 4KZY, 4D5L, 3J7R, 4D61, 4KZX, 4UJE, 5A2Q
| | |
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| RPS27A, CEP80, HEL112, S27A, UBA80, UBC, UBCEP1, UBCEP80, ribosomal protein S27a |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 191343 MGI: 1925544 HomoloGene: 37715 GeneCards: RPS27A
|
|---|
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• зв’язування з іоном металу • structural constituent of ribosome • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • RNA binding • protein tag • ubiquitin protein ligase binding
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • endocytic vesicle membrane • гіалоплазма • мембрана • клітинне ядро • рибосома • myelin sheath • cytosolic small ribosomal subunit • ядерце • екзосома • клітинна мембрана • нуклеоплазма • small ribosomal subunit • endosome membrane • міжклітинний простір • мітохондріальна зовнішня мембрана • endoplasmic reticulum quality control compartment • везикула • endoplasmic reticulum membrane • host cell
|
|---|
| Біологічний процес |
• DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest • negative regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • interstrand cross-link repair • nucleotide-excision repair, DNA damage recognition • positive regulation of canonical Wnt signaling pathway • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • regulation of type I interferon production • TRIF-dependent toll-like receptor signaling pathway • Fc-epsilon receptor signaling pathway • endosomal transport • global genome nucleotide-excision repair • NIK/NF-kappaB signaling • G2/M transition of mitotic cell cycle • stress-activated MAPK cascade • transforming growth factor beta receptor signaling pathway • macroautophagy • negative regulation of canonical Wnt signaling pathway • nucleotide-excision repair, DNA gap filling • viral transcription • error-free translesion synthesis • regulation of tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • stimulatory C-type lectin receptor signaling pathway • negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway • SRP-dependent cotranslational protein targeting to membrane • JNK cascade • regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia • nucleotide-excision repair, DNA incision • I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • вроджений імунітет • Сигнальний шлях Notch • regulation of mRNA stability • protein polyubiquitination • negative regulation of apoptotic process • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • virion assembly • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • anaphase-promoting complex-dependent catabolic process • negative regulation of type I interferon production • nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay • nucleotide-binding oligomerization domain containing signaling pathway • GO:0046795 intracellular transport of virus • GO:0019067 Життєвий цикл вірусу • MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway • error-prone translesion synthesis • MAPK cascade • fibroblast growth factor receptor signaling pathway • ion transmembrane transport • glycogen biosynthetic process • positive regulation of apoptotic process • translational initiation • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • translesion synthesis • transcription-coupled nucleotide-excision repair • T cell receptor signaling pathway • MyD88-independent toll-like receptor signaling pathway • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • regulation of signal transduction by p53 class mediator • positive regulation of epidermal growth factor receptor signaling pathway • Wnt • nucleotide-excision repair, DNA duplex unwinding • nucleotide-excision repair, DNA incision, 5'-to lesion • Біосинтез білків • rRNA processing • ERBB2 signaling pathway • Wnt signaling pathway, planar cell polarity pathway • nucleotide-excision repair, preincision complex assembly • proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process • згортання білків • negative regulation of G2/M transition of mitotic cell cycle • Убіквітин-залежний протеоліз • protein deubiquitination • SCF-dependent proteasomal ubiquitin-dependent protein catabolic process • entry of bacterium into host cell • трансмембранний транспорт • regulation of necroptotic process • membrane organization • endoplasmic reticulum mannose trimming • cellular iron ion homeostasis • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • protein targeting to peroxisome • cytokine-mediated signaling pathway • modification-dependent protein catabolic process • interleukin-1-mediated signaling pathway
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 2: 55.23 – 55.24 Mb
| Хр. 11: 29.5 – 29.5 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[1]
| [2] |
|---|
| Вікідані |
|
Рибосомний білок S27a (англ. Ribosomal protein S27a) – білок, який кодується геном RPS27A, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми. [3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 156 амінокислот, а молекулярна маса — 17 965[4].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MQIFVKTLTG
|
|
KTITLEVEPS
|
|
DTIENVKAKI
|
|
QDKEGIPPDQ
|
|
QRLIFAGKQL
|
| EDGRTLSDYN
|
|
IQKESTLHLV
|
|
LRLRGGAKKR
|
|
KKKSYTTPKK
|
|
NKHKRKKVKL
|
| AVLKYYKVDE
|
|
NGKISRLRRE
|
|
CPSDECGAGV
|
|
FMASHFDRHY
|
|
CGKCCLTYCF
|
| NKPEDK
|
Цей білок за функціями належить до рибонуклеопротеїнів, рибосомних білків.
Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном цинку.
Локалізований у цитоплазмі, ядрі.
Література
- Adams S.M., Sharp M.G., Walker R.A., Brammar W.J., Varley J.M. (1992). Differential expression of translation-associated genes in benign and malignant human breast tumours. Br. J. Cancer. 65: 65—71. PMID 1370760 doi:10.1038/bjc.1992.12
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Schlesinger D.H., Goldstein G. (1975). Molecular conservation of 74 amino acid sequence of ubiquitin between cattle and man. Nature. 255: 423—424. PMID 1128706 doi:10.1038/255423a0
- Huang F., Kirkpatrick D., Jiang X., Gygi S.P., Sorkin A. (2006). Differential regulation of EGF receptor internalization and degradation by multiubiquitination within the kinase domain. Mol. Cell. 21: 737—748. PMID 16543144 doi:10.1016/j.molcel.2006.02.018
- Okumura F., Hatakeyama S., Matsumoto M., Kamura T., Nakayama K. (2004). Functional regulation of FEZ1 by the U-box-type ubiquitin ligase E4B contributes to neuritogenesis. J. Biol. Chem. 279: 53533—53543. PMID 15466860 doi:10.1074/jbc.M402916200
- Komander D. (2009). The emerging complexity of protein ubiquitination. Biochem. Soc. Trans. 37: 937—953. PMID 19754430 doi:10.1042/BST0370937
Примітки
Див. також
|
|---|
| Білки | | Фактори ініціації трансляції | | Фактори ініціації трансляції прокаріотів | |
|---|
| Фактори ініціації трансляції археїв | |
|---|
| Фактори ініціації трансляції еукаріотів | |
|---|
|
|---|
| Фактори елонгації трансляції | | Фактори елонгації трансляції прокаріотів | |
|---|
| Фактори елонгації трансляції археїв | |
|---|
| Фактори елонгації трансляції еукаріотів | |
|---|
|
|---|
| Фактори термінації трансляції |
- Фактори термінації трансляції прокаріотів
- Фактори термінації трансляції археїв
- Фактори термінації трансляції еукаріотів
|
|---|
| Рибосомні білки | | Цитоплазмові | | підрозділ 60S | |
|---|
| підрозділ 40S | |
|---|
|
|---|
| Мітохондріальні | | підрозділ 39S | |
|---|
| підрозділ 28S | |
|---|
|
|---|
|
|---|
|
|---|