SATB1

SATB1
بنى متوفرة
بنك بيانات البروتين	Ortholog search: PDBe RCSB
قائمة رموز معرفات بنك بيانات البروتين
	1YSE, 2L1P, 2O49, 2O4A, 3NZL, 3TUO, 2MW8
معرفات
أسماء بديلة	SATB1, SATB homeobox 1, DEFDA, KTZSL, DNA-binding protein /SATB2, /SATB2, IPR039673
معرفات خارجية	الوراثة المندلية البشرية عبر الإنترنت 602075 MGI: MGI:105084 HomoloGene: 2232 GeneCards: 6304
علم الوجود الجيني
وظائف جزيئية	• ربط دي إن إي; • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding; • GO:0001131، GO:0001151، GO:0001130، GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity; • chromatin binding; • GO:0001948، GO:0016582 ربط بروتيني; • GO:0001078، GO:0001214، GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific; • double-stranded DNA binding; • GO:0001200، GO:0001133، GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific; • sequence-specific DNA binding;
مكونات خلوية	• PML body; • مصفوفة نووية; • بلازم نووي; • كروماتين; • نواة; • نقاط نووية;
عمليات حيوية	• منعكس; • CD4-positive, alpha-beta T cell differentiation; • CD8-positive, alpha-beta T cell differentiation; • تغيير بنية الكروماتين; • activated T cell proliferation; • GO:0009373 ضبط نسخ الدنا; • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II; • GO:0031497، GO:0006336، GO:0034724، GO:0001301، GO:0007580، GO:0034652، GO:0010847 chromatin organization; • نسخ الدنا; • epidermis development; • مثيلة الهستونات; • GO:0022415 viral process; • T cell activation;
	المصادر:Amigo / QuickGO
نمط التعبير عن الحمض النووي الريبوزي
	المزيد من بيانات التعبير المرجعية
تماثلات متسلسلة
	Q01826; C9J3I0
	Q60611
	NM_001131010، NM_001195470، NM_002971، XM_011533988، XM_011533989، NM_001322871، NM_001322872، NM_001322873، NM_001322874، NM_001322875، NM_001322876، XM_047448683 XM_011533990، NM_001131010، NM_001195470، NM_002971، XM_011533988، XM_011533989، NM_001322871، NM_001322872، NM_001322873، NM_001322874، NM_001322875، NM_001322876، XM_047448683
	NM_001163631، NM_001163632، NM_009122، XM_006523924، XM_006523925، XM_006523926، XM_006523927، XM_017317366، NM_001357636، NM_001357637، NM_001357638، NM_001357640، XM_036160424 NM_001163630، NM_001163631، NM_001163632، NM_009122، XM_006523924، XM_006523925، XM_006523926، XM_006523927، XM_017317366، NM_001357636، NM_001357637، NM_001357638، NM_001357640، XM_036160424
	NP_001182399، NP_001309800، NP_001309801، NP_001309802، NP_001309803، NP_001309804، NP_001309805، NP_002962، XP_011532290، XP_011532291، XP_011532292 NP_001124482، NP_001182399، NP_001309800، NP_001309801، NP_001309802، NP_001309803، NP_001309804، NP_001309805، NP_002962، XP_011532290، XP_011532291، XP_011532292
	NP_001157103، NP_001157104، NP_033148، XP_006523987، XP_006523988، XP_006523989، XP_006523990، XP_017172855، NP_001344565، NP_001344566، NP_001344567، NP_001344569، XP_036016317 NP_001157102، NP_001157103، NP_001157104، NP_033148، XP_006523987، XP_006523988، XP_006523989، XP_006523990، XP_017172855، NP_001344565، NP_001344566، NP_001344567، NP_001344569، XP_036016317
	ويكي بيانات
اعرض/عدّل إنسان	اعرض/عدّل فأر

SATB1‏ (SATB homeobox 1) هوَ بروتين يُشَفر بواسطة جين SATB1 في الإنسان.^[1]

الوظيفة

الأهمية السريرية

المراجع

^ "Entrez Gene: SATB1 SATB homeobox 1". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.

قراءة متعمقة

Dickinson LA، Joh T، Kohwi Y، Kohwi-Shigematsu T (أغسطس 1992). "A tissue-specific MAR/SAR DNA-binding protein with unusual binding site recognition". Cell. ج. 70 ع. 4: 631–45. DOI:10.1016/0092-8674(92)90432-C. PMID:1505028.
Robertson NG، Khetarpal U، Gutiérrez-Espeleta GA، Bieber FR، Morton CC (سبتمبر 1994). "Isolation of novel and known genes from a human fetal cochlear cDNA library using subtractive hybridization and differential screening". Genomics. ج. 23 ع. 1: 42–50. DOI:10.1006/geno.1994.1457. PMID:7829101.
Nakagomi K، Kohwi Y، Dickinson LA، Kohwi-Shigematsu T (مارس 1994). "A novel DNA-binding motif in the nuclear matrix attachment DNA-binding protein SATB1". Molecular and Cellular Biology. ج. 14 ع. 3: 1852–60. PMC:358543. PMID:8114718.
Xu L، Deng HX، Xia JH، Yang Y، Fan CH، Hung WY، Siddque T (1997). "Assignment of SATB1 to human chromosome band 3p23 by in situ hybridization". Cytogenetics and Cell Genetics. ج. 77 ع. 3–4: 205–6. DOI:10.1159/000134577. PMID:9284917.
Reddy PH، Stockburger E، Gillevet P، Tagle DA (ديسمبر 1997). "Mapping and characterization of novel (CAG)n repeat cDNAs from adult human brain derived by the oligo capture method". Genomics. ج. 46 ع. 2: 174–82. DOI:10.1006/geno.1997.5044. PMID:9417904.
Escalier D، Allenet B، Badrichani A، Garchon HJ (يناير 1999). "High level expression of the Xlr nuclear protein in immature thymocytes and colocalization with the matrix-associated region-binding SATB1 protein". Journal of Immunology. ج. 162 ع. 1: 292–8. PMID:9886398.
Liu J، Barnett A، Neufeld EJ، Dudley JP (يوليو 1999). "Homeoproteins CDP and SATB1 interact: potential for tissue-specific regulation". Molecular and Cellular Biology. ج. 19 ع. 7: 4918–26. DOI:10.1128/mcb.19.7.4918. PMC:84297. PMID:10373541.
Galande S، Dickinson LA، Mian IS، Sikorska M، Kohwi-Shigematsu T (أغسطس 2001). "SATB1 cleavage by caspase 6 disrupts PDZ domain-mediated dimerization, causing detachment from chromatin early in T-cell apoptosis". Molecular and Cellular Biology. ج. 21 ع. 16: 5591–604. DOI:10.1128/MCB.21.16.5591-5604.2001. PMC:87280. PMID:11463840.
Kieffer LJ، Greally JM، Landres I، Nag S، Nakajima Y، Kohwi-Shigematsu T، Kavathas PB (أبريل 2002). "Identification of a candidate regulatory region in the human CD8 gene complex by colocalization of DNase I hypersensitive sites and matrix attachment regions which bind SATB1 and GATA-3". Journal of Immunology. ج. 168 ع. 8: 3915–22. DOI:10.4049/jimmunol.168.8.3915. PMID:11937547.
Durrin LK، Krontiris TG (يونيو 2002). "The thymocyte-specific MAR binding protein, SATB1, interacts in vitro with a novel variant of DNA-directed RNA polymerase II, subunit 11". Genomics. ج. 79 ع. 6: 809–17. DOI:10.1006/geno.2002.6772. PMID:12036295.
Yasui D، Miyano M، Cai S، Varga-Weisz P، Kohwi-Shigematsu T (أكتوبر 2002). "SATB1 targets chromatin remodelling to regulate genes over long distances". Nature. ج. 419 ع. 6907: 641–5. DOI:10.1038/nature01084. PMID:12374985.
Cai S، Han HJ، Kohwi-Shigematsu T (مايو 2003). "Tissue-specific nuclear architecture and gene expression regulated by SATB1". Nature Genetics. ج. 34 ع. 1: 42–51. DOI:10.1038/ng1146. PMID:12692553.
Fujii Y، Kumatori A، Nakamura M (2004). "SATB1 makes a complex with p300 and represses gp91(phox) promoter activity". Microbiology and Immunology. ج. 47 ع. 10: 803–11. DOI:10.1111/j.1348-0421.2003.tb03438.x. PMID:14605447.
Gocke CB، Yu H، Kang J (فبراير 2005). "Systematic identification and analysis of mammalian small ubiquitin-like modifier substrates". The Journal of Biological Chemistry. ج. 280 ع. 6: 5004–12. DOI:10.1074/jbc.M411718200. PMID:15561718.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Wen J، Huang S، Rogers H، Dickinson LA، Kohwi-Shigematsu T، Noguchi CT (أبريل 2005). "SATB1 family protein expressed during early erythroid differentiation modifies globin gene expression". Blood. ج. 105 ع. 8: 3330–9. DOI:10.1182/blood-2004-08-2988. PMID:15618465.
Seo J، Lozano MM، Dudley JP (يوليو 2005). "Nuclear matrix binding regulates SATB1-mediated transcriptional repression". The Journal of Biological Chemistry. ج. 280 ع. 26: 24600–9. DOI:10.1074/jbc.M414076200. PMID:15851481.{{استشهاد بدورية محكمة}}: صيانة الاستشهاد: دوي مجاني غير معلم (link)
Nakayama Y، Mian IS، Kohwi-Shigematsu T، Ogawa T (أغسطس 2005). "A nuclear targeting determinant for SATB1, a genome organizer in the T cell lineage". Cell Cycle. ج. 4 ع. 8: 1099–106. DOI:10.4161/cc.4.8.1862. PMID:15970696.
Rual JF، Venkatesan K، Hao T، Hirozane-Kishikawa T، Dricot A، Li N، Berriz GF، Gibbons FD، Dreze M، Ayivi-Guedehoussou N، Klitgord N، Simon C، Boxem M، Milstein S، Rosenberg J، Goldberg DS، Zhang LV، Wong SL، Franklin G، Li S، Albala JS، Lim J، Fraughton C، Llamosas E، Cevik S، Bex C، Lamesch P، Sikorski RS، Vandenhaute J، Zoghbi HY، Smolyar A، Bosak S، Sequerra R، Doucette-Stamm L، Cusick ME، Hill DE، Roth FP، Vidal M (أكتوبر 2005). "Towards a proteome-scale map of the human protein-protein interaction network". Nature. ج. 437 ع. 7062: 1173–8. DOI:10.1038/nature04209. PMID:16189514.

[entrez-1] "Entrez Gene: SATB1 SATB homeobox 1". مؤرشف من الأصل في 2010-12-05.

[1]

التصنيفات الطبية	دليل الوراثة المندلية عند البشر (OMIM): 602075
المعرفات الخارجية	Ensembl Transcript ID: ENST00000493952 نظام اللغة الطبية الموحدة (UMLS CUI): C1419822