CD4

CD4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1CDH, 1CDI, 1CDJ, 1CDU, 1CDY, 1G9M, 1G9N, 1GC1, 1JL4, 1Q68, 1RZJ, 1RZK, 1WIO, 1WIP, 1WIQ, 2B4C, 2JKR, 2JKT, 2KLU, 2NXY, 2NXZ, 2NY0, 2NY1, 2NY2, 2NY3, 2NY4, 2NY5, 2NY6, 2QAD, 3B71, 3CD4, 3JWD, 3JWO, 3LQA, 3O2D, 3S5L, 3T0E, 4JM2, 1WBR, 3S4S, 4H8W, 4P9H, 4Q6I, 4R2G, 4R4H, 4RQS, 3J70, 5A7X, 5A8H, 5CAY
Ідентифікатори
Символи	CD4, CD4mut, CD4 molecule, OKT4D, IMD79
Зовнішні ІД	OMIM: 186940 MGI: 88335 HomoloGene: 513 GeneCards: CD4
Пов'язані генетичні захворювання
	ВІЛ-заворювання
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transmembrane signaling receptor activity; • virus receptor activity; • protein homodimerization activity; • zinc ion binding; • extracellular matrix structural constituent; • enzyme binding; • immunoglobulin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • coreceptor activity; • interleukin-16 binding; • interleukin-16 receptor activity; • MHC class II protein binding; • identical protein binding; • protein tyrosine kinase binding; • signaling receptor activity; • protein kinase binding; • signaling receptor binding;
Клітинна компонента	• endoplasmic reticulum lumen; • integral component of membrane; • early endosome; • мембрана; • cell surface; • endoplasmic reticulum membrane; • membrane raft; • T cell receptor complex; • external side of plasma membrane; • клітинна мембрана; • clathrin-coated vesicle membrane; • integral component of plasma membrane;
Біологічний процес	• transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • GO:0051636 defense response to Gram-negative bacterium; • positive regulation of protein kinase activity; • GO:0019049, GO:0030683 mitigation of host defenses by virus; • positive regulation of calcium-mediated signaling; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • helper T cell enhancement of adaptive immune response; • T cell selection; • response to estradiol; • induction by virus of host cell-cell fusion; • адаптивна імунна відповідь; • response to vitamin D; • T cell differentiation; • cell surface receptor signaling pathway; • positive regulation of T cell proliferation; • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; • enzyme linked receptor protein signaling pathway; • T cell activation; • positive regulation of T cell activation; • maintenance of protein location in cell; • GO:0032617 творба цитокінів; • T cell receptor signaling pathway; • процес імунної системи; • positive regulation of calcium ion transport into cytosol; • regulation of T cell activation; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • адгезія клітин; • GO:0022415 viral process; • fusion of virus membrane with host plasma membrane; • membrane organization; • positive regulation of protein phosphorylation; • positive regulation of kinase activity; • interleukin-15-mediated signaling pathway; • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling; • positive regulation of MAPK cascade; • positive regulation of monocyte differentiation; • GO:0060469, GO:0009371 позитивна регуляція транскрипції, ДНК-шаблонна; • positive regulation of viral entry into host cell; • regulation of calcium ion transport; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • cellular response to granulocyte macrophage colony-stimulating factor stimulus; • cytokine-mediated signaling pathway; • macrophage differentiation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	920
	12504
	ENSG00000010610
	ENSMUSG00000023274
	P01730
	P06332
NM_000616; NM_001195014; NM_001195015; NM_001195016; NM_001195017;
	NM_001382705; NM_001382706; NM_001382707; NM_001382714
	NM_013488
NP_000607; NP_001181943; NP_001181944; NP_001181945; NP_001181946;
	NP_001369634; NP_001369635; NP_001369636; NP_001369643
	NP_038516
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CD4 (англ. CD4 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 458 амінокислот, а молекулярна маса — 51 111^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MNRGVPFRHL	LLVLQLALLP	AATQGKKVVL	GKKGDTVELT	CTASQKKSIQ
FHWKNSNQIK	ILGNQGSFLT	KGPSKLNDRA	DSRRSLWDQG	NFPLIIKNLK
IEDSDTYICE	VEDQKEEVQL	LVFGLTANSD	THLLQGQSLT	LTLESPPGSS
PSVQCRSPRG	KNIQGGKTLS	VSQLELQDSG	TWTCTVLQNQ	KKVEFKIDIV
VLAFQKASSI	VYKKEGEQVE	FSFPLAFTVE	KLTGSGELWW	QAERASSSKS
WITFDLKNKE	VSVKRVTQDP	KLQMGKKLPL	HLTLPQALPQ	YAGSGNLTLA
LEAKTGKLHQ	EVNLVVMRAT	QLQKNLTCEV	WGPTSPKLML	SLKLENKEAK
VSKREKAVWV	LNPEAGMWQC	LLSDSGQVLL	ESNIKVLPTW	STPVQPMALI
VLGGVAGLLL	FIGLGIFFCV	RCRHRRRQAE	RMSQIKRLLS	EKKTCQCPHR
FQKTCSPI

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів. Задіяний у таких біологічних процесах, як адаптивний імунітет, імунітет, взаємодія хазяїн-вірус. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Littman D.R., Maddon P.J., Axel R. (1988). Corrected CD4 sequence. Cell. 55: 541—541. PMID 3263213 doi:10.1016/0092-8674(88)90211-5
Ansari-Lari M.A., Shen Y., Muzny D.M., Lee W., Gibbs R.A. (1997). Large-scale sequencing in human chromosome 12p13: experimental and computational gene structure determination. Genome Res. 7: 268—280. PMID 9074930 doi:10.1101/gr.7.3.268
Hodge T.W., Sasso D.R., McDougal J.S. (1991). Humans with OKT4-epitope deficiency have a single nucleotide base change in the CD4 gene, resulting in substitution of TRP240 for ARG240. Hum. Immunol. 30: 99—104. PMID 1708753 doi:10.1016/0198-8859(91)90077-M
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Fomsgaard A., Hirsch V.M., Johnson P.R. (1992). Cloning and sequences of primate CD4 molecules: diversity of the cellular receptor for simian immunodeficiency virus/human immunodeficiency virus. Eur. J. Immunol. 22: 2973—2981. PMID 1425921 doi:10.1002/eji.1830221132
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 doi:10.1110/ps.04682504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CD4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1678 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P01730 (англ.) . Архів оригіналу за 9 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 12

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CD4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1678 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P01730 (англ.) . Архів оригіналу за 9 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3 γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350