LAMP2

LAMP2
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи LAMP2, CD107b, LAMP-2, LAMPB, LGP110, lysosomal associated membrane protein 2, LGP-96, DND
Зовнішні ІД OMIM: 309060 MGI: 96748 HomoloGene: 7809 GeneCards: LAMP2
Пов'язані генетичні захворювання
Danon disease[1]
Шаблон експресії




Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3920
16784
Ensembl
ENSG00000005893
ENSMUSG00000016534
UniProt
P13473
P17047
RefSeq (мРНК)
NM_013995
NM_001122606
NM_002294
NM_001017959
NM_001290485
NM_010685
RefSeq (білок)
NP_001116078
NP_002285
NP_054701
NP_001017959
NP_001277414
NP_034815
Локус (UCSC) Хр. X: 120.43 – 120.47 Mb Хр. X: 37.49 – 37.55 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

LAMP2 (англ. Lysosomal associated membrane protein 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на X-хромосомі.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 410 амінокислот, а молекулярна маса — 44 961[5].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MVCFRLFPVP GSGLVLVCLV LGAVRSYALE LNLTDSENAT CLYAKWQMNF
TVRYETTNKT YKTVTISDHG TVTYNGSICG DDQNGPKIAV QFGPGFSWIA
NFTKAASTYS IDSVSFSYNT GDNTTFPDAE DKGILTVDEL LAIRIPLNDL
FRCNSLSTLE KNDVVQHYWD VLVQAFVQNG TVSTNEFLCD KDKTSTVAPT
IHTTVPSPTT TPTPKEKPEA GTYSVNNGND TCLLATMGLQ LNITQDKVAS
VININPNTTH STGSCRSHTA LLRLNSSTIK YLDFVFAVKN ENRFYLKEVN
ISMYLVNGSV FSIANNNLSY WDAPLGSSYM CNKEQTVSVS GAFQINTFDL
RVQPFNVTQG KYSTAQDCSA DDDNFLVPIA VGAALAGVLI LVLLAYFIGL
KHHHAGYEQF

Задіяний у таких біологічних процесах, як автофагія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, цитоплазматичних везикулах, лізосомі, ендосомах.

Література

  • Konecki D.S., Foetisch K., Schlotter M., Lichter-Konecki U. (1994). Complete cDNA sequence of human lysosome-associated membrane protein-2. Biochem. Biophys. Res. Commun. 205: 1—5. PMID 7999007 doi:10.1006/bbrc.1994.2620
  • Konecki D.S., Foetisch K., Zimmer K.P., Schlotter M., Lichter-Konecki U. (1995). An alternatively spliced form of the human lysosome-associated membrane protein-2 gene is expressed in a tissue-specific manner. Biochem. Biophys. Res. Commun. 215: 757—767. PMID 7488019 doi:10.1006/bbrc.1995.2528
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 doi:10.1110/ps.04682504
  • Carlsson S.R., Lycksell P.-O., Fukuda M. (1993). Assignment of O-glycan attachment sites to the hinge-like regions of human lysosomal membrane glycoproteins lamp-1 and lamp-2. Arch. Biochem. Biophys. 304: 65—73. PMID 8323299 doi:10.1006/abbi.1993.1322
  • Cuervo A.M., Dice J.F. (1996). A receptor for the selective uptake and degradation of proteins by lysosomes. Science. 273: 501—503. PMID 8662539 doi:10.1126/science.273.5274.501

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з LAMP2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6501 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. UniProt, P13473 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також