ITGAM

ITGAM
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи ITGAM, CD11B, CR3A, MAC-1, MAC1A, MO1A, SLEB6, integrin subunit alpha M
Зовнішні ІД OMIM: 120980 MGI: 96607 HomoloGene: 526 GeneCards: ITGAM
Пов'язані генетичні захворювання
системний червоний вовчак[1]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3684
16409
Ensembl
ENSG00000169896
ENSMUSG00000030786
UniProt
P11215
P05555
RefSeq (мРНК)
NM_000632
NM_001145808
NM_001082960
NM_008401
RefSeq (білок)
NP_000623
NP_001139280
н/д
Локус (UCSC) Хр. 16: 31.26 – 31.33 Mb Хр. 7: 127.66 – 127.72 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ITGAM (англ. Integrin subunit alpha M) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 152 амінокислот, а молекулярна маса — 127 179[5].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MALRVLLLTA LTLCHGFNLD TENAMTFQEN ARGFGQSVVQ LQGSRVVVGA
PQEIVAANQR GSLYQCDYST GSCEPIRLQV PVEAVNMSLG LSLAATTSPP
QLLACGPTVH QTCSENTYVK GLCFLFGSNL RQQPQKFPEA LRGCPQEDSD
IAFLIDGSGS IIPHDFRRMK EFVSTVMEQL KKSKTLFSLM QYSEEFRIHF
TFKEFQNNPN PRSLVKPITQ LLGRTHTATG IRKVVRELFN ITNGARKNAF
KILVVITDGE KFGDPLGYED VIPEADREGV IRYVIGVGDA FRSEKSRQEL
NTIASKPPRD HVFQVNNFEA LKTIQNQLRE KIFAIEGTQT GSSSSFEHEM
SQEGFSAAIT SNGPLLSTVG SYDWAGGVFL YTSKEKSTFI NMTRVDSDMN
DAYLGYAAAI ILRNRVQSLV LGAPRYQHIG LVAMFRQNTG MWESNANVKG
TQIGAYFGAS LCSVDVDSNG STDLVLIGAP HYYEQTRGGQ VSVCPLPRGR
ARWQCDAVLY GEQGQPWGRF GAALTVLGDV NGDKLTDVAI GAPGEEDNRG
AVYLFHGTSG SGISPSHSQR IAGSKLSPRL QYFGQSLSGG QDLTMDGLVD
LTVGAQGHVL LLRSQPVLRV KAIMEFNPRE VARNVFECND QVVKGKEAGE
VRVCLHVQKS TRDRLREGQI QSVVTYDLAL DSGRPHSRAV FNETKNSTRR
QTQVLGLTQT CETLKLQLPN CIEDPVSPIV LRLNFSLVGT PLSAFGNLRP
VLAEDAQRLF TALFPFEKNC GNDNICQDDL SITFSFMSLD CLVVGGPREF
NVTVTVRNDG EDSYRTQVTF FFPLDLSYRK VSTLQNQRSQ RSWRLACESA
SSTEVSGALK STSCSINHPI FPENSEVTFN ITFDVDSKAS LGNKLLLKAN
VTSENNMPRT NKTEFQLELP VKYAVYMVVT SHGVSTKYLN FTASENTSRV
MQHQYQVSNL GQRSLPISLV FLVPVRLNQT VIWDRPQVTF SENLSSTCHT
KERLPSHSDF LAELRKAPVV NCSIAVCQRI QCDIPFFGIQ EEFNATLKGN
LSFDWYIKTS HNHLLIVSTA EILFNDSVFT LLPGQGAFVR SQTETKVEPF
EVPNPLPLIV GSSVGGLLLL ALITAALYKL GFFKRQYKDM MSEGGPPGAE
PQ

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію, іоном магнію. Локалізований у мембрані.

Література

  • Arnaout M.A., Remold-O'Donnell E., Pierce M.W., Harris P., Tenen D.G. (1988). Molecular cloning of the alpha subunit of human and guinea pig leukocyte adhesion glycoprotein Mo1: chromosomal localization and homology to the alpha subunits of integrins. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 85: 2776—2780. PMID 2833753 doi:10.1073/pnas.85.8.2776
  • Arnaout M.A., Gupta S.K., Pierce M.W., Tenen D.G. (1988). Amino acid sequence of the alpha subunit of human leukocyte adhesion receptor Mo1 (complement receptor type 3). J. Cell Biol. 106: 2153—2158. PMID 2454931 doi:10.1083/jcb.106.6.2153
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Shelley C.S., Arnaout M.A. (1991). The promoter of the CD11b gene directs myeloid-specific and developmentally regulated expression. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 10525—10529. PMID 1683702 doi:10.1073/pnas.88.23.10525
  • Pierce M.W., Remold-O'Donnell E., Todd R.F. III, Arnaout M.A. (1986). N-terminal sequence of human leukocyte glycoprotein Mo1: conservation across species and homology to platelet IIb/IIIa. Biochim. Biophys. Acta. 874: 368—371. PMID 3539202 doi:10.1016/0167-4838(86)90037-3
  • Lee J.O., Rieu P., Arnaout M.A., Liddington R. (1995). Crystal structure of the A domain from the alpha subunit of integrin CR3 (CD11b/CD18). Cell. 80: 631—638. PMID 7867070 doi:10.1016/0092-8674(95)90517-0

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з ITGAM переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6149 (англ.) . Архів оригіналу за 14 жовтня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-10-14 у Wayback Machine.]
  5. UniProt, P11215 (англ.) . Архів оригіналу за 17 серпня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також