CDH5

CDH5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи CDH5, 7B4, CD144, VE-cadherin, cadherin 5
Зовнішні ІД OMIM: 601120 MGI: 105057 HomoloGene: 1359 GeneCards: CDH5
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
1003
12562
Ensembl
ENSG00000179776
ENSMUSG00000031871
UniProt
P33151
P55284
RefSeq (мРНК)
NM_001114117
NM_001795
NM_009868
RefSeq (білок)
NP_001786
NP_033998
Локус (UCSC) Хр. 16: 66.37 – 66.4 Mb Хр. 8: 104.83 – 104.87 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

CDH5 (англ. Cadherin 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 784 амінокислот, а молекулярна маса — 87 528[4].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MQRLMMLLAT SGACLGLLAV AAVAAAGANP AQRDTHSLLP THRRQKRDWI
WNQMHIDEEK NTSLPHHVGK IKSSVSRKNA KYLLKGEYVG KVFRVDAETG
DVFAIERLDR ENISEYHLTA VIVDKDTGEN LETPSSFTIK VHDVNDNWPV
FTHRLFNASV PESSAVGTSV ISVTAVDADD PTVGDHASVM YQILKGKEYF
AIDNSGRIIT ITKSLDREKQ ARYEIVVEAR DAQGLRGDSG TATVLVTLQD
INDNFPFFTQ TKYTFVVPED TRVGTSVGSL FVEDPDEPQN RMTKYSILRG
DYQDAFTIET NPAHNEGIIK PMKPLDYEYI QQYSFIVEAT DPTIDLRYMS
PPAGNRAQVI INITDVDEPP IFQQPFYHFQ LKENQKKPLI GTVLAMDPDA
ARHSIGYSIR RTSDKGQFFR VTKKGDIYNE KELDREVYPW YNLTVEAKEL
DSTGTPTGKE SIVQVHIEVL DENDNAPEFA KPYQPKVCEN AVHGQLVLQI
SAIDKDITPR NVKFKFILNT ENNFTLTDNH DNTANITVKY GQFDREHTKV
HFLPVVISDN GMPSRTGTST LTVAVCKCNE QGEFTFCEDM AAQVGVSIQA
VVAILLCILT ITVITLLIFL RRRLRKQARA HGKSVPEIHE QLVTYDEEGG
GEMDTTSYDV SVLNSVRRGG AKPPRPALDA RPSLYAQVQK PPRHAPGAHG
GPGEMAAMIE VKKDEADHDG DGPPYDTLHI YGYEGSESIA ESLSSLGTDS
SDSDVDYDFL NDWGPRFKML AELYGSDPRE ELLY

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

  • Shimoyama Y., Tsujimoto G., Kitajima M., Natori M. (2000). Identification of three human type-II classic cadherins and frequent heterophilic interactions between different subclasses of type-II classic cadherins. Biochem. J. 349: 159—167. PMID 10861224 doi:10.1042/0264-6021:3490159
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Ali J., Liao F., Martens E., Muller W.A. (1997). Vascular endothelial cadherin (VE-cadherin): cloning and role in endothelial cell-cell adhesion. Microcirculation. 4: 267—277. PMID 9219219
  • Suzuki S., Sano K., Tanihara H. (1991). Diversity of the cadherin family: evidence for eight new cadherins in nervous tissue. Cell Regul. 2: 261—270. PMID 2059658

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1764 (англ.) . Процитовано 11 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  4. UniProt, P33151 (англ.) . Архів оригіналу за 10 квітня 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також