ITGAV

ITGAV
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: H0WK80%20or%20H7BZG1 PDBe H0WK80,H7BZG1 RCSB
Список кодів PDB
	1JV2, 1L5G, 1M1X, 1U8C, 3IJE, 4G1E, 4G1M, 4MMX, 4MMY, 4MMZ, 4O02, 4UM8, 4UM9
Ідентифікатори
Символи	ITGAV, CD51, MSK8, VNRA, VTNR, integrin subunit alpha V
Зовнішні ІД	OMIM: 193210 MGI: 96608 HomoloGene: 20510 GeneCards: ITGAV
Реагує на сполуку
	cilengitide
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transforming growth factor beta binding; • зв’язування з іоном металу; • voltage-gated calcium channel activity; • virus receptor activity; • protein kinase C binding; • protease binding; • extracellular matrix protein binding; • extracellular matrix binding; • fibronectin binding; • opsonin binding; • insulin-like growth factor I binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • fibroblast growth factor binding; • neuregulin binding; • coreceptor activity; • C-X3-C chemokine binding; • signaling receptor binding; • пептидний зв'язок; • integrin binding;
Клітинна компонента	• lamellipodium membrane; • integrin alphav-beta3 complex; • екзосома; • alphav-beta3 integrin-IGF-1-IGF1R complex; • integral component of membrane; • integrin alphav-beta5 complex; • мембрана; • integrin alphav-beta8 complex; • ruffle membrane; • integrin complex; • microvillus membrane; • filopodium membrane; • external side of plasma membrane; • phagocytic vesicle; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • cell surface; • гіалоплазма; • focal adhesion; • міжклітинні контакти; • specific granule membrane; • integrin alphav-beta6 complex; • alphav-beta3 integrin-PKCalpha complex; • alphav-beta3 integrin-HMGB1 complex;
Біологічний процес	• regulation of phagocytosis; • apoptotic cell clearance; • endodermal cell differentiation; • apolipoprotein A-I-mediated signaling pathway; • negative chemotaxis; • negative regulation of lipid storage; • extracellular matrix organization; • heterotypic cell-cell adhesion; • positive regulation of cell migration; • regulation of apoptotic cell clearance; • substrate adhesion-dependent cell spreading; • vascular endothelial growth factor receptor signaling pathway; • cell-matrix adhesion; • GO:0022415 viral process; • antigen processing and presentation of exogenous peptide antigen via MHC class I, TAP-dependent; • blood vessel development; • negative regulation of entry of bacterium into host cell; • integrin-mediated signaling pathway; • calcium ion transmembrane transport; • negative regulation of macrophage derived foam cell differentiation; • negative regulation of extrinsic apoptotic signaling pathway; • leukocyte migration; • cell-substrate adhesion; • negative regulation of lipoprotein metabolic process; • negative regulation of lipid transport; • extrinsic apoptotic signaling pathway in absence of ligand; • positive regulation of cell adhesion; • ERK1 and ERK2 cascade; • cell growth; • positive regulation of osteoblast proliferation; • адгезія клітин; • Ангіогенез; • васкулогенез; • cellular calcium ion homeostasis; • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; • positive regulation of cell population proliferation; • cell migration; • neutrophil degranulation; • positive regulation of MAPK cascade; • cell adhesion mediated by integrin; • viral entry into host cell; • regulation of transforming growth factor beta activation;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3685
	16410
	ENSG00000138448
	ENSMUSG00000027087
	P06756
	P43406
	NM_001144999; NM_001145000; NM_002210
	NM_008402; NM_001398691
	NP_001138471; NP_001138472; NP_002201
	NP_032428; NP_001385620
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ITGAV (англ. Integrin subunit alpha V) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 048 амінокислот, а молекулярна маса — 116 038^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAFPPRRRLR	LGPRGLPLLL	SGLLLPLCRA	FNLDVDSPAE	YSGPEGSYFG
FAVDFFVPSA	SSRMFLLVGA	PKANTTQPGI	VEGGQVLKCD	WSSTRRCQPI
EFDATGNRDY	AKDDPLEFKS	HQWFGASVRS	KQDKILACAP	LYHWRTEMKQ
EREPVGTCFL	QDGTKTVEYA	PCRSQDIDAD	GQGFCQGGFS	IDFTKADRVL
LGGPGSFYWQ	GQLISDQVAE	IVSKYDPNVY	SIKYNNQLAT	RTAQAIFDDS
YLGYSVAVGD	FNGDGIDDFV	SGVPRAARTL	GMVYIYDGKN	MSSLYNFTGE
QMAAYFGFSV	AATDINGDDY	ADVFIGAPLF	MDRGSDGKLQ	EVGQVSVSLQ
RASGDFQTTK	LNGFEVFARF	GSAIAPLGDL	DQDGFNDIAI	AAPYGGEDKK
GIVYIFNGRS	TGLNAVPSQI	LEGQWAARSM	PPSFGYSMKG	ATDIDKNGYP
DLIVGAFGVD	RAILYRARPV	ITVNAGLEVY	PSILNQDNKT	CSLPGTALKV
SCFNVRFCLK	ADGKGVLPRK	LNFQVELLLD	KLKQKGAIRR	ALFLYSRSPS
HSKNMTISRG	GLMQCEELIA	YLRDESEFRD	KLTPITIFME	YRLDYRTAAD
TTGLQPILNQ	FTPANISRQA	HILLDCGEDN	VCKPKLEVSV	DSDQKKIYIG
DDNPLTLIVK	AQNQGEGAYE	AELIVSIPLQ	ADFIGVVRNN	EALARLSCAF
KTENQTRQVV	CDLGNPMKAG	TQLLAGLRFS	VHQQSEMDTS	VKFDLQIQSS
NLFDKVSPVV	SHKVDLAVLA	AVEIRGVSSP	DHVFLPIPNW	EHKENPETEE
DVGPVVQHIY	ELRNNGPSSF	SKAMLHLQWP	YKYNNNTLLY	ILHYDIDGPM
NCTSDMEINP	LRIKISSLQT	TEKNDTVAGQ	GERDHLITKR	DLALSEGDIH
TLGCGVAQCL	KIVCQVGRLD	RGKSAILYVK	SLLWTETFMN	KENQNHSYSL
KSSASFNVIE	FPYKNLPIED	ITNSTLVTTN	VTWGIQPAPM	PVPVWVIILA
VLAGLLLLAV	LVFVMYRMGF	FKRVRPPQEE	QEREQLQPHE	NGEGNSET

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, інтегринів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, взаємодія хазяїн-вірус, поліморфізм, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у мембрані, клітинних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Donahue J.P., Sugg N., Hawiger J. (1994). The integrin alpha v gene: identification and characterization of the promoter region. Biochim. Biophys. Acta. 1219: 228—232. PMID 7522056 doi:10.1016/0167-4781(94)90278-X
Cheresh D.A., Smith J.W., Cooper H.M., Quaranta V. (1989). A novel vitronectin receptor integrin (alpha v beta x) is responsible for distinct adhesive properties of carcinoma cells. Cell. 57: 59—69. PMID 2467745 doi:10.1016/0092-8674(89)90172-4
Joki-Korpela P., Marjomaki V., Krogerus C., Heino J., Hyypia T. (2001). Entry of human parechovirus 1. J. Virol. 75: 1958—1967. PMID 11160695 doi:10.1128/JVI.75.4.1958-1967.2001
Zhang H., Li X.-J., Martin D.B., Aebersold R. (2003). Identification and quantification of N-linked glycoproteins using hydrazide chemistry, stable isotope labeling and mass spectrometry. Nat. Biotechnol. 21: 660—666. PMID 12754519 doi:10.1038/nbt827
Vallon M., Essler M. (2006). Proteolytically processed soluble tumor endothelial marker (TEM) 5 mediates endothelial cell survival during angiogenesis by linking integrin alpha(v)beta3 to glycosaminoglycans. J. Biol. Chem. 281: 34179—34188. PMID 16982628 doi:10.1074/jbc.M605291200

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Integrin alpha-V переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6150 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2017-09-15 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P06756 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 2

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з Integrin alpha-V переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6150 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2017-09-15 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, P06756 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3 γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350