DDR2 (ген)

DDR2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2WUH, 2Z4F
Ідентифікатори
Символи	DDR2, MIG20a, NTRKR3, TKT, TYRO10, discoidin domain receptor tyrosine kinase 2, WRCN
Зовнішні ІД	OMIM: 191311 MGI: 1345277 HomoloGene: 68505 GeneCards: DDR2
Пов'язані генетичні захворювання
	spondyloepimetaphyseal dysplasia-short limb-abnormal calcification syndrome
Реагує на сполуку
	сорафеніб
Онтологія гена
Молекулярна функція	• transferase activity; • nucleotide binding; • protein kinase activity; • kinase activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase activity; • protein tyrosine kinase collagen receptor activity; • protein tyrosine kinase activity; • ATP binding; • collagen binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • focal adhesion; • integral component of plasma membrane; • екзосома; • apical plasma membrane; • клітинна мембрана; • actin cytoskeleton; • receptor complex;
Біологічний процес	• collagen-activated tyrosine kinase receptor signaling pathway; • осифікація; • фосфорилювання; • collagen fibril organization; • transmembrane receptor protein tyrosine kinase signaling pathway; • regulation of bone mineralization; • positive regulation of fibroblast proliferation; • biomineral tissue development; • positive regulation of DNA-binding transcription factor activity; • extracellular matrix organization; • regulation of extracellular matrix disassembly; • positive regulation of extracellular matrix disassembly; • protein phosphorylation; • адгезія клітин; • positive regulation of osteoblast differentiation; • chondrocyte proliferation; • positive regulation of cell population proliferation; • peptidyl-tyrosine phosphorylation; • endochondral bone growth; • positive regulation of fibroblast migration; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • positive regulation of protein kinase activity; • protein autophosphorylation; • regulation of cell-matrix adhesion; • cell-matrix adhesion; • диференціація клітин; • regulation of extracellular matrix organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4921
	18214
	ENSG00000162733
	ENSMUSG00000026674
	Q16832
	Q62371
	NM_001014796; NM_006182; NM_001354982; NM_001354983
	NM_022563
	NP_001014796; NP_006173; NP_001341911; NP_001341912
	NP_072075
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

DDR2 (англ. Discoidin domain receptor tyrosine kinase 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 855 амінокислот, а молекулярна маса — 96 736^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MILIPRMLLV	LFLLLPILSS	AKAQVNPAIC	RYPLGMSGGQ	IPDEDITASS
QWSESTAAKY	GRLDSEEGDG	AWCPEIPVEP	DDLKEFLQID	LHTLHFITLV
GTQGRHAGGH	GIEFAPMYKI	NYSRDGTRWI	SWRNRHGKQV	LDGNSNPYDI
FLKDLEPPIV	ARFVRFIPVT	DHSMNVCMRV	ELYGCVWLDG	LVSYNAPAGQ
QFVLPGGSII	YLNDSVYDGA	VGYSMTEGLG	QLTDGVSGLD	DFTQTHEYHV
WPGYDYVGWR	NESATNGYIE	IMFEFDRIRN	FTTMKVHCNN	MFAKGVKIFK
EVQCYFRSEA	SEWEPNAISF	PLVLDDVNPS	ARFVTVPLHH	RMASAIKCQY
HFADTWMMFS	EITFQSDAAM	YNNSEALPTS	PMAPTTYDPM	LKVDDSNTRI
LIGCLVAIIF	ILLAIIVIIL	WRQFWQKMLE	KASRRMLDDE	MTVSLSLPSD
SSMFNNNRSS	SPSEQGSNST	YDRIFPLRPD	YQEPSRLIRK	LPEFAPGEEE
SGCSGVVKPV	QPSGPEGVPH	YAEADIVNLQ	GVTGGNTYSV	PAVTMDLLSG
KDVAVEEFPR	KLLTFKEKLG	EGQFGEVHLC	EVEGMEKFKD	KDFALDVSAN
QPVLVAVKML	RADANKNARN	DFLKEIKIMS	RLKDPNIIHL	LAVCITDDPL
CMITEYMENG	DLNQFLSRHE	PPNSSSSDVR	TVSYTNLKFM	ATQIASGMKY
LSSLNFVHRD	LATRNCLVGK	NYTIKIADFG	MSRNLYSGDY	YRIQGRAVLP
IRWMSWESIL	LGKFTTASDV	WAFGVTLWET	FTFCQEQPYS	QLSDEQVIEN
TGEFFRDQGR	QTYLPQPAIC	PDSVYKLMLS	CWRRDTKNRP	SFQEIHLLLL
QQGDE

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до трансфераз, кіназ, рецепторів, тирозинових протеїнкіназ, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як остеогенез, поліморфізм. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Vogel W., Gish G.D., Alves F., Pawson T. (1997). The discoidin domain receptor tyrosine kinases are activated by collagen. Mol. Cell. 1: 13—23. PMID 9659899 doi:10.1016/S1097-2765(00)80003-9
Wall S.J., Werner E., Werb Z., DeClerck Y.A. (2005). Discoidin domain receptor 2 mediates tumor cell cycle arrest induced by fibrillar collagen. J. Biol. Chem. 280: 40187—40194. PMID 16186104 doi:10.1074/jbc.M508226200
Vogel W.F., Abdulhussein R., Ford C.E. (2006). Sensing extracellular matrix: an update on discoidin domain receptor function. Cell. Signal. 18: 1108—1116. PMID 16626936 doi:10.1016/j.cellsig.2006.02.012
Leitinger B. (2011). Transmembrane collagen receptors. Annu. Rev. Cell Dev. Biol. 27: 265—290. PMID 21568710 doi:10.1146/annurev-cellbio-092910-154013

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з DDR2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2731 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q16832 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

[1] Захворювання, генетично пов'язані з DDR2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Discoidin domain receptor tyrosine kinase 2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2731 (англ.) . Процитовано 25 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-6] UniProt, Q16832 (англ.) . Архів оригіналу за 24 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3 γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350