| CD40
|
|---|
 |
|
|
| Ідентифікатори
|
|---|
| Символи
| CD40, Bp50, CDW40, TNFRSF5, p50, CD40 (protein), CD40 molecule |
|---|
| Зовнішні ІД |
OMIM: 109535 MGI: 88336 HomoloGene: 954 GeneCards: CD40
|
|---|
|
|
| Пов'язані генетичні захворювання |
|---|
| ревматоїдний артрит, CD40 deficiency[1] |
| Онтологія гена |
|---|
| Молекулярна функція |
• GO:0003823, GO:0051635 antigen binding • signal transducer activity • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • tumor necrosis factor-activated receptor activity • enzyme binding • ubiquitin protein ligase binding • protein domain specific binding • signaling receptor activity
|
|---|
| Клітинна компонента |
• цитоплазма • integral component of membrane • внутрішньоклітинна мембранна органела • мембрана • клітинна мембрана • integral component of plasma membrane • extracellular region • cell surface • CD40 receptor complex • екзосома • external side of plasma membrane • міжклітинний простір • soma • varicosity
|
|---|
| Біологічний процес |
• positive regulation of protein phosphorylation • positive regulation of MAP kinase activity • positive regulation of interleukin-12 production • protein kinase B signaling • positive regulation of protein kinase C signaling • процес імунної системи • cellular calcium ion homeostasis • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • immune response-regulating cell surface receptor signaling pathway • platelet activation • multicellular organism development • B cell activation • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity • response to lipopolysaccharide • B cell proliferation • cellular response to mechanical stimulus • positive regulation of endothelial cell apoptotic process • regulation of cell population proliferation • positive regulation of B cell proliferation • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity • defense response to virus • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь • regulation of immune response • positive regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • apoptotic signaling pathway • positive regulation of isotype switching to IgG isotypes • cellular response to lipopolysaccharide • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • defense response to protozoan • response to bacterium • response to nutrient levels • response to cobalamin • response to interferon-gamma • cellular response to erythropoietin • cellular response to interleukin-1 • cellular response to tumor necrosis factor • response to peptide • inflammatory response • positive regulation of tyrosine phosphorylation of STAT protein • positive regulation of blood vessel endothelial cell migration • positive regulation of angiogenesis • GO:0034622 protein-containing complex assembly
|
|---|
| Джерела:Amigo / QuickGO | |
| Шаблон експресії |
|---|


 |
| Більше даних
|
| Ортологи |
|---|
| Види |
Людина |
Миша |
|---|
| Entrez | |
|
|---|
| Ensembl |
|
|
|---|
| UniProt |
|
|
|---|
| RefSeq (мРНК) |
| |
|---|
| RefSeq (білок) |
| |
|---|
| Локус (UCSC) |
Хр. 20: 46.12 – 46.13 Mb
| Хр. 2: 164.9 – 164.91 Mb
|
|---|
| PubMed search |
[2]
| [3] |
|---|
| Вікідані |
|
CD40 (англ. CD40 molecule) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 277 амінокислот, а молекулярна маса — 30 619[5].
Послідовність амінокислот
| 10
|
|
20
|
|
30
|
|
40
|
|
50
|
| MVRLPLQCVL
|
|
WGCLLTAVHP
|
|
EPPTACREKQ
|
|
YLINSQCCSL
|
|
CQPGQKLVSD
|
| CTEFTETECL
|
|
PCGESEFLDT
|
|
WNRETHCHQH
|
|
KYCDPNLGLR
|
|
VQQKGTSETD
|
| TICTCEEGWH
|
|
CTSEACESCV
|
|
LHRSCSPGFG
|
|
VKQIATGVSD
|
|
TICEPCPVGF
|
| FSNVSSAFEK
|
|
CHPWTSCETK
|
|
DLVVQQAGTN
|
|
KTDVVCGPQD
|
|
RLRALVVIPI
|
| IFGILFAILL
|
|
VLVFIKKVAK
|
|
KPTNKAPHPK
|
|
QEPQEINFPD
|
|
DLPGSNTAAP
|
| VQETLHGCQP
|
|
VTQEDGKESR
|
|
ISVQERQ
|
Кодований геном білок за функцією належить до рецепторів.
Задіяний у таких біологічних процесах, як імунітет, альтернативний сплайсинг.
Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.
Також секретований назовні.
Література
- Tone M., Tone Y., Fairchild P.J., Wykes M., Waldmann H. (2001). Regulation of CD40 function by its isoforms generated through alternative splicing. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 98: 1751—1756. PMID 11172023 doi:10.1073/pnas.98.4.1751
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
- Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 doi:10.1110/ps.04682504
- Sato T., Irie S., Reed J.C. (1995). A novel member of the TRAF family of putative signal transducing proteins binds to the cytosolic domain of CD40. FEBS Lett. 358: 113—118. PMID 7530216 doi:10.1016/0014-5793(94)01406-Q
- Bajorath J., Aruffo A. (1997). Construction and analysis of a detailed three-dimensional model of the ligand binding domain of the human B cell receptor CD40. Proteins. 27: 59—70. PMID 9037712 doi:10.1002/(SICI)1097-0134(199701)27:1<59::AID-PROT7>3.3.CO;2-Z
- Stamenkovic I., Clark E.A., Seed B. (1989). A B-lymphocyte activation molecule related to the nerve growth factor receptor and induced by cytokines in carcinomas. EMBO J. 8: 1403—1410. PMID 2475341
Примітки
Див. також
|
|---|
| 1-50 | |
|---|
| 51-100 | |
|---|
| 101-150 | |
|---|
| 151-200 | |
|---|
| 201-250 | |
|---|
| 251-300 | |
|---|
| 301-350 | |
|---|