CD44

CD44
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1POZ, 1UUH, 2I83, 4PZ3, 4PZ4
Ідентифікатори
Символи	CD44, CDW44, CSPG8, ECMR-III, HCELL, HUTCH-I, IN, LHR, MC56, MDU2, MDU3, MIC4, Pgp1, CD44 molecule (Indian blood group)
Зовнішні ІД	OMIM: 107269 MGI: 88338 HomoloGene: 508 GeneCards: CD44
Онтологія гена
Молекулярна функція	• collagen binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • hyaluronic acid binding; • GO:0016518 cytokine receptor activity; • transmembrane signaling receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • комплекс Ґольджі; • macrophage migration inhibitory factor receptor complex; • мембрана; • focal adhesion; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • cell surface; • екзосома; • гіалоплазма; • secretory granule membrane; • apical plasma membrane; • lamellipodium membrane; • cell projection; • Мікроворсинки; • basolateral plasma membrane;
Біологічний процес	• negative regulation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process; • monocyte aggregation; • positive regulation of heterotypic cell-cell adhesion; • hyaluronan catabolic process; • negative regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator; • interferon-gamma-mediated signaling pathway; • extracellular matrix disassembly; • extracellular matrix organization; • negative regulation of apoptotic process; • cellular response to fibroblast growth factor stimulus; • positive regulation of peptidyl-serine phosphorylation; • cartilage development; • адгезія клітин; • negative regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; • cell-matrix adhesion; • positive regulation of monocyte aggregation; • leukocyte migration; • neutrophil degranulation; • wound healing, spreading of cells; • regulation of lamellipodium morphogenesis; • cell-cell adhesion; • inflammatory response; • cell migration; • T cell activation; • positive regulation of kinase activity;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	960
	12505
	ENSG00000026508
	ENSMUSG00000005087
	P16070
	P15379
NM_000610; NM_001001389; NM_001001390; NM_001001391; NM_001001392;
	NM_001202555; NM_001202556; NM_001202557
NM_001039150; NM_001039151; NM_001177785; NM_001177786; NM_001177787;
	NM_009851
NP_000601; NP_001001389; NP_001001390; NP_001001391; NP_001001392;
	NP_001189484; NP_001189485; NP_001189486
NP_001034239; NP_001034240; NP_001171256; NP_001171257; NP_001171258;
	NP_033981
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CD44 (англ. CD44 molecule (Indian blood group)) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 11-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 742 амінокислот, а молекулярна маса — 81 538^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MDKFWWHAAW	GLCLVPLSLA	QIDLNITCRF	AGVFHVEKNG	RYSISRTEAA
DLCKAFNSTL	PTMAQMEKAL	SIGFETCRYG	FIEGHVVIPR	IHPNSICAAN
NTGVYILTSN	TSQYDTYCFN	ASAPPEEDCT	SVTDLPNAFD	GPITITIVNR
DGTRYVQKGE	YRTNPEDIYP	SNPTDDDVSS	GSSSERSSTS	GGYIFYTFST
VHPIPDEDSP	WITDSTDRIP	ATTLMSTSAT	ATETATKRQE	TWDWFSWLFL
PSESKNHLHT	TTQMAGTSSN	TISAGWEPNE	ENEDERDRHL	SFSGSGIDDD
EDFISSTIST	TPRAFDHTKQ	NQDWTQWNPS	HSNPEVLLQT	TTRMTDVDRN
GTTAYEGNWN	PEAHPPLIHH	EHHEEEETPH	STSTIQATPS	STTEETATQK
EQWFGNRWHE	GYRQTPKEDS	HSTTGTAAAS	AHTSHPMQGR	TTPSPEDSSW
TDFFNPISHP	MGRGHQAGRR	MDMDSSHSIT	LQPTANPNTG	LVEDLDRTGP
LSMTTQQSNS	QSFSTSHEGL	EEDKDHPTTS	TLTSSNRNDV	TGGRRDPNHS
EGSTTLLEGY	TSHYPHTKES	RTFIPVTSAK	TGSFGVTAVT	VGDSNSNVNR
SLSGDQDTFH	PSGGSHTTHG	SESDGHSHGS	QEGGANTTSG	PIRTPQIPEW
LIILASLLAL	ALILAVCIAV	NSRRRCGQKK	KLVINSGNGA	VEDRKPSGLN
GEASKSQEMV	HLVNKESSET	PDQFMTADET	RNLQNVDMKI	GV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

Stamenkovic I., Amiot M., Pesando J.M., Seed B. (1989). A lymphocyte molecule implicated in lymph node homing is a member of the cartilage link protein family. Cell. 56: 1057—1062. PMID 2466575 doi:10.1016/0092-8674(89)90638-7
Harn H.-J., Isola N., Cooper D.L. (1991). The multispecific cell adhesion molecule CD44 is represented in reticulocyte cDNA. Biochem. Biophys. Res. Commun. 178: 1127—1134. PMID 1840487 doi:10.1016/0006-291X(91)91009-2
Dougherty G.J., Lansdorp P.M., Cooper D.L., Humphries R.K. (1991). Molecular cloning of CD44R1 and CD44R2, two novel isoforms of the human CD44 lymphocyte 'homing' receptor expressed by hemopoietic cells. J. Exp. Med. 174: 1—5. PMID 2056274 doi:10.1084/jem.174.1.1
Kugelman L.C., Ganguly S., Haggerty J.G., Weissman S.M., Milstone L.M. (1992). The core protein of epican, a heparan sulfate proteoglycan on keratinocytes, is an alternative form of CD44. J. Invest. Dermatol. 99: 886—891. PMID 1281868 doi:10.1111/1523-1747.ep12614896
Tanabe K.K., Nishi T., Saya H. (1993). Novel variants of CD44 arising from alternative splicing: changes in the CD44 alternative splicing pattern of MCF-7 breast carcinoma cells treated with hyaluronidase. Mol. Carcinog. 7: 212—220. PMID 8352881 doi:10.1002/mc.2940070403
Chiu R.K., Carpenito C., Dougherty S.T., Hayes G.M., Dougherty G.J. (1999). Identification and characterization of CD44RC, a novel alternatively spliced soluble CD44 isoform that can potentiate the hyaluronan binding activity of cell surface CD44. Neoplasia. 1: 446—452. PMID 10933060 doi:10.1038/sj.neo.7900045

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1681 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-08-24 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P16070 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 11

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:1681 (англ.) . Архів оригіналу за 24 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017. [Архівовано 2017-08-24 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, P16070 (англ.) . Архів оригіналу за 31 серпня 2017. Процитовано 8 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3 γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350