CXCR4

CXCR4
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4RWS, 2K03, 2K04, 2K05, 3ODU, 3OE0, 3OE6, 3OE8, 3OE9, 2N55
Ідентифікатори
Символи	CXCR4, CD184, D2S201E, FB22, HM89, HSY3RR, LAP-3, LAP3, LCR1, LESTR, NPY3R, NPYR, NPYRL, NPYY3R, WHIM, WHIMS, C-X-C motif chemokine receptor 4, WHIMS1
Зовнішні ІД	OMIM: 162643 MGI: 109563 HomoloGene: 20739 GeneCards: CXCR4
Пов'язані генетичні захворювання
	WHIM syndrome
Реагує на сполуку
	plerixafor, mavorixafor
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0019974 cytokine binding; • coreceptor activity; • virus receptor activity; • signal transducer activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • chemokine receptor activity; • myosin light chain binding; • actin binding; • ubiquitin protein ligase binding; • G protein-coupled receptor activity; • C-X-C chemokine receptor activity; • ubiquitin binding; • C-C chemokine binding; • C-C chemokine receptor activity; • chemokine binding; • C-X-C motif chemokine 12 receptor activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • integral component of membrane; • ендосома; • мембрана; • cell surface; • міжклітинні контакти; • cell leading edge; • екзосома; • GO:0016023 цитоплазматичний міхур; • early endosome; • late endosome; • лізосома; • клітинна мембрана; • external side of plasma membrane; • GO:0009327 protein-containing complex; • клітинне ядро;
Біологічний процес	• myelin maintenance; • positive regulation of oligodendrocyte differentiation; • response to hypoxia; • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; • chemokine-mediated signaling pathway; • response to virus; • dendritic cell chemotaxis; • cellular response to cytokine stimulus; • хемотаксис; • inflammatory response; • calcium-mediated signaling; • GO:0072468 сигнальна трансдукція; • GO:0097285 апоптоз; • GO:0022415 viral process; • fusion of virus membrane with host plasma membrane; • regulation of chemotaxis; • G protein-coupled receptor signaling pathway; • axon guidance; • GO:0046730, GO:0046737, GO:0046738, GO:0046736 імунна відповідь; • brain development; • Нейрогенез; • CXCL12-activated CXCR4 signaling pathway; • cell chemotaxis; • positive regulation of cold-induced thermogenesis; • regulation of cell adhesion; • neuron migration; • epithelial cell development; • neuron recognition; • response to activity; • cell migration; • telencephalon cell migration; • positive regulation of cell migration; • positive regulation of vascular wound healing; • regulation of programmed cell death; • response to morphine; • endothelial cell differentiation; • positive regulation of neurogenesis; • regulation of viral process; • positive regulation of chemotaxis; • detection of temperature stimulus involved in sensory perception of pain; • detection of mechanical stimulus involved in sensory perception of pain; • regulation of calcium ion transport; • cardiac muscle contraction; • endothelial tube morphogenesis; • positive regulation of dendrite extension; • positive regulation of mesenchymal stem cell migration; • response to ultrasound;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	7852
	12767
	ENSG00000121966
	ENSMUSG00000045382
	P61073
	P70658
	NM_003467; NM_001008540; NM_001348056; NM_001348059; NM_001348060
	NM_009911; NM_001356509
	NP_001008540; NP_003458; NP_001334985; NP_001334988; NP_001334989
	NP_034041; NP_001343438
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

CXCR4 (англ. C-X-C motif chemokine receptor 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 352 амінокислот, а молекулярна маса — 39 746^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MEGISIYTSD	NYTEEMGSGD	YDSMKEPCFR	EENANFNKIF	LPTIYSIIFL
TGIVGNGLVI	LVMGYQKKLR	SMTDKYRLHL	SVADLLFVIT	LPFWAVDAVA
NWYFGNFLCK	AVHVIYTVNL	YSSVLILAFI	SLDRYLAIVH	ATNSQRPRKL
LAEKVVYVGV	WIPALLLTIP	DFIFANVSEA	DDRYICDRFY	PNDLWVVVFQ
FQHIMVGLIL	PGIVILSCYC	IIISKLSHSK	GHQKRKALKT	TVILILAFFA
CWLPYYIGIS	IDSFILLEII	KQGCEFENTV	HKWISITEAL	AFFHCCLNPI
LYAFLGAKFK	TSAQHALTSV	SRGSSLKILS	KGKRGGHSSV	STESESSSFH
SS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, g-білокспряжених рецепторів, білків внутрішньоклітинного сигналінгу, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, лізосомі, ендосомах.

Література

Herzog H., Hort Y.J., Shine J., Selbie L.A. (1993). Molecular cloning, characterization, and localization of the human homolog to the reported bovine NPY Y3 receptor: lack of NPY binding and activation. DNA Cell Biol. 12: 465—471. PMID 8329116 doi:10.1089/dna.1993.12.465
Nomura H., Nielsen B.W., Matsushima K. (1993). Molecular cloning of cDNAs encoding a LD78 receptor and putative leukocyte chemotactic peptide receptors. Int. Immunol. 5: 1239—1249. PMID 7505609 doi:10.1093/intimm/5.10.1239
Feng Y., Broder C.C., Kennedy P.E., Berger E.A. (1996). HIV-1 entry cofactor: functional cDNA cloning of a seven-transmembrane, G protein-coupled receptor. Science. 272: 872—877. PMID 8629022 doi:10.1126/science.272.5263.872
Frodl R., Gierschik P., Moepps B. (1998). Genomic organization and expression of the CXCR4 gene in mouse and man: absence of a splice variant corresponding to mouse CXCR4-B in human tissues. J. Recept. Signal Transduct. 18: 321—344. PMID 9879064 doi:10.3109/10799899809047750
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Brelot A., Heveker N., Montes M., Alizon M. (2000). Identification of residues of CXCR4 critical for human immunodeficiency virus coreceptor and chemokine receptor activities. J. Biol. Chem. 275: 23736—23744. PMID 10825158 doi:10.1074/jbc.M000776200

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з CXCR4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з CXCR4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2561 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P61073 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 2

[1] Захворювання, генетично пов'язані з CXCR4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з CXCR4 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2561 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-6] UniProt, P61073 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3 γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350