F11R

F11R
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1NBQ, 3EOY, 3TSZ, 4ODB
Ідентифікатори
Символи	F11R, F11r, 9130004G24, AA638916, ESTM33, JAM, JAM-1, JAM-A, Jcam, Jcam1, Ly106, CD321, JAM1, JAMA, KAT, PAM-1, F11 receptor
Зовнішні ІД	OMIM: 605721 MGI: 1321398 HomoloGene: 14255 GeneCards: F11R
Онтологія гена
Молекулярна функція	• PDZ domain binding; • virus receptor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • cadherin binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • мембрана; • cell-cell junction; • bicellular tight junction; • клітинна мембрана; • slit diaphragm; • екзосома; • GO:0016023 цитоплазматичний міхур; • міжклітинні контакти;
Біологічний процес	• regulation of actin cytoskeleton reorganization; • диференціація клітин; • establishment of endothelial intestinal barrier; • epithelial cell differentiation; • actomyosin structure organization; • extracellular matrix organization; • regulation of membrane permeability; • GO:0032657 regulation of cytokine production; • GO:0032320, GO:0032321, GO:0032855, GO:0043089, GO:0032854 positive regulation of GTPase activity; • positive regulation of blood pressure; • адгезія клітин; • GO:0034259 negative regulation of GTPase activity; • bicellular tight junction assembly; • viral entry into host cell; • intestinal absorption; • response to radiation; • inflammatory response; • GO:0022415 viral process; • transforming growth factor beta receptor signaling pathway; • leukocyte migration; • protein localization to plasma membrane;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	50848
	16456
	ENSG00000158769
	ENSMUSG00000038235
	Q9Y624
	O88792
NM_016946; NM_144501; NM_144502; NM_144503; NM_144504;
	NM_001348091; NM_001382727; NM_001382730; NM_001382733; NM_001382734
	NM_172647
NP_058642; NP_001335020; NP_001369656; NP_001369659; NP_001369662;
	NP_001369663
	NP_766235
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

F11R (англ. F11 receptor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 299 амінокислот, а молекулярна маса — 32 583^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGTKAQVERK	LLCLFILAIL	LCSLALGSVT	VHSSEPEVRI	PENNPVKLSC
AYSGFSSPRV	EWKFDQGDTT	RLVCYNNKIT	ASYEDRVTFL	PTGITFKSVT
REDTGTYTCM	VSEEGGNSYG	EVKVKLIVLV	PPSKPTVNIP	SSATIGNRAV
LTCSEQDGSP	PSEYTWFKDG	IVMPTNPKST	RAFSNSSYVL	NPTTGELVFD
PLSASDTGEY	SCEARNGYGT	PMTSNAVRME	AVERNVGVIV	AAVLVTLILL
GILVFGIWFA	YSRGHFDRTK	KGTSSKKVIY	SQPSARSEGE	FKQTSSFLV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів клітини-хазяїна для входу вірусу, рецепторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах, щільних контактах.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Naik U.P., Ehrlich Y.H., Kornecki E. (1995). Mechanisms of platelet activation by a stimulatory antibody: cross-linking of a novel platelet receptor for monoclonal antibody F11 with the Fc gamma RII receptor. Biochem. J. 310: 155—162. PMID 7646439 doi:10.1042/bj3100155
Zhang Z., Henzel W.J. (2004). Signal peptide prediction based on analysis of experimentally verified cleavage sites. Protein Sci. 13: 2819—2824. PMID 15340161 doi:10.1110/ps.04682504
Ostermann G., Weber K.S., Zernecke A., Schroeder A., Weber C. (2002). JAM-1 is a ligand of the beta(2) integrin LFA-1 involved in transendothelial migration of leukocytes. Nat. Immunol. 3: 151—158. PMID 11812992 doi:10.1038/ni755
Muller W.A. (2003). Leukocyte-endothelial-cell interactions in leukocyte transmigration and the inflammatory response. Trends Immunol. 24: 327—334. PMID 12810109 doi:10.1016/S1471-4906(03)00117-0
Fraemohs L., Koenen R.R., Ostermann G., Heinemann B., Weber C. (2004). The functional interaction of the beta 2 integrin lymphocyte function-associated antigen-1 with junctional adhesion molecule-A is mediated by the I domain. J. Immunol. 173: 6259—6264. PMID 15528364 doi:10.4049/jimmunol.173.10.6259

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14685 (англ.) . Архів оригіналу за 30 червня 2017. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2017-06-30 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9Y624 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14685 (англ.) . Архів оригіналу за 30 червня 2017. Процитовано 28 серпня 2017. [Архівовано 2017-06-30 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9Y624 (англ.) . Архів оригіналу за 25 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3 γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350