ITGA6

ITGA6
Ідентифікатори
Символи ITGA6, CD49f, ITGA6B, VLA-6, integrin subunit alpha 6, JEB6
Зовнішні ІД OMIM: 147556 MGI: 96605 HomoloGene: 20091 GeneCards: ITGA6
Пов'язані генетичні захворювання
рак простати[1]
Шаблон експресії


Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3655
16403
Ensembl
ENSG00000091409
ENSMUSG00000027111
UniProt
P23229
Q61739
RefSeq (мРНК)
NM_001277970
NM_008397
RefSeq (білок)
NP_000201
NP_001073286
NP_001303235
NP_001352458
NP_001352459
NP_001264899
NP_032423
NP_001393187
Локус (UCSC) Хр. 2: 172.43 – 172.51 Mb Хр. 2: 71.58 – 71.69 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

ITGA6 (англ. Integrin subunit alpha 6) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 130 амінокислот, а молекулярна маса — 126 606[5].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAAAGQLCLL YLSAGLLSRL GAAFNLDTRE DNVIRKYGDP GSLFGFSLAM
HWQLQPEDKR LLLVGAPRAE ALPLQRANRT GGLYSCDITA RGPCTRIEFD
NDADPTSESK EDQWMGVTVQ SQGPGGKVVT CAHRYEKRQH VNTKQESRDI
FGRCYVLSQN LRIEDDMDGG DWSFCDGRLR GHEKFGSCQQ GVAATFTKDF
HYIVFGAPGT YNWKGIVRVE QKNNTFFDMN IFEDGPYEVG GETEHDESLV
PVPANSYLGL LFLTSVSYTD PDQFVYKTRP PREQPDTFPD VMMNSYLGFS
LDSGKGIVSK DEITFVSGAP RANHSGAVVL LKRDMKSAHL LPEHIFDGEG
LASSFGYDVA VVDLNKDGWQ DIVIGAPQYF DRDGEVGGAV YVYMNQQGRW
NNVKPIRLNG TKDSMFGIAV KNIGDINQDG YPDIAVGAPY DDLGKVFIYH
GSANGINTKP TQVLKGISPY FGYSIAGNMD LDRNSYPDVA VGSLSDSVTI
FRSRPVINIQ KTITVTPNRI DLRQKTACGA PSGICLQVKS CFEYTANPAG
YNPSISIVGT LEAEKERRKS GLSSRVQFRN QGSEPKYTQE LTLKRQKQKV
CMEETLWLQD NIRDKLRPIP ITASVEIQEP SSRRRVNSLP EVLPILNSDE
PKTAHIDVHF LKEGCGDDNV CNSNLKLEYK FCTREGNQDK FSYLPIQKGV
PELVLKDQKD IALEITVTNS PSNPRNPTKD GDDAHEAKLI ATFPDTLTYS
AYRELRAFPE KQLSCVANQN GSQADCELGN PFKRNSNVTF YLVLSTTEVT
FDTPDLDINL KLETTSNQDN LAPITAKAKV VIELLLSVSG VAKPSQVYFG
GTVVGEQAMK SEDEVGSLIE YEFRVINLGK PLTNLGTATL NIQWPKEISN
GKWLLYLVKV ESKGLEKVTC EPQKEINSLN LTESHNSRKK REITEKQIDD
NRKFSLFAER KYQTLNCSVN VNCVNIRCPL RGLDSKASLI LRSRLWNSTF
LEEYSKLNYL DILMRAFIDV TAAAENIRLP NAGTQVRVTV FPSKTVAQYS
GVPWWIILVA ILAGILMLAL LVFILWKCGF FKRSRYDDSV PRYHAVRIRK
EEREIKDEKY IDNLEKKQWI TKWNENESYS

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Hogervorst F., Kuikman I., Geurts van Kessel A., Sonnenberg A. (1991). Molecular cloning of the human alpha 6 integrin subunit. Alternative splicing of alpha 6 mRNA and chromosomal localization of the alpha 6 and beta 4 genes. Eur. J. Biochem. 199: 425—433. PMID 2070796 doi:10.1111/j.1432-1033.1991.tb16140.x
  • Tamura R.N., Cooper H.M., Collo G., Quaranta V. (1991). Cell type-specific integrin variants with alternative alpha chain cytoplasmic domains. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 88: 10183—10187. PMID 1946438 doi:10.1073/pnas.88.22.10183
  • Catimel B., Parmentier S., Leung L.L., McGregor J.L. (1991). Separation of important new platelet glycoproteins (GPIa, GPIc, GPIc*, GPIIa and GMP-140) by F.P.L.C. Characterization by monoclonal antibodies and gas-phase sequencing. Biochem. J. 279: 419—425. PMID 1953640 doi:10.1042/bj2790419
  • Lewandrowski U., Moebius J., Walter U., Sickmann A. (2006). Elucidation of N-glycosylation sites on human platelet proteins: a glycoproteomic approach. Mol. Cell. Proteomics. 5: 226—233. PMID 16263699 doi:10.1074/mcp.M500324-MCP200
  • Pawar S.C., Demetriou M.C., Nagle R.B., Bowden G.T., Cress A.E. (2007). Integrin alpha6 cleavage: a novel modification to modulate cell migration. Exp. Cell Res. 313: 1080—1089. PMID 17303120 doi:10.1016/j.yexcr.2007.01.006

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з ITGA6 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Human PubMed Reference:.
  3. Mouse PubMed Reference:.
  4. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6142 (англ.) . Процитовано 28 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  5. UniProt, P23229 (англ.) . Архів оригіналу за 12 серпня 2017. Процитовано 28 серпня 2017.

Див. також