LRP1

LRP1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1CR8, 1D2L, 1J8E, 2FYJ, 2FYL, 2KNX, 2KNY
Ідентифікатори
Символи	LRP1, A2MR, APOER, APR, CD91, IGFBP3R, LRP, LRP1A, TGFBR5, low density lipoprotein receptor-related protein 1, LDL receptor related protein 1, KPA, IGFBP3R1, IGFBP-3R
Зовнішні ІД	OMIM: 107770 MGI: 96828 HomoloGene: 1744 GeneCards: LRP1
Пов'язані генетичні захворювання
	мігрень, migraine without aura, Аневризма черевної аорти
Онтологія гена
Молекулярна функція	• calcium ion binding; • apolipoprotein binding; • lipoprotein particle receptor binding; • GO:0032403 protein-containing complex binding; • зв’язування з іоном металу; • protease binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • low-density lipoprotein particle receptor activity; • RNA binding; • amyloid-beta binding; • scavenger receptor activity; • coreceptor activity; • alpha-2 macroglobulin receptor activity; • apolipoprotein receptor activity; • clathrin heavy chain binding; • signaling receptor activity; • cargo receptor activity; • heparan sulfate proteoglycan binding;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • endocytic vesicle membrane; • ендосома; • мембрана; • focal adhesion; • receptor complex; • клітинна мембрана; • integral component of plasma membrane; • lysosomal membrane; • soma; • дендрит (нейробіологія); • ядерце; • clathrin-coated pit; • clathrin-coated vesicle; • клітинне ядро; • цитоплазма; • гіалоплазма; • early endosome; • basolateral plasma membrane; • insulin-responsive compartment; • axonal growth cone; • apical part of cell; • plasma membrane protein complex;
Біологічний процес	• lipoprotein metabolic process; • GO:1904089 negative regulation of neuron apoptotic process; • negative regulation of platelet-derived growth factor receptor-beta signaling pathway; • negative regulation of neuron projection development; • ендоцитоз; • regulation of actin cytoskeleton organization; • regulation of phospholipase A2 activity; • amyloid-beta clearance; • negative regulation of Wnt signaling pathway; • GO:0010260 старіння людини; • negative regulation of smooth muscle cell migration; • positive regulation of lipid transport; • рецептор-опосередкований ендоцитоз; • aorta morphogenesis; • retinoid metabolic process; • regulation of cholesterol transport; • positive regulation of protein transport; • apoptotic cell clearance; • multicellular organism development; • protein kinase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway; • positive regulation of cholesterol efflux; • cerebral cortex development; • проліферація; • lipoprotein transport; • regulation of extracellular matrix disassembly; • astrocyte activation involved in immune response; • Обмін жирів; • Фагоцитоз; • positive regulation of cytosolic calcium ion concentration; • negative regulation of cell-substrate adhesion; • positive regulation of cell death; • positive regulation of neuron projection development; • receptor internalization; • positive regulation of protein binding; • positive regulation of insulin secretion involved in cellular response to glucose stimulus; • negative regulation of apoptotic process; • cellular lipid catabolic process; • Цитопемпсис; • positive regulation of axon extension; • positive regulation of endocytosis; • positive regulation of axon extension involved in regeneration; • positive regulation of collateral sprouting of injured axon; • positive regulation of phagocytosis; • negative regulation of cytosolic calcium ion concentration; • negative regulation of focal adhesion assembly; • negative regulation of cell death; • chemoattraction of axon; • positive regulation of ERK1 and ERK2 cascade; • amyloid-beta clearance by transcytosis; • amyloid-beta clearance by cellular catabolic process; • positive regulation of Schwann cell migration; • positive regulation of amyloid-beta clearance; • positive regulation of protein localization to plasma membrane; • positive regulation of cholesterol import; • cellular response to amyloid-beta; • positive regulation of vascular associated smooth muscle cell migration; • positive regulation of lysosomal protein catabolic process; • lysosomal transport;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	4035
	16971
	ENSG00000123384
	ENSMUSG00000040249
	Q07954
	Q91ZX7
	NM_002332
	NM_008512
	NP_002323
	NP_032538
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LRP1 (англ. LDL receptor related protein 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми. ^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 4 544 амінокислот, а молекулярна маса — 504 606^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLTPPLLLLL	PLLSALVAAA	IDAPKTCSPK	QFACRDQITC	ISKGWRCDGE
RDCPDGSDEA	PEICPQSKAQ	RCQPNEHNCL	GTELCVPMSR	LCNGVQDCMD
GSDEGPHCRE	LQGNCSRLGC	QHHCVPTLDG	PTCYCNSSFQ	LQADGKTCKD
FDECSVYGTC	SQLCTNTDGS	FICGCVEGYL	LQPDNRSCKA	KNEPVDRPPV
LLIANSQNIL	ATYLSGAQVS	TITPTSTRQT	TAMDFSYANE	TVCWVHVGDS
AAQTQLKCAR	MPGLKGFVDE	HTINISLSLH	HVEQMAIDWL	TGNFYFVDDI
DDRIFVCNRN	GDTCVTLLDL	ELYNPKGIAL	DPAMGKVFFT	DYGQIPKVER
CDMDGQNRTK	LVDSKIVFPH	GITLDLVSRL	VYWADAYLDY	IEVVDYEGKG
RQTIIQGILI	EHLYGLTVFE	NYLYATNSDN	ANAQQKTSVI	RVNRFNSTEY
QVVTRVDKGG	ALHIYHQRRQ	PRVRSHACEN	DQYGKPGGCS	DICLLANSHK
ARTCRCRSGF	SLGSDGKSCK	KPEHELFLVY	GKGRPGIIRG	MDMGAKVPDE
HMIPIENLMN	PRALDFHAET	GFIYFADTTS	YLIGRQKIDG	TERETILKDG
IHNVEGVAVD	WMGDNLYWTD	DGPKKTISVA	RLEKAAQTRK	TLIEGKMTHP
RAIVVDPLNG	WMYWTDWEED	PKDSRRGRLE	RAWMDGSHRD	IFVTSKTVLW
PNGLSLDIPA	GRLYWVDAFY	DRIETILLNG	TDRKIVYEGP	ELNHAFGLCH
HGNYLFWTEY	RSGSVYRLER	GVGGAPPTVT	LLRSERPPIF	EIRMYDAQQQ
QVGTNKCRVN	NGGCSSLCLA	TPGSRQCACA	EDQVLDADGV	TCLANPSYVP
PPQCQPGEFA	CANSRCIQER	WKCDGDNDCL	DNSDEAPALC	HQHTCPSDRF
KCENNRCIPN	RWLCDGDNDC	GNSEDESNAT	CSARTCPPNQ	FSCASGRCIP
ISWTCDLDDD	CGDRSDESAS	CAYPTCFPLT	QFTCNNGRCI	NINWRCDNDN
DCGDNSDEAG	CSHSCSSTQF	KCNSGRCIPE	HWTCDGDNDC	GDYSDETHAN
CTNQATRPPG	GCHTDEFQCR	LDGLCIPLRW	RCDGDTDCMD	SSDEKSCEGV
THVCDPSVKF	GCKDSARCIS	KAWVCDGDND	CEDNSDEENC	ESLACRPPSH
PCANNTSVCL	PPDKLCDGND	DCGDGSDEGE	LCDQCSLNNG	GCSHNCSVAP
GEGIVCSCPL	GMELGPDNHT	CQIQSYCAKH	LKCSQKCDQN	KFSVKCSCYE
GWVLEPDGES	CRSLDPFKPF	IIFSNRHEIR	RIDLHKGDYS	VLVPGLRNTI
ALDFHLSQSA	LYWTDVVEDK	IYRGKLLDNG	ALTSFEVVIQ	YGLATPEGLA
VDWIAGNIYW	VESNLDQIEV	AKLDGTLRTT	LLAGDIEHPR	AIALDPRDGI
LFWTDWDASL	PRIEAASMSG	AGRRTVHRET	GSGGWPNGLT	VDYLEKRILW
IDARSDAIYS	ARYDGSGHME	VLRGHEFLSH	PFAVTLYGGE	VYWTDWRTNT
LAKANKWTGH	NVTVVQRTNT	QPFDLQVYHP	SRQPMAPNPC	EANGGQGPCS
HLCLINYNRT	VSCACPHLMK	LHKDNTTCYE	FKKFLLYARQ	MEIRGVDLDA
PYYNYIISFT	VPDIDNVTVL	DYDAREQRVY	WSDVRTQAIK	RAFINGTGVE
TVVSADLPNA	HGLAVDWVSR	NLFWTSYDTN	KKQINVARLD	GSFKNAVVQG
LEQPHGLVVH	PLRGKLYWTD	GDNISMANMD	GSNRTLLFSG	QKGPVGLAID
FPESKLYWIS	SGNHTINRCN	LDGSGLEVID	AMRSQLGKAT	ALAIMGDKLW
WADQVSEKMG	TCSKADGSGS	VVLRNSTTLV	MHMKVYDESI	QLDHKGTNPC
SVNNGDCSQL	CLPTSETTRS	CMCTAGYSLR	SGQQACEGVG	SFLLYSVHEG
IRGIPLDPND	KSDALVPVSG	TSLAVGIDFH	AENDTIYWVD	MGLSTISRAK
RDQTWREDVV	TNGIGRVEGI	AVDWIAGNIY	WTDQGFDVIE	VARLNGSFRY
VVISQGLDKP	RAITVHPEKG	YLFWTEWGQY	PRIERSRLDG	TERVVLVNVS
ISWPNGISVD	YQDGKLYWCD	ARTDKIERID	LETGENREVV	LSSNNMDMFS
VSVFEDFIYW	SDRTHANGSI	KRGSKDNATD	SVPLRTGIGV	QLKDIKVFNR
DRQKGTNVCA	VANGGCQQLC	LYRGRGQRAC	ACAHGMLAED	GASCREYAGY
LLYSERTILK	SIHLSDERNL	NAPVQPFEDP	EHMKNVIALA	FDYRAGTSPG
TPNRIFFSDI	HFGNIQQIND	DGSRRITIVE	NVGSVEGLAY	HRGWDTLYWT
SYTTSTITRH	TVDQTRPGAF	ERETVITMSG	DDHPRAFVLD	ECQNLMFWTN
WNEQHPSIMR	AALSGANVLT	LIEKDIRTPN	GLAIDHRAEK	LYFSDATLDK
IERCEYDGSH	RYVILKSEPV	HPFGLAVYGE	HIFWTDWVRR	AVQRANKHVG
SNMKLLRVDI	PQQPMGIIAV	ANDTNSCELS	PCRINNGGCQ	DLCLLTHQGH
VNCSCRGGRI	LQDDLTCRAV	NSSCRAQDEF	ECANGECINF	SLTCDGVPHC
KDKSDEKPSY	CNSRRCKKTF	RQCSNGRCVS	NMLWCNGADD	CGDGSDEIPC
NKTACGVGEF	RCRDGTCIGN	SSRCNQFVDC	EDASDEMNCS	ATDCSSYFRL
GVKGVLFQPC	ERTSLCYAPS	WVCDGANDCG	DYSDERDCPG	VKRPRCPLNY
FACPSGRCIP	MSWTCDKEDD	CEHGEDETHC	NKFCSEAQFE	CQNHRCISKQ
WLCDGSDDCG	DGSDEAAHCE	GKTCGPSSFS	CPGTHVCVPE	RWLCDGDKDC
ADGADESIAA	GCLYNSTCDD	REFMCQNRQC	IPKHFVCDHD	RDCADGSDES
PECEYPTCGP	SEFRCANGRC	LSSRQWECDG	ENDCHDQSDE	APKNPHCTSQ
EHKCNASSQF	LCSSGRCVAE	ALLCNGQDDC	GDSSDERGCH	INECLSRKLS
GCSQDCEDLK	IGFKCRCRPG	FRLKDDGRTC	ADVDECSTTF	PCSQRCINTH
GSYKCLCVEG	YAPRGGDPHS	CKAVTDEEPF	LIFANRYYLR	KLNLDGSNYT
LLKQGLNNAV	ALDFDYREQM	IYWTDVTTQG	SMIRRMHLNG	SNVQVLHRTG
LSNPDGLAVD	WVGGNLYWCD	KGRDTIEVSK	LNGAYRTVLV	SSGLREPRAL
VVDVQNGYLY	WTDWGDHSLI	GRIGMDGSSR	SVIVDTKITW	PNGLTLDYVT
ERIYWADARE	DYIEFASLDG	SNRHVVLSQD	IPHIFALTLF	EDYVYWTDWE
TKSINRAHKT	TGTNKTLLIS	TLHRPMDLHV	FHALRQPDVP	NHPCKVNNGG
CSNLCLLSPG	GGHKCACPTN	FYLGSDGRTC	VSNCTASQFV	CKNDKCIPFW
WKCDTEDDCG	DHSDEPPDCP	EFKCRPGQFQ	CSTGICTNPA	FICDGDNDCQ
DNSDEANCDI	HVCLPSQFKC	TNTNRCIPGI	FRCNGQDNCG	DGEDERDCPE
VTCAPNQFQC	SITKRCIPRV	WVCDRDNDCV	DGSDEPANCT	QMTCGVDEFR
CKDSGRCIPA	RWKCDGEDDC	GDGSDEPKEE	CDERTCEPYQ	FRCKNNRCVP
GRWQCDYDND	CGDNSDEESC	TPRPCSESEF	SCANGRCIAG	RWKCDGDHDC
ADGSDEKDCT	PRCDMDQFQC	KSGHCIPLRW	RCDADADCMD	GSDEEACGTG
VRTCPLDEFQ	CNNTLCKPLA	WKCDGEDDCG	DNSDENPEEC	ARFVCPPNRP
FRCKNDRVCL	WIGRQCDGTD	NCGDGTDEED	CEPPTAHTTH	CKDKKEFLCR
NQRCLSSSLR	CNMFDDCGDG	SDEEDCSIDP	KLTSCATNAS	ICGDEARCVR
TEKAAYCACR	SGFHTVPGQP	GCQDINECLR	FGTCSQLCNN	TKGGHLCSCA
RNFMKTHNTC	KAEGSEYQVL	YIADDNEIRS	LFPGHPHSAY	EQAFQGDESV
RIDAMDVHVK	AGRVYWTNWH	TGTISYRSLP	PAAPPTTSNR	HRRQIDRGVT
HLNISGLKMP	RGIAIDWVAG	NVYWTDSGRD	VIEVAQMKGE	NRKTLISGMI
DEPHAIVVDP	LRGTMYWSDW	GNHPKIETAA	MDGTLRETLV	QDNIQWPTGL
AVDYHNERLY	WADAKLSVIG	SIRLNGTDPI	VAADSKRGLS	HPFSIDVFED
YIYGVTYINN	RVFKIHKFGH	SPLVNLTGGL	SHASDVVLYH	QHKQPEVTNP
CDRKKCEWLC	LLSPSGPVCT	CPNGKRLDNG	TCVPVPSPTP	PPDAPRPGTC
NLQCFNGGSC	FLNARRQPKC	RCQPRYTGDK	CELDQCWEHC	RNGGTCAASP
SGMPTCRCPT	GFTGPKCTQQ	VCAGYCANNS	TCTVNQGNQP	QCRCLPGFLG
DRCQYRQCSG	YCENFGTCQM	AADGSRQCRC	TAYFEGSRCE	VNKCSRCLEG
ACVVNKQSGD	VTCNCTDGRV	APSCLTCVGH	CSNGGSCTMN	SKMMPECQCP
PHMTGPRCEE	HVFSQQQPGH	IASILIPLLL	LLLLVLVAGV	VFWYKRRVQG
AKGFQHQRMT	NGAMNVEIGN	PTYKMYEGGE	PDDVGGLLDA	DFALDPDKPT
NFTNPVYATL	YMGGHGSRHS	LASTDEKREL	LGRGPEDEIG	DPLA

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, білків розвитку. Задіяний у такому біологічному процесі як ендоцитоз. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іоном кальцію. Локалізований у клітинній мембрані, цитоплазмі, ядрі, мембрані, клатрин-вкритих заглибинах мембрани.

Література

Van Leuven F., Stas L., Thiry E., Nelissen B., Miyake Y. (1998). Strategy to sequence the 89 exons of the human LRP1 gene coding for the lipoprotein receptor related protein: identification of one expressed mutation among 48 polymorphisms. Genomics. 52: 138—144. PMID 9782078 doi:10.1006/geno.1998.5408
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
May P., Reddy Y.K., Herz J. (2002). Proteolytic processing of low density lipoprotein receptor-related protein mediates regulated release of its intracellular domain. J. Biol. Chem. 277: 18736—18743. PMID 11907044 doi:10.1074/jbc.M201979200
Kinoshita A., Shah T., Tangredi M.M., Strickland D.K., Hyman B.T. (2003). The intracellular domain of the low density lipoprotein receptor-related protein modulates transactivation mediated by amyloid precursor protein and Fe65. J. Biol. Chem. 278: 41182—41188. PMID 12888553 doi:10.1074/jbc.M306403200
May P., Herz J. (2003). LDL receptor-related proteins in neurodevelopment. Traffic. 4: 291—301. PMID 12713657 doi:10.1034/j.1600-0854.2003.00086_4_5.x
Huang W., Dolmer K., Gettins P.G.W. (1999). NMR solution structure of complement-like repeat CR8 from the low density lipoprotein receptor-related protein. J. Biol. Chem. 274: 14130—14136. PMID 10318830 doi:10.1074/jbc.274.20.14130

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з LRP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6692 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, Q07954 (англ.) . Архів оригіналу за 2 грудня 2008. Процитовано 21 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 12

[1] Захворювання, генетично пов'язані з LRP1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6692 (англ.) . Процитовано 21 серпня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, Q07954 (англ.) . Архів оригіналу за 2 грудня 2008. Процитовано 21 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3 γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350