ITGB2

ITGB2
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	1L3Y, 1YUK, 2JF1, 2P26, 2P28, 3K6S, 3K71, 3K72, 2V7D, 4NEH, 4NEN, 5E6X, 5E6V, 5E6S, 5E6R, 5E6W, 5ES4, 5E6U
Ідентифікатори
Символи	ITGB2, CD18, LAD, LCAMB, LFA-1, MAC-1, MF17, MFI7, integrin subunit beta 2
Зовнішні ІД	OMIM: 600065 MGI: 96611 HomoloGene: 20092 GeneCards: ITGB2
Пов'язані генетичні захворювання
	leukocyte adhesion deficiency-1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0032403 protein-containing complex binding; • зв’язування з іоном металу; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein heterodimerization activity; • ICAM-3 receptor activity; • protein kinase binding; • cell adhesion molecule binding; • heat shock protein binding; • amyloid-beta binding; • complement component C3b binding; • integrin binding; • signaling receptor activity; • cargo receptor activity;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • extracellular vesicle; • integrin alphaL-beta2 complex; • мембрана; • клітинна мембрана; • receptor complex; • cell surface; • integrin complex; • екзосома; • specific granule membrane; • tertiary granule membrane; • ficolin-1-rich granule membrane; • focal adhesion; • external side of plasma membrane; • integrin alphaM-beta2 complex; • plasma membrane raft; • membrane raft; • cytoplasmic region; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• leukocyte cell-cell adhesion; • endodermal cell differentiation; • toll-like receptor 4 signaling pathway; • positive regulation of nitric oxide biosynthetic process; • heterotypic cell-cell adhesion; • cell-cell signaling; • GO:0010260 старіння людини; • receptor internalization; • leukocyte migration involved in inflammatory response; • natural killer cell activation; • cellular response to low-density lipoprotein particle stimulus; • extracellular matrix organization; • receptor clustering; • positive regulation of angiogenesis; • neutrophil chemotaxis; • адгезія клітин; • positive regulation of NF-kappaB transcription factor activity; • regulation of cell shape; • regulation of immune response; • cellular extravasation; • integrin-mediated signaling pathway; • cell-matrix adhesion; • inflammatory response; • endothelial cell migration; • leukocyte migration; • regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation; • GO:0097285 апоптоз; • Фагоцитоз; • neutrophil degranulation; • microglial cell activation; • рецептор-опосередкований ендоцитоз; • phagocytosis, engulfment; • cell migration; • cytokine-mediated signaling pathway; • positive regulation of superoxide anion generation; • cell adhesion mediated by integrin; • positive regulation of neutrophil degranulation; • negative regulation of dopamine metabolic process; • positive regulation of protein targeting to membrane; • amyloid-beta clearance; • cell-cell adhesion; • cell-cell adhesion via plasma-membrane adhesion molecules; • positive regulation of neuron death; • positive regulation of microglial cell activation; • neutrophil migration; • positive regulation of prostaglandin-E synthase activity; • positive regulation of leukocyte adhesion to vascular endothelial cell;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	3689
	16414
	ENSG00000160255
	ENSMUSG00000000290
	P05107
	P11835
	NM_000211; NM_001127491; NM_001303238
	NM_008404
	NP_000202; NP_001120963; NP_001290167
	NP_032430
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

ITGB2 (англ. Integrin subunit beta 2) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 21-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 769 амінокислот, а молекулярна маса — 84 782^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLGLRPPLLA	LVGLLSLGCV	LSQECTKFKV	SSCRECIESG	PGCTWCQKLN
FTGPGDPDSI	RCDTRPQLLM	RGCAADDIMD	PTSLAETQED	HNGGQKQLSP
QKVTLYLRPG	QAAAFNVTFR	RAKGYPIDLY	YLMDLSYSML	DDLRNVKKLG
GDLLRALNEI	TESGRIGFGS	FVDKTVLPFV	NTHPDKLRNP	CPNKEKECQP
PFAFRHVLKL	TNNSNQFQTE	VGKQLISGNL	DAPEGGLDAM	MQVAACPEEI
GWRNVTRLLV	FATDDGFHFA	GDGKLGAILT	PNDGRCHLED	NLYKRSNEFD
YPSVGQLAHK	LAENNIQPIF	AVTSRMVKTY	EKLTEIIPKS	AVGELSEDSS
NVVQLIKNAY	NKLSSRVFLD	HNALPDTLKV	TYDSFCSNGV	THRNQPRGDC
DGVQINVPIT	FQVKVTATEC	IQEQSFVIRA	LGFTDIVTVQ	VLPQCECRCR
DQSRDRSLCH	GKGFLECGIC	RCDTGYIGKN	CECQTQGRSS	QELEGSCRKD
NNSIICSGLG	DCVCGQCLCH	TSDVPGKLIY	GQYCECDTIN	CERYNGQVCG
GPGRGLCFCG	KCRCHPGFEG	SACQCERTTE	GCLNPRRVEC	SGRGRCRCNV
CECHSGYQLP	LCQECPGCPS	PCGKYISCAE	CLKFEKGPFG	KNCSAACPGL
QLSNNPVKGR	TCKERDSEGC	WVAYTLEQQD	GMDRYLIYVD	ESRECVAGPN
IAAIVGGTVA	GIVLIGILLL	VIWKALIHLS	DLREYRRFEK	EKLKSQWNND
NPLFKSATTT	VMNPKFAES

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів, фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів. Локалізований у мембрані.

Література

Kishimoto T.K., O'Connor K., Lee A., Roberts T.M., Springer T.A. (1987). Cloning of the beta subunit of the leukocyte adhesion proteins: homology to an extracellular matrix receptor defines a novel supergene family. Cell. 48: 681—690. PMID 3028646 doi:10.1016/0092-8674(87)90246-7
Weitzman J.B., Wells C.E., Wright A.H., Clark P.A., Law S.K.A. (1991). The gene organisation of the human beta 2 integrin subunit (CD18). FEBS Lett. 294: 97—103. PMID 1683838 doi:10.1016/0014-5793(91)81351-8
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Ohashi Y., Yambe T., Tsuchiya S., Kikuchi H., Konno T. (1993). Familial genetic defect in a case of leukocyte adhesion deficiency. Hum. Mutat. 2: 458—467. PMID 7509236 doi:10.1002/humu.1380020606
Fagerholm S., Morrice N., Gahmberg C.G., Cohen P. (2002). Phosphorylation of the cytoplasmic domain of the integrin CD18 chain by protein kinase C isoforms in leukocytes. J. Biol. Chem. 277: 1728—1738. PMID 11700305 doi:10.1074/jbc.M106856200
Ostermann G., Weber K.S., Zernecke A., Schroeder A., Weber C. (2002). JAM-1 is a ligand of the beta(2) integrin LFA-1 involved in transendothelial migration of leukocytes. Nat. Immunol. 3: 151—158. PMID 11812992 doi:10.1038/ni755

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з ITGB2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6155 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P05107 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 21

[1] Захворювання, генетично пов'язані з ITGB2 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6155 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P05107 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

Білки: кластери диференціації
1-50	CD1 a-c 1A 1D 1E CD2 CD3 γ δ ε CD4 CD5 CD6 CD7 CD8 a CD9 CD10 CD11 a b c d CD13 CD14 CD15 CD16 A B CD18 CD19 CD20 CD21 CD22 CD23 CD24 CD25 CD26 CD27 CD28 CD29 CD30 CD31 CD32 A B CD33 CD34 CD35 CD36 CD37 CD38 CD39 CD40 CD41 CD42 a b c d CD43 CD44 CD45 CD46 CD47 CD48 CD49 a b c d e f CD50
51-100	CD51 CD52 CD53 CD54 CD55 CD56 CD57 CD58 CD59 CD61 CD62 E L P CD63 CD64 A B C CD66 a b c d e f CD68 CD69 CD70 CD71 CD72 CD73 CD74 CD78 CD79 a b CD80 CD81 CD82 CD83 CD84 CD85 a d e h j k CD86 CD87 CD88 CD89 CD90 CD91 CD92 CD93 CD94 CD95 CD96 CD97 CD98 CD99 CD100
101-150	CD101 CD102 CD103 CD104 CD105 CD106 CD107 a b CD108 CD109 CD110 CD111 CD112 CD113 CD114 CD115 CD116 CD117 CD118 CD119 CD120 a b CD121 a b CD122 CD123 CD124 CD125 CD126 CD127 CD129 CD130 CD131 CD132 CD133 CD134 CD135 CD136 CD137 CD138 CD140b CD141 CD142 CD143 CD144 CD146 CD147 CD148 CD150
151-200	CD151 CD152 CD153 CD154 CD155 CD156 a b c CD157 CD158 (a d e i k) CD159 a c CD160 CD161 CD162 CD163 CD164 CD166 CD167 a b CD168 CD169 CD170 CD171 CD172 a b g CD174 CD177 CD178 CD179 a b CD180 CD181 CD182 CD183 CD184 CD185 CD186 CD191 CD192 CD193 CD194 CD195 CD196 CD197 CDw198 CDw199 CD200
201-250	CD201 CD202b CD204 CD205 CD206 CD207 CD208 CD209 CDw210 a b CD212 CD213a 1 2 CD217 CD218 (a b) CD220 CD221 CD222 CD223 CD224 CD225 CD226 CD227 CD228 CD229 CD230 CD233 CD234 CD235 a b CD236 CD238 CD239 CD240CE CD240D CD241 CD243 CD244 CD246 CD247 CD248 CD249
251-300	CD252 CD253 CD254 CD256 CD257 CD258 CD261 CD262 CD263 CD264 CD265 CD266 CD267 CD268 CD269 CD271 CD272 CD273 CD274 CD275 CD276 CD278 CD279 CD280 CD281 CD282 CD283 CD284 CD286 CD288 CD289 CD290 CD292 CDw293 CD294 CD295 CD297 CD298 CD299
301-350	CD300A CD301 CD302 CD303 CD304 CD305 CD306 CD307 CD309 CD312 CD314 CD315 CD316 CD317 CD318 CD320 CD321 CD322 CD324 CD325 CD326 CD328 CD329 CD331 CD332 CD333 CD334 CD335 CD336 CD337 CD338 CD339 CD340 CD344 CD349 CD350