ITGB4

ITGB4
Ідентифікатори
Символи
Зовнішні ІД GeneCards: [1]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
н/д
н/д
Ensembl
н/д
н/д
UniProt
н/д
н/д
RefSeq (мРНК)
н/д
н/д
RefSeq (білок)
н/д
н/д
Локус (UCSC) н/д н/д
PubMed search н/д н/д
Вікідані
Див./Ред. для людей

ITGB4 (англ. Integrin subunit beta 4) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 17-ї хромосоми.[1] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 822 амінокислот, а молекулярна маса — 202 167[2].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAGPRPSPWA RLLLAALISV SLSGTLANRC KKAPVKSCTE CVRVDKDCAY
CTDEMFRDRR CNTQAELLAA GCQRESIVVM ESSFQITEET QIDTTLRRSQ
MSPQGLRVRL RPGEERHFEL EVFEPLESPV DLYILMDFSN SMSDDLDNLK
KMGQNLARVL SQLTSDYTIG FGKFVDKVSV PQTDMRPEKL KEPWPNSDPP
FSFKNVISLT EDVDEFRNKL QGERISGNLD APEGGFDAIL QTAVCTRDIG
WRPDSTHLLV FSTESAFHYE ADGANVLAGI MSRNDERCHL DTTGTYTQYR
TQDYPSVPTL VRLLAKHNII PIFAVTNYSY SYYEKLHTYF PVSSLGVLQE
DSSNIVELLE EAFNRIRSNL DIRALDSPRG LRTEVTSKMF QKTRTGSFHI
RRGEVGIYQV QLRALEHVDG THVCQLPEDQ KGNIHLKPSF SDGLKMDAGI
ICDVCTCELQ KEVRSARCSF NGDFVCGQCV CSEGWSGQTC NCSTGSLSDI
QPCLREGEDK PCSGRGECQC GHCVCYGEGR YEGQFCEYDN FQCPRTSGFL
CNDRGRCSMG QCVCEPGWTG PSCDCPLSNA TCIDSNGGIC NGRGHCECGR
CHCHQQSLYT DTICEINYSA IHPGLCEDLR SCVQCQAWGT GEKKGRTCEE
CNFKVKMVDE LKRAEEVVVR CSFRDEDDDC TYSYTMEGDG APGPNSTVLV
HKKKDCPPGS FWWLIPLLLL LLPLLALLLL LCWKYCACCK ACLALLPCCN
RGHMVGFKED HYMLRENLMA SDHLDTPMLR SGNLKGRDVV RWKVTNNMQR
PGFATHAASI NPTELVPYGL SLRLARLCTE NLLKPDTREC AQLRQEVEEN
LNEVYRQISG VHKLQQTKFR QQPNAGKKQD HTIVDTVLMA PRSAKPALLK
LTEKQVEQRA FHDLKVAPGY YTLTADQDAR GMVEFQEGVE LVDVRVPLFI
RPEDDDEKQL LVEAIDVPAG TATLGRRLVN ITIIKEQARD VVSFEQPEFS
VSRGDQVARI PVIRRVLDGG KSQVSYRTQD GTAQGNRDYI PVEGELLFQP
GEAWKELQVK LLELQEVDSL LRGRQVRRFH VQLSNPKFGA HLGQPHSTTI
IIRDPDELDR SFTSQMLSSQ PPPHGDLGAP QNPNAKAAGS RKIHFNWLPP
SGKPMGYRVK YWIQGDSESE AHLLDSKVPS VELTNLYPYC DYEMKVCAYG
AQGEGPYSSL VSCRTHQEVP SEPGRLAFNV VSSTVTQLSW AEPAETNGEI
TAYEVCYGLV NDDNRPIGPM KKVLVDNPKN RMLLIENLRE SQPYRYTVKA
RNGAGWGPER EAIINLATQP KRPMSIPIIP DIPIVDAQSG EDYDSFLMYS
DDVLRSPSGS QRPSVSDDTG CGWKFEPLLG EELDLRRVTW RLPPELIPRL
SASSGRSSDA EAPHGPPDDG GAGGKGGSLP RSATPGPPGE HLVNGRMDFA
FPGSTNSLHR MTTTSAAAYG THLSPHVPHR VLSTSSTLTR DYNSLTRSEH
SHSTTLPRDY STLTSVSSHD SRLTAGVPDT PTRLVFSALG PTSLRVSWQE
PRCERPLQGY SVEYQLLNGG ELHRLNIPNP AQTSVVVEDL LPNHSYVFRV
RAQSQEGWGR EREGVITIES QVHPQSPLCP LPGSAFTLST PSAPGPLVFT
ALSPDSLQLS WERPRRPNGD IVGYLVTCEM AQGGGPATAF RVDGDSPESR
LTVPGLSENV PYKFKVQART TEGFGPEREG IITIESQDGG PFPQLGSRAG
LFQHPLQSEY SSITTTHTSA TEPFLVDGLT LGAQHLEAGG SLTRHVTQEF
VSRTLTTSGT LSTHMDQQFF QT

Кодований геном білок за функціями належить до рецепторів, інтегринів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані, клітинних контактах.

Література

  • Iacovacci S., Gagnoux-Palacios L., Zambruno G., Meneguzzi G., D'Alessio M. (1997). Genomic organization of the human integrin beta 4 gene. Mamm. Genome. 8: 448—450. PMID 9166594 doi:10.1007/s003359900467
  • van Leusden M.R., Kuikman I., Sonnenberg A. (1997). The unique cytoplasmic domain of the human integrin variant beta4E is produced by partial retention of intronic sequences. Biochem. Biophys. Res. Commun. 235: 826—830. PMID 9207246 doi:10.1006/bbrc.1997.6892
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Hopkinson S.B., Jones J.C. (2000). The N terminus of the transmembrane protein BP180 interacts with the N-terminal domain of BP230, thereby mediating keratin cytoskeleton anchorage to the cell surface at the site of the hemidesmosome. Mol. Biol. Cell. 11: 277—286. PMID 10637308 doi:10.1091/mbc.11.1.277
  • Koster J., Geerts D., Favre B., Borradori L., Sonnenberg A. (2003). Analysis of the interactions between BP180, BP230, plectin and the integrin alpha6beta4 important for hemidesmosome assembly. J. Cell Sci. 116: 387—399. PMID 12482924 doi:10.1242/jcs.00241
  • Beausoleil S.A., Villen J., Gerber S.A., Rush J., Gygi S.P. (2006). A probability-based approach for high-throughput protein phosphorylation analysis and site localization. Nat. Biotechnol. 24: 1285—1292. PMID 16964243 doi:10.1038/nbt1240

Примітки

  1. ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6158 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-21 у Wayback Machine.]
  2. ↑ UniProt, P16144 (англ.) . Архів оригіналу за 21 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

This article is issued from Вікіпедія. The text is available under Creative Commons Attribution-Share Alike 4.0 unless otherwise noted. Additional terms may apply for the media files.