GAN

GAN
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2PPI, 3HVE
Ідентифікатори
Символи	GAN, GAN1, KLHL16, gigaxonin, GIG, giant axonal neuropathy gene, GAN gene
Зовнішні ІД	OMIM: 605379 MGI: 1890619 HomoloGene: 32523 GeneCards: GAN
Пов'язані генетичні захворювання
	giant axonal neuropathy
Онтологія гена
Молекулярна функція	• GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • GO:0050372 ubiquitin-protein transferase activity; • молекулярна функція;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • Cul3-RING ubiquitin ligase complex; • цитоскелет; • гіалоплазма;
Біологічний процес	• cytoskeleton organization; • Убіквітин-залежний протеоліз; • посттрансляційна модифікація;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	8139
	209239
	ENSG00000261609
	ENSMUSG00000052557
	Q9H2C0
	Q8CA72
	NM_022041; NM_001377486
	NM_001081151
	NP_071324
	NP_001074620
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

GAN (англ. Gigaxonin) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 597 амінокислот, а молекулярна маса — 67 638^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAEGSAVSDP	QHAARLLRAL	SSFREESRFC	DAHLVLDGEE	IPVQKNILAA
ASPYIRTKLN	YNPPKDDGST	YKIELEGISV	MVMREILDYI	FSGQIRLNED
TIQDVVQAAD	LLLLTDLKTL	CCEFLEGCIA	AENCIGIRDF	ALHYCLHHVH
YLATEYLETH	FRDVSSTEEF	LELSPQKLKE	VISLEKLNVG	NERYVFEAVI
RWIAHDTEIR	KVHMKDVMSA	LWVSGLDSSY	LREQMLNEPL	VREIVKECSN
IPLSQPQQGE	AMLANFKPRG	YSECIVTVGG	EERVSRKPTA	AMRCMCPLYD
PNRQLWIELA	PLSMPRINHG	VLSAEGFLFV	FGGQDENKQT	LSSGEKYDPD
ANTWTALPPM	NEARHNFGIV	EIDGMLYILG	GEDGEKELIS	MECYDIYSKT
WTKQPDLTMV	RKIGCYAAMK	KKIYAMGGGS	YGKLFESVEC	YDPRTQQWTA
ICPLKERRFG	AVACGVAMEL	YVFGGVRSRE	DAQGSEMVTC	KSEFYHDEFK
RWIYLNDQNL	CIPASSSFVY	GAVPIGASIY	VIGDLDTGTN	YDYVREFKRS
TGTWHHTKPL	LPSDLRRTGC	AALRIANCKL	FRLQLQQGLF	RIRVHSP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як убіквітинування білків. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Furukawa M., He Y.J., Borchers C., Xiong Y. (2003). Targeting of protein ubiquitination by BTB-Cullin 3-Roc1 ubiquitin ligases. Nat. Cell Biol. 5: 1001—1007. PMID 14528312 doi:10.1038/ncb1056
Wang X.J., Zhang D.D. (2009). Ectodermal-neural cortex 1 down-regulates Nrf2 at the translational level. PLoS ONE. 4: E5492—E5492. PMID 19424503 doi:10.1371/journal.pone.0005492

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з GAN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4137 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-26 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9H2C0 (англ.) . Архів оригіналу за 12 листопада 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 16

[1] Захворювання, генетично пов'язані з GAN переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:4137 (англ.) . Архів оригіналу за 26 вересня 2017. Процитовано 11 вересня 2017. [Архівовано 2017-09-26 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q9H2C0 (англ.) . Архів оригіналу за 12 листопада 2017. Процитовано 11 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]