KIF16B

KIF16B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2V14
Ідентифікатори
Символи	KIF16B, C20orf23, KISC20ORF, SNX23, kinesin family member 16B
Зовнішні ІД	OMIM: 618171 MGI: 1098240 HomoloGene: 135708 GeneCards: KIF16B
Пов'язані генетичні захворювання
	ileal neoplasm
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • microtubule motor activity; • phosphatidylinositol-3-phosphate binding; • microtubule binding; • phosphatidylinositol-3,5-bisphosphate binding; • phosphatidylinositol-3,4-bisphosphate binding; • phosphatidylinositol binding; • plus-end-directed microtubule motor activity; • ATP binding; • phosphatidylinositol-3,4,5-trisphosphate binding; • lipid binding; • ATPase activity;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • ендосома; • early endosome membrane; • мембрана; • Кінезин; • early endosome; • мікротрубочка; • цитоскелет; • гіалоплазма; • phagocytic vesicle;
Біологічний процес	• endoderm development; • epidermal growth factor receptor signaling pathway; • Golgi to endosome transport; • receptor catabolic process; • fibroblast growth factor receptor signaling pathway; • microtubule-based movement; • early endosome to late endosome transport; • formation of primary germ layer; • regulation of receptor recycling; • cellular response to interferon-gamma;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	55614
	16558
	ENSG00000089177
	ENSMUSG00000038844
	Q96L93
	B1AVY7
	NM_001199865; NM_001199866; NM_024704
	NM_001081133; NM_001355123
	NP_001186794; NP_001186795; NP_078980
	NP_001074602; NP_001342052
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

KIF16B (англ. Kinesin family member 16B) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 317 амінокислот, а молекулярна маса — 152 011^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MASVKVAVRV	RPMNRREKDL	EAKFIIQMEK	SKTTITNLKI	PEGGTGDSGR
ERTKTFTYDF	SFYSADTKSP	DYVSQEMVFK	TLGTDVVKSA	FEGYNACVFA
YGQTGSGKSY	TMMGNSGDSG	LIPRICEGLF	SRINETTRWD	EASFRTEVSY
LEIYNERVRD	LLRRKSSKTF	NLRVREHPKE	GPYVEDLSKH	LVQNYGDVEE
LMDAGNINRT	TAATGMNDVS	SRSHAIFTIK	FTQAKFDSEM	PCETVSKIHL
VDLAGSERAD	ATGATGVRLK	EGGNINKSLV	TLGNVISALA	DLSQDAANTL
AKKKQVFVPY	RDSVLTWLLK	DSLGGNSKTI	MIATISPADV	NYGETLSTLR
YANRAKNIIN	KPTINEDANV	KLIRELRAEI	ARLKTLLAQG	NQIALLDSPT
ALSMEEKLQQ	NEARVQELTK	EWTNKWNETQ	NILKEQTLAL	RKEGIGVVLD
SELPHLIGID	DDLLSTGIIL	YHLKEGQTYV	GRDDASTEQD	IVLHGLDLES
EHCIFENIGG	TVTLIPLSGS	QCSVNGVQIV	EATHLNQGAV	ILLGRTNMFR
FNHPKEAAKL	REKRKSGLLS	SFSLSMTDLS	KSRENLSAVM	LYNPGLEFER
QQREELEKLE	SKRKLIEEME	EKQKSDKAEL	ERMQQEVETQ	RKETEIVQLQ
IRKQEESLKR	RSFHIENKLK	DLLAEKEKFE	EERLREQQEI	ELQKKRQEEE
TFLRVQEELQ	RLKELNNNEK	AEKFQIFQEL	DQLQKEKDEQ	YAKLELEKKR
LEEQEKEQVM	LVAHLEEQLR	EKQEMIQLLR	RGEVQWVEEE	KRDLEGIRES
LLRVKEARAG	GDEDGEELEK	AQLRFFEFKR	RQLVKLVNLE	KDLVQQKDIL
KKEVQEEQEI	LECLKCEHDK	ESRLLEKHDE	SVTDVTEVPQ	DFEKIKPVEY
RLQYKERQLQ	YLLQNHLPTL	LEEKQRAFEI	LDRGPLSLDN	TLYQVEKEME
EKEEQLAQYQ	ANANQLQKLQ	ATFEFTANIA	RQEEKVRKKE	KEILESREKQ
QREALERALA	RLERRHSALQ	RHSTLGMEIE	EQRQKLASLN	SGSREQSGLQ
ASLEAEQEAL	EKDQERLEYE	IQQLKQKIYE	VDGVQKDHHG	TLEGKVASSS
LPVSAEKSHL	VPLMDARINA	YIEEEVQRRL	QDLHRVISEG	CSTSADTMKD
NEKLHNGTIQ	RKLKYERMVS	RSLGANPDDL	KDPIKISIPR	YVLCGQGKDA
HFEFEVKITV	LDETWTVFRR	YSRFREMHKT	LKLKYAELAA	LEFPPKKLFG
NKDERVIAER	RSHLEKYLRD	FFSVMLQSAT	SPLHINKVGL	TLSKHTICEF
SPFFKKGVFD	YSSHGTG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, ліпідами. Локалізований у цитоплазмі, цитоскелеті, мембрані, ендосомах.

Література

Nagase T., Kikuno R., Nakayama M., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVIII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 273—281. PMID 10997877 doi:10.1093/dnares/7.4.271
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з KIF16B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15869 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-11 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q96L93 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

[1] Захворювання, генетично пов'язані з KIF16B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:15869 (англ.) . Архів оригіналу за 11 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-11 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q96L93 (англ.) . Архів оригіналу за 5 вересня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]