MYO5B

MYO5B
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4J5M, 4LNZ, 4LWZ, 4LX0
Ідентифікатори
Символи	MYO5B, myosin VB, MVID1, DIAR2, PFIC10
Зовнішні ІД	OMIM: 606540 MGI: 106598 HomoloGene: 49481 GeneCards: MYO5B
Пов'язані генетичні захворювання
	microvillus inclusion disease
Онтологія гена
Молекулярна функція	• nucleotide binding; • calmodulin binding; • microfilament motor activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • actin binding; • cytoskeletal motor activity; • ATP binding; • actin filament binding;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • recycling endosome; • apical cortex; • екзосома; • cytoplasmic vesicle membrane; • myosin complex; • GO:0009327 protein-containing complex;
Біологічний процес	• renal water homeostasis; • protein transport; • vesicle-mediated transport; • GO:0015915 транспорт; • endosomal transport;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	4645
	17919
	ENSG00000167306
	ENSMUSG00000025885
	Q9ULV0
	P21271
	NM_001080467
	NM_008661; NM_201600
	NP_001073936
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

MYO5B (англ. Myosin VB) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 848 амінокислот, а молекулярна маса — 213 672^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MSVGELYSQC	TRVWIPDPDE	VWRSAELTKD	YKEGDKSLQL	RLEDETILEY
PIDVQRNQLP	FLRNPDILVG	ENDLTALSYL	HEPAVLHNLK	VRFLESNHIY
TYCGIVLVAI	NPYEQLPIYG	QDVIYTYSGQ	NMGDMDPHIF	AVAEEAYKQM
ARDEKNQSII	VSGESGAGKT	VSAKYAMRYF	ATVGGSASET	NIEEKVLASS
PIMEAIGNAK	TTRNDNSSRF	GKYIQIGFDK	RYHIIGANMR	TYLLEKSRVV
FQADDERNYH	IFYQLCAAAG	LPEFKELALT	SAEDFFYTSQ	GGDTSIEGVD
DAEDFEKTRQ	AFTLLGVKES	HQMSIFKIIA	SILHLGSVAI	QAERDGDSCS
ISPQDVYLSN	FCRLLGVEHS	QMEHWLCHRK	LVTTSETYVK	TMSLQQVINA
RNALAKHIYA	QLFGWIVEHI	NKALHTSLKQ	HSFIGVLDIY	GFETFEVNSF
EQFCINYANE	KLQQQFNSHV	FKLEQEEYMK	EQIPWTLIDF	YDNQPCIDLI
EAKLGILDLL	DEECKVPKGT	DQNWAQKLYD	RHSSSQHFQK	PRMSNTAFII
VHFADKVEYL	SDGFLEKNRD	TVYEEQINIL	KASKFPLVAD	LFHDDKDPVP
ATTPGKGSSS	KISVRSARPP	MKVSNKEHKK	TVGHQFRTSL	HLLMETLNAT
TPHYVRCIKP	NDEKLPFHFD	PKRAVQQLRA	CGVLETIRIS	AAGYPSRWAY
HDFFNRYRVL	VKKRELANTD	KKAICRSVLE	NLIKDPDKFQ	FGRTKIFFRA
GQVAYLEKLR	ADKFRTATIM	IQKTVRGWLQ	KVKYHRLKGA	TLTLQRYCRG
HLARRLAEHL	RRIRAAVVLQ	KHYRMQRARQ	AYQRVRRAAV	VIQAFTRAMF
VRRTYRQVLM	EHKATTIQKH	VRGWMARRHF	QRLRDAAIVI	QCAFRMLKAR
RELKALRIEA	RSAEHLKRLN	VGMENKVVQL	QRKIDEQNKE	FKTLSEQLSV
TTSTYTMEVE	RLKKELVHYQ	QSPGEDTSLR	LQEEVESLRT	ELQRAHSERK
ILEDAHSREK	DELRKRVADL	EQENALLKDE	KEQLNNQILC	QSKDEFAQNS
VKENLMKKEL	EEERSRYQNL	VKEYSQLEQR	YDNLRDEMTI	IKQTPGHRRN
PSNQSSLESD	SNYPSISTSE	IGDTEDALQQ	VEEIGLEKAA	MDMTVFLKLQ
KRVRELEQER	KKLQVQLEKR	EQQDSKKVQA	EPPQTDIDLD	PNADLAYNSL
KRQELESENK	KLKNDLNELR	KAVADQATQN	NSSHGSPDSY	SLLLNQLKLA
HEELEVRKEE	VLILRTQIVS	ADQRRLAGRN	AEPNINARSS	WPNSEKHVDQ
EDAIEAYHGV	CQTNSKTEDW	GYLNEDGELG	LAYQGLKQVA	RLLEAQLQAQ
SLEHEEEVEH	LKAQLEALKE	EMDKQQQTFC	QTLLLSPEAQ	VEFGVQQEIS
RLTNENLDLK	ELVEKLEKNE	RKLKKQLKIY	MKKAQDLEAA	QALAQSERKR
HELNRQVTVQ	RKEKDFQGML	EYHKEDEALL	IRNLVTDLKP	QMLSGTVPCL
PAYILYMCIR	HADYTNDDLK	VHSLLTSTIN	GIKKVLKKHN	DDFEMTSFWL
SNTCRLLHCL	KQYSGDEGFM	TQNTAKQNEH	CLKNFDLTEY	RQVLSDLSIQ
IYQQLIKIAE	GVLQPMIVSA	MLENESIQGL	SGVKPTGYRK	RSSSMADGDN
SYCLEAIIRQ	MNAFHTVMCD	QGLDPEIILQ	VFKQLFYMIN	AVTLNNLLLR
KDVCSWSTGM	QLRYNISQLE	EWLRGRNLHQ	SGAVQTMEPL	IQAAQLLQLK
KKTQEDAEAI	CSLCTSLSTQ	QIVKILNLYT	PLNEFEERVT	VAFIRTIQAQ
LQERNDPQQL	LLDAKHMFPV	LFPFNPSSLT	MDSIHIPACL	NLEFLNEV

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить до білкових моторів, міозинів, фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, як транспорт, транспорт білків, ацетилювання, альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з АТФ, нуклеотидами, молекулою актину, молекулою кальмодуліну. Локалізований у цитоплазмі.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Erickson R.P., Larson-Thome K., Valenzuela R.K., Whitaker S.E., Shub M.D. (2008). Navajo microvillous inclusion disease is due to a mutation in MYO5B. Am. J. Med. Genet. A. 146A: 3117—3119. PMID 19006234 doi:10.1002/ajmg.a.32605

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з MYO5B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7603 (англ.) . Архів оригіналу за 20 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-20 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9ULV0 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 18

[1] Захворювання, генетично пов'язані з MYO5B переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:7603 (англ.) . Архів оригіналу за 20 березня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-20 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, Q9ULV0 (англ.) . Архів оригіналу за 19 серпня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]