COL12A1
COL12A1 (англ. Collagen type XII alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 063 амінокислот, а молекулярна маса — 333 147[5].
Послідовність амінокислот
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
| MRSRLPPALA | ALGAALLLSS | IEAEVDPPSD | LNFKIIDENT | VHMSWAKPVD | ||||
| PIVGYRITVD | PTTDGPTKEF | TLSASTTETL | LSELVPETEY | VVTITSYDEV | ||||
| EESVPVIGQL | TIQTGSSTKP | VEKKPGKTEI | QKCSVSAWTD | LVFLVDGSWS | ||||
| VGRNNFKYIL | DFIAALVSAF | DIGEEKTRVG | VVQYSSDTRT | EFNLNQYYQR | ||||
| DELLAAIKKI | PYKGGNTMTG | DAIDYLVKNT | FTESAGARVG | FPKVAIIITD | ||||
| GKSQDEVEIP | ARELRNVGVE | VFSLGIKAAD | AKELKQIAST | PSLNHVFNVA | ||||
| NFDAIVDIQN | EIISQVCSGV | DEQLGELVSG | EEVVEPPSNL | IAMEVSSKYV | ||||
| KLNWNPSPSP | VTGYKVILTP | MTAGSRQHAL | SVGPQTTTLS | VRDLSADTEY | ||||
| QISVSAMKGM | TSSEPISIME | KTQPMKVQVE | CSRGVDIKAD | IVFLVDGSYS | ||||
| IGIANFVKVR | AFLEVLVKSF | EISPNRVQIS | LVQYSRDPHT | EFTLKKFTKV | ||||
| EDIIEAINTF | PYRGGSTNTG | KAMTYVREKI | FVPSKGSRSN | VPKVMILITD | ||||
| GKSSDAFRDP | AIKLRNSDVE | IFAVGVKDAV | RSELEAIASP | PAETHVFTVE | ||||
| DFDAFQRISF | ELTQSICLRI | EQELAAIKKK | AYVPPKDLSF | SEVTSYGFKT | ||||
| NWSPAGENVF | SYHITYKEAA | GDDEVTVVEP | ASSTSVVLSS | LKPETLYLVN | ||||
| VTAEYEDGFS | IPLAGEETTE | EVKGAPRNLK | VTDETTDSFK | ITWTQAPGRV | ||||
| LRYRIIYRPV | AGGESREVTT | PPNQRRRTLE | NLIPDTKYEV | SVIPEYFSGP | ||||
| GTPLTGNAAT | EEVRGNPRDL | RVSDPTTSTM | KLSWSGAPGK | VKQYLVTYTP | ||||
| VAGGETQEVT | VRGDTTNTVL | QGLKEGTQYA | LSVTALYASG | AGDALFGEGT | ||||
| TLEERGSPQD | LVTKDITDTS | IGAYWTSAPG | MVRGYRVSWK | SLYDDVDTGE | ||||
| KNLPEDAIHT | MIENLQPETK | YRISVFATYS | SGEGEPLTGD | ATTELSQDSK | ||||
| TLKVDEETEN | TMRVTWKPAP | GKVVNYRVVY | RPHGRGKQMV | AKVPPTVTST | ||||
| VLKRLQPQTT | YDITVLPIYK | MGEGKLRQGS | GTTASRFKSP | RNLKTSDPTM | ||||
| SSFRVTWEPA | PGEVKGYKVT | FHPTGDDRRL | GELVVGPYDN | TVVLEELRAG | ||||
| TTYKVNVFGM | FDGGESSPLV | GQEMTTLSDT | TVMPILSSGM | ECLTRAEADI | ||||
| VLLVDGSWSI | GRANFRTVRS | FISRIVEVFD | IGPKRVQIAL | AQYSGDPRTE | ||||
| WQLNAHRDKK | SLLQAVANLP | YKGGNTLTGM | ALNFIRQQNF | RTQAGMRPRA | ||||
| RKIGVLITDG | KSQDDVEAPS | KKLKDEGVEL | FAIGIKNADE | VELKMIATDP | ||||
| DDTHAYNVAD | FESLSRIVDD | LTINLCNSVK | GPGDLEAPSN | LVISERTHRS | ||||
| FRVSWTPPSD | SVDRYKVEYY | PVSGGKRQEF | YVSRMETSTV | LKDLKPETEY | ||||
| VVNVYSVVED | EYSEPLKGTE | KTLPVPVVSL | NIYDVGPTTM | HVQWQPVGGA | ||||
| TGYILSYKPV | KDTEPTRPKE | VRLGPTVNDM | QLTDLVPNTE | YAVTVQAVLH | ||||
| DLTSEPVTVR | EVTLPLPRPQ | DLKLRDVTHS | TMNVFWEPVP | GKVRKYIVRY | ||||
| KTPEEDVKEV | EVDRSETSTS | LKDLFSQTLY | TVSVSAVHDE | GESPPVTAQE | ||||
| TTRPVPAPTN | LKITEVTSEG | FRGTWDHGAS | DVSLYRITWA | PFGSSDKMET | ||||
| ILNGDENTLV | FENLNPNTIY | EVSITAIYPD | ESESDDLIGS | ERTLPILTTQ | ||||
| APKSGPRNLQ | VYNATSNSLT | VKWDPASGRV | QKYRITYQPS | TGEGNEQTTT | ||||
| IGGRQNSVVL | QKLKPDTPYT | ITVSSLYPDG | EGGRMTGRGK | TKPLNTVRNL | ||||
| RVYDPSTSTL | NVRWDHAEGN | PRQYKLFYAP | AAGGPEELVP | IPGNTNYAIL | ||||
| RNLQPDTSYT | VTVVPVYTEG | DGGRTSDTGR | TLMRGLARNV | QVYNPTPNSL | ||||
| DVRWDPAPGP | VLQYRVVYSP | VDGTRPSESI | VVPGNTRMVH | LERLIPDTLY | ||||
| SVNLVALYSD | GEGNPSPAQG | RTLPRSGPRN | LRVFGETTNS | LSVAWDHADG | ||||
| PVQQYRIIYS | PTVGDPIDEY | TTVPGRRNNV | ILQPLQPDTP | YKITVIAVYE | ||||
| DGDGGHLTGN | GRTVGLLPPQ | NIHISDEWYT | RFRVSWDPSP | SPVLGYKIVY | ||||
| KPVGSNEPME | AFVGEMTSYT | LHNLNPSTTY | DVNVYAQYDS | GLSVPLTDQG | ||||
| TTLYLNVTDL | KTYQIGWDTF | CVKWSPHRAA | TSYRLKLSPA | DGTRGQEITV | ||||
| RGSETSHCFT | GLSPDTDYGV | TVFVQTPNLE | GPGVSVKEHT | TVKPTEAPTE | ||||
| PPTPPPPPTI | PPARDVCKGA | KADIVFLTDA | SWSIGDDNFN | KVVKFIFNTV | ||||
| GGFDEISPAG | IQVSFVQYSD | EVKSEFKLNT | YNDKALALGA | LQNIRYRGGN | ||||
| TRTGKALTFI | KEKVLTWESG | MRKNVPKVLV | VVTDGRSQDE | VKKAALVIQQ | ||||
| SGFSVFVVGV | ADVDYNELAN | IASKPSERHV | FIVDDFESFE | KIEDNLITFV | ||||
| CETATSSCPL | IYLDGYTSPG | FKMLEAYNLT | EKNFASVQGV | SLESGSFPSY | ||||
| SAYRIQKNAF | VNQPTADLHP | NGLPPSYTII | LLFRLLPETP | SDPFAIWQIT | ||||
| DRDYKPQVGV | IADPSSKTLS | FFNKDTRGEV | QTVTFDTEEV | KTLFYGSFHK | ||||
| VHIVVTSKSV | KIYIDCYEII | EKDIKEAGNI | TTDGYEILGK | LLKGERKSAA | ||||
| FQIQSFDIVC | SPVWTSRDRC | CDIPSRRDEG | KCPAFPNSCT | CTQDSVGPPG | ||||
| PPGPAGGPGA | KGPRGERGIS | GAIGPPGPRG | DIGPPGPQGP | PGPQGPNGLS | ||||
| IPGEQGRQGM | KGDAGEPGLP | GRTGTPGLPG | PPGPMGPPGD | RGFTGKDGAM | ||||
| GPRGPPGPPG | SPGSPGVTGP | SGKPGKPGDH | GRPGPSGLKG | EKGDRGDIAS | ||||
| QNMMRAVARQ | VCEQLISGQM | NRFNQMLNQI | PNDYQSSRNQ | PGPPGPPGPP | ||||
| GSAGARGEPG | PGGRPGFPGT | PGMQGPPGER | GLPGEKGERG | TGSSGPRGLP | ||||
| GPPGPQGESR | TGPPGSTGSR | GPPGPPGRPG | NSGIRGPPGP | PGYCDSSQCA | ||||
| SIPYNGQGYP | GSG |
Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.
Література
- Chiquet M., Mumenthaler U., Wittwer M., Jin W., Koch M. (1998). The chick and human collagen alpha1(XII) gene promoter -- activity of highly conserved regions around the first exon and in the first intron. Eur. J. Biochem. 257: 362—371. PMID 9826181 doi:10.1046/j.1432-1327.1998.2570362.x
Примітки
- ↑ Захворювання, генетично пов'язані з COL12A1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑ Human PubMed Reference:.
- ↑ Mouse PubMed Reference:.
- ↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2188 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-15 у Wayback Machine.]
- ↑ UniProt, Q99715 (англ.) . Архів оригіналу за 23 листопада 2017. Процитовано 6 вересня 2017.
Див. також