COL22A1

COL22A1
Ідентифікатори
Символи COL22A1, collagen, type XXII, alpha 1, collagen type XXII alpha 1 chain
Зовнішні ІД OMIM: 610026 MGI: 1916950 HomoloGene: 43567 GeneCards: COL22A1
Пов'язані генетичні захворювання
бронхіальна астма[1]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
169044
69700
Ensembl
н/д
ENSMUSG00000079022
UniProt
Q8NFW1
н/д
RefSeq (мРНК)
NM_152888
NM_027174
RefSeq (білок)
NP_690848
н/д
Локус (UCSC) н/д Хр. 15: 71.67 – 71.91 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

COL22A1 (англ. Collagen type XXII alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 8-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 626 амінокислот, а молекулярна маса — 161 145[5].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAGLRGNAVA GLLWMLLLWS GGGGCQAQRA GCKSVHYDLV FLLDTSSSVG
KEDFEKVRQW VANLVDTFEV GPDRTRVGVV RYSDRPTTAF ELGLFGSQEE
VKAAARRLAY HGGNTNTGDA LRYITARSFS PHAGGRPRDR AYKQVAILLT
DGRSQDLVLD AAAAAHRAGI RIFAVGVGEA LKEELEEIAS EPKSAHVFHV
SDFNAIDKIR GKLRRRLCEN VLCPSVRVEG DRFKHTNGGT KEITGFDLMD
LFSVKEILGK RENGAQSSYV RMGSFPVVQS TEDVFPQGLP DEYAFVTTFR
FRKTSRKEDW YIWQVIDQYS IPQVSIRLDG ENKAVEYNAV GAMKDAVRVV
FRGSRVNDLF DRDWHKMALS IQAQNVSLHI DCALVQTLPI EERENIDIQG
KTVIGKRLYD SVPIDFDLQR IVIYCDSRHA ELETCCDIPS GPCQVTVVTE
PPPPPPPQRP PTPGSEQIGF LKTINCSCPA GEKGEMGVAG PMGLPGPKGD
IGAIGPVGAP GPKGEKGDVG IGPFGQGEKG EKGSLGLPGP PGRDGSKGMR
GEPGELGEPG LPGEVGMRGP QGPPGLPGPP GRVGAPGLQG ERGEKGTRGE
KGERGLDGFP GKPGDTGQQG RPGPSGVAGP QGEKGDVGPA GPPGVPGSVV
QQEGLKGEQG APGPRGHQGA PGPPGARGPI GPEGRDGPPG LQGLRGKKGD
MGPPGIPGLL GLQGPPGPPG VPGPPGPGGS PGLPGEIGFP GKPGPPGPTG
PPGKDGPNGP PGPPGTKGEP GERGEDGLPG KPGLRGEIGE QGLAGRPGEK
GEAGLPGAPG FPGVRGEKGD QGEKGELGLP GLKGDRGEKG EAGPAGPPGL
PGTTSLFTPH PRMPGEQGPK GEKGDPGLPG EPGLQGRPGE LGPQGPTGPP
GAKGQEGAHG APGAAGNPGA PGHVGAPGPS GPPGSVGAPG LRGTPGKDGE
RGEKGAAGEE GSPGPVGPRG DPGAPGLPGP PGKGKDGEPG LRGSPGLPGP
LGTKAACGKV RGSENCALGG QCVKGDRGAP GIPGSPGSRG DPGIGVAGPP
GPSGPPGDKG SPGSRGLPGF PGPQGPAGRD GAPGNPGERG PPGKPGLSSL
LSPGDINLLA KDVCNDCPPG PPGLPGLPGF KGDKGVPGKP GREGTEGKKG
EAGPPGLPGP PGIAGPQGSQ GERGADGEVG QKGDQGHPGV PGFMGPPGNP
GPPGADGIAG AAGPPGIQGS PGKEGPPGPQ GPSGLPGIPG EEGKEGRDGK
PGPPGEPGKA GEPGLPGPEG ARGPPGFKGH TGDSGAPGPR GESGAMGLPG
QEGLPGKDGD TGPTGPQGPQ GPRGPPGKNG SPGSPGEPGP SGTPGQKGSK
GENGSPGLPG FLGPRGPPGE PGEKGVPGKE GVPGKPGEPG FKGERGDPGI
KGDKGPPGGK GQPGDPGIPG HKGHTGLMGP QGLPGENGPV GPPGPPGQPG
FPGLRGESPS METLRRLIQE ELGKQLETRL AYLLAQMPPA YMKSSQGRPG
PPGPPGKDGL PGRAGPMGEP GRPGQGGLEG PSGPIGPKGE RGAKGDPGAP
GVGLRGEMGP PGIPGQPGEP GYAKDGLPGI PGPQGETGPA GHPGLPGPPG
PPGQCDPSQC AYFASLAARP GNVKGP

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

Див. також