COL5A3

COL5A3
Ідентифікатори
Символи	COL5A3, collagen type V alpha 3 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 120216 MGI: 1858212 HomoloGene: 9253 GeneCards: COL5A3
Реагує на сполуку
	ocriplasmin
Онтологія гена
Молекулярна функція	• heparin binding; • extracellular matrix structural constituent; • collagen binding; • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength; • proteoglycan binding;
Клітинна компонента	• collagen type V trimer; • extracellular region; • колаген; • endoplasmic reticulum lumen; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • міжклітинний простір; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• collagen catabolic process; • cell-matrix adhesion; • extracellular matrix organization; • skin development; • collagen fibril organization; • адгезія клітин;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	50509
	53867
	ENSG00000080573
	ENSMUSG00000004098
	P25940
	Q9JLI2
	NM_015719
	NM_016919; NM_001317388
	NP_056534
	NP_001304317; NP_058615
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

COL5A3 (англ. Collagen type V alpha 3 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 19-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 745 амінокислот, а молекулярна маса — 172 121^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGNRRDLGQP	RAGLCLLLAA	LQLLPGTQAD	PVDVLKALGV	QGGQAGVPEG
PGFCPQRTPE	GDRAFRIGQA	STLGIPTWEL	FPEGHFPENF	SLLITLRGQP
ANQSVLLSIY	DERGARQLGL	ALGPALGLLG	DPFRPLPQQV	NLTDGRWHRV
AVSIDGEMVT	LVADCEAQPP	VLGHGPRFIS	IAGLTVLGTQ	DLGEKTFEGD
IQELLISPDP	QAAFQACERY	LPDCDNLAPA	ATVAPQGEPE	TPRPRRKGKG
KGRKKGRGRK	GKGRKKNKEI	WTSSPPPDSA	ENQTSTDIPK	TETPAPNLPP
TPTPLVVTST	VTTGLNATIL	ERSLDPDSGT	ELGTLETKAA	REDEEGDDST
MGPDFRAAEY	PSRTQFQIFP	GAGEKGAKGE	PAVIEKGQQF	EGPPGAPGPQ
GVVGPSGPPG	PPGFPGDPGP	PGPAGLPGIP	GIDGIRGPPG	TVIMMPFQFA
GGSFKGPPVS	FQQAQAQAVL	QQTQLSMKGP	PGPVGLTGRP	GPVGLPGHPG
LKGEEGAEGP	QGPRGLQGPH	GPPGRVGKMG	RPGADGARGL	PGDTGPKGDR
GFDGLPGLPG	EKGQRGDFGH	VGQPGPPGED	GERGAEGPPG	PTGQAGEPGP
RGLLGPRGSP	GPTGRPGVTG	IDGAPGAKGN	VGPPGEPGPP	GQQGNHGSQG
LPGPQGLIGT	PGEKGPPGNP	GIPGLPGSDG	PLGHPGHEGP	TGEKGAQGPP
GSAGPPGYPG	PRGVKGTSGN	RGLQGEKGEK	GEDGFPGFKG	DVGLKGDQGK
PGAPGPRGED	GPEGPKGQAG	QAGEEGPPGS	AGEKGKLGVP	GLPGYPGRPG
PKGSIGFPGP	LGPIGEKGKS	GKTGQPGLEG	ERGPPGSRGE	RGQPGATGQP
GPKGDVGQDG	APGIPGEKGL	PGLQGPPGFP	GPKGPPGHQG	KDGRPGHPGQ
RGELGFQGQT	GPPGPAGVLG	PQGKTGEVGP	LGERGPPGPP	GPPGEQGLPG
LEGREGAKGE	LGPPGPLGKE	GPAGLRGFPG	PKGGPGDPGP	TGLKGDKGPP
GPVGANGSPG	ERGPLGPAGG	IGLPGQSGSE	GPVGPAGKKG	SRGERGPPGP
TGKDGIPGPL	GPLGPPGAAG	PSGEEGDKGD	VGAPGHKGSK	GDKGDAGPPG
QPGIRGPAGH	PGPPGADGAQ	GRRGPPGLFG	QKGDDGVRGF	VGVIGPPGLQ
GLPGPPGEKG	EVGDVGSMGP	HGAPGPRGPQ	GPTGSEGTPG	LPGGVGQPGA
VGEKGERGDA	GDPGPPGAPG	IPGPKGDIGE	KGDSGPSGAA	GPPGKKGPPG
EDGAKGSVGP	TGLPGDLGPP	GDPGVSGIDG	SPGEKGDPGD	VGGPGPPGAS
GEPGAPGPPG	KRGPSGHMGR	EGREGEKGAK	GEPGPDGPPG	RTGPMGARGP
PGRVGPEGLR	GIPGPVGEPG	LLGAPGQMGP	PGPLGPSGLP	GLKGDTGPKG
EKGHIGLIGL	IGPPGEAGEK	GDQGLPGVQG	PPGPKGDPGP	PGPIGSLGHP
GPPGVAGPLG	QKGSKGSPGS	MGPRGDTGPA	GPPGPPGAPA	ELHGLRRRRR
FVPVPLPVVE	GGLEEVLASL	TSLSLELEQL	RRPPGTAERP	GLVCHELHRN
HPHLPDGEYW	IDPNQGCARD	SFRVFCNFTA	GGETCLYPDK	KFEIVKLASW
SKEKPGGWYS	TFRRGKKFSY	VDADGSPVNV	VQLNFLKLLS	ATARQNFTYS
CQNAAAWLDE	ATGDYSHSAR	FLGTNGEELS	FNQTTAATVS	VPQDGCRLRK
GQTKTLFEFS	SSRAGFLPLW	DVAATDFGQT	NQKFGFELGP	VCFSS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Imamura Y., Scott I.C., Greenspan D.S. (2000). The pro-alpha3 (V) collagen chain. Complete primary structure, expression domains in adult and developing tissues, and comparison to the structures and expression domains of the other types V and XI procollagen chains. J. Biol. Chem. 275: 8749—8759. PMID 10722718 doi:10.1074/jbc.275.12.8749
Mann K. (1992). Isolation of the alpha 3-chain of human type V collagen and characterization by partial sequencing. Biol. Chem. Hoppe-Seyler. 373: 69—75. PMID 1571108

Примітки

↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з COL5A3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14864 (англ.) . Архів оригіналу за 13 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-13 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P25940 (англ.) . Архів оригіналу за 30 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 19

[1] Сполуки, які фізично взаємодіють з COL5A3 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14864 (англ.) . Архів оригіналу за 13 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2017-05-13 у Wayback Machine.]

[UniProt-5] UniProt, P25940 (англ.) . Архів оригіналу за 30 травня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]