COL25A1

COL25A1
Ідентифікатори
Символи	COL25A1, AMY, CLAC, CLAC-P, CLACP, CFEOM5, Collagen, type XXV, alpha 1, collagen type XXV alpha 1, collagen type XXV alpha 1 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 610004 MGI: 1924268 HomoloGene: 57111 GeneCards: COL25A1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• heparin binding; • amyloid-beta binding; • extracellular matrix structural constituent; • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength;
Клітинна компонента	• integral component of membrane; • extracellular region; • клітинна мембрана; • колаген; • endoplasmic reticulum lumen; • мембрана; • міжклітинний простір; • integral component of plasma membrane; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• axonogenesis involved in innervation; • extracellular matrix organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	84570
	77018
	ENSG00000188517
	ENSMUSG00000058897
	Q9BXS0
	Q99MQ5
	NM_001256074; NM_032518; NM_198721
	NM_001244952; NM_029838; NM_198711
	NP_001243003; NP_115907; NP_942014
	NP_001231881; NP_084114; NP_942004
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

COL25A1 (англ. Collagen type XXV alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 4-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 654 амінокислот, а молекулярна маса — 64 771^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MLLKKHAGKG	GGREPRSEDP	TPAEQHCART	MPPCAVLAAL	LSVVAVVSCL
YLGVKTNDLQ	ARIAALESAK	GAPSIHLLPD	TLDHLKTMVQ	EKVERLLAQK
SYEHMAKIRI	AREAPSECNC	PAGPPGKRGK	RGRRGESGPP	GQPGPQGPPG
PKGDKGEQGD	QGPRMVFPKI	NHGFLSADQQ	LIKRRLIKGD	QGQAGPPGPP
GPPGPRGPPG	DTGKDGPRGM	PGVPGEPGKP	GEQGLMGPLG	PPGQKGSIGA
PGIPGMNGQK	GEPGLPGAVG	QNGIPGPKGE	PGEQGEKGDA	GENGPKGDTG
EKGDPGSSAA	GIKGEPGESG	RPGQKGEPGL	PGLPGLPGIK	GEPGFIGPQG
EPGLPGLPGT	KGERGEAGPP	GRGERGEPGA	PGPKGKQGES	GTRGPKGSKG
DRGEKGDSGA	QGPRGPPGQK	GDQGATEIID	YNGNLHEALQ	RITTLTVTGP
PGPPGPQGLQ	GPKGEQGSPG	IPGMDGEQGL	KGSKGDMGDP	GMTGEKGGIG
LPGLPGANGM	KGEKGDSGMP	GPQGPSIIGP	PGPPGPHGPP	GPMGPHGLPG
PKGTDGPMGP	HGPAGPKGER	GEKGAMGEPG	PRGPYGLPGK	DGEPGLDGFP
GPRGEKGDLG	EKGEKGFRGV	KGEKGEPGQP	GLDGLDAPCQ	LGPDGLPMPG
CWQK

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з молекулою гепарину. Локалізований у мембрані.

Література

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18603 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2015-09-08 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q9BXS0 (англ.) . Архів оригіналу за 9 березня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 4

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:18603 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 30 серпня 2017. [Архівовано 2015-09-08 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q9BXS0 (англ.) . Архів оригіналу за 9 березня 2017. Процитовано 30 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]