LAMA1

LAMA1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	2JD4
Ідентифікатори
Символи	LAMA1, LAMA, S-LAM-alpha, PTBHS, Laminin, alpha 1, laminin subunit alpha 1
Зовнішні ІД	OMIM: 150320 MGI: 99892 HomoloGene: 21146 GeneCards: LAMA1
Пов'язані генетичні захворювання
	цукровий діабет 2-го типу, ataxia-intellectual disability-oculomotor apraxia-cerebellar cysts syndrome
Реагує на сполуку
	ocriplasmin
Онтологія гена
Молекулярна функція	• signaling receptor binding; • extracellular matrix structural constituent; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • protein C-terminus binding; • glycosphingolipid binding;
Клітинна компонента	• GO:0005578 Позаклітинна матриця; • extracellular region; • базальна мембрана; • laminin-1 complex; • laminin-3 complex; • міжклітинний простір; • мембрана; • cell-cell junction; • laminin complex; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• cell surface receptor signaling pathway; • regulation of cell adhesion; • адгезія клітин; • extracellular matrix organization; • regulation of cell migration; • regulation of embryonic development; • morphogenesis of an epithelial sheet; • protein phosphorylation; • гістогенез; • neuron projection development; • establishment of epithelial cell apical/basal polarity; • retina development in camera-type eye; • epithelial tube branching involved in lung morphogenesis; • branching involved in salivary gland morphogenesis; • retinal blood vessel morphogenesis; • axon guidance; • animal organ morphogenesis; • camera-type eye development; • blood vessel morphogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	284217
	16772
	ENSG00000101680
	ENSMUSG00000032796
	P25391
	P19137
	NM_005559
	NM_008480
	NP_005550
	NP_032506
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LAMA1 (англ. Laminin subunit alpha 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 18-ї хромосоми.^[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 075 амінокислот, а молекулярна маса — 337 084^[6].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRGGVLLVLL	LCVAAQCRQR	GLFPAILNLA	SNAHISTNAT	CGEKGPEMFC
KLVEHVPGRP	VRNPQCRICD	GNSANPRERH	PISHAIDGTN	NWWQSPSIQN
GREYHWVTIT	LDLRQVFQVA	YVIIKAANAP	RPGNWILERS	LDGTTFSPWQ
YYAVSDSECL	SRYNITPRRG	PPTYRADDEV	ICTSYYSRLV	PLEHGEIHTS
LINGRPSADD	LSPKLLEFTS	ARYIRLRLQR	IRTLNADLMT	LSHREPKELD
PIVTRRYYYS	IKDISVGGMC	ICYGHASSCP	WDETTKKLQC	QCEHNTCGES
CNRCCPGYHQ	QPWRPGTVSS	GNTCEACNCH	NKAKDCYYDE	SVAKQKKSLN
TAGQFRGGGV	CINCLQNTMG	INCETCIDGY	YRPHKVSPYE	DEPCRPCNCD
PVGSLSSVCI	KDDLHSDLHN	GKQPGQCPCK	EGYTGEKCDR	CQLGYKDYPT
CVSCGCNPVG	SASDEPCTGP	CVCKENVEGK	ACDRCKPGFY	NLKEKNPRGC
SECFCFGVSD	VCSSLSWPVG	QVNSMSGWLV	TDLISPRKIP	SQQDALGGRH
QVSINNTAVM	QRLAPKYYWA	APEAYLGNKL	TAFGGFLKYT	VSYDIPVETV
DSNLMSHADV	IIKGNGLTLS	TQAEGLSLQP	YEEYLNVVRL	VPENFQDFHS
KRQIDRDQLM	TVLANVTHLL	IRANYNSAKM	ALYRLESVSL	DIASSNAIDL
VVAADVEHCE	CPQGYTGTSC	ESCLSGYYRV	DGILFGGICQ	PCECHGHAAE
CNVHGVCIAC	AHNTTGVHCE	QCLPGFYGEP	SRGTPGDCQP	CACPLTIASN
NFSPTCHLND	GDEVVCDWCA	PGYSGAWCER	CADGYYGNPT	VPGESCVPCD
CSGNVDPSEA	GHCDSVTGEC	LKCLGNTDGA	HCERCADGFY	GDAVTAKNCR
ACECHVKGSH	SAVCHLETGL	CDCKPNVTGQ	QCDQCLHGYY	GLDSGHGCRP
CNCSVAGSVS	DGCTDEGQCH	CVPGVAGKRC	DRCAHGFYAY	QDGSCTPCDC
PHTQNTCDPE	TGECVCPPHT	QGVKCEECED	GHWGYDAEVG	CQACNCSLVG
STHHRCDVVT	GHCQCKSKFG	GRACDQCSLG	YRDFPDCVPC	DCDLRGTSGD
ACNLEQGLCG	CVEETGACPC	KENVFGPQCN	ECREGTFALR	ADNPLGCSPC
FCSGLSHLCS	ELEDYVRTPV	TLGSDQPLLR	VVSQSNLRGT	TEGVYYQAPD
FLLDAATVRQ	HIRAEPFYWR	LPQQFQGDQL	MAYGGKLKYS	VAFYSLDGVG
TSNFEPQVLI	KGGRIRKQVI	YMDAPAPENG	VRQEQEVAMR	ENFWKYFNSV
SEKPVTREDF	MSVLSDIEYI	LIKASYGQGL	QQSRISDISM	EVGRKAEKLH
PEEEVASLLE	NCVCPPGTVG	FSCQDCAPGY	HRGKLPAGSD	RGPRPLVAPC
VPCSCNNHSD	TCDPNTGKCL	NCGDNTAGDH	CDVCTSGYYG	KVTGSASDCA
LCACPHSPPA	SFSPTCVLEG	DHDFRCDACL	LGYEGKHCER	CSSSYYGNPQ
TPGGSCQKCD	CNPHGSVHGD	CDRTSGQCVC	RLGASGLRCD	ECEPRHILME
TDCVSCDDEC	VGVLLNDLDE	IGDAVLSLNL	TGIIPVPYGI	LSNLENTTKY
LQESLLKENM	QKDLGKIKLE	GVAEETDNLQ	KKLTRMLAST	QKVNRATERI
FKESQDLAIA	IERLQMSITE	IMEKTTLNQT	LDEDFLLPNS	TLQNMQQNGT
SLLEIMQIRD	FTQLHQNATL	ELKAAEDLLS	QIQENYQKPL	EELEVLKEAA
SHVLSKHNNE	LKAAEALVRE	AEAKMQESNH	LLLMVNANLR	EFSDKKLHVQ
EEQNLTSELI	VQGRGLIDAA	AAQTDAVQDA	LEHLEDHQDK	LLLWSAKIRH
HIDDLVMHMS	QRNAVDLVYR	AEDHAAEFQR	LADVLYSGLE	NIRNVSLNAT
SAAYVHYNIQ	SLIEESEELA	RDAHRTVTET	SLLSESLVSN	GKAAVQRSSR
FLKEGNNLSR	KLPGIALELS	ELRNKTNRFQ	ENAVEITRQT	NESLLILRAI
PKGIRDKGAK	TKELATSASQ	SAVSTLRDVA	GLSQELLNTS	ASLSRVNTTL
RETHQLLQDS	TMATLLAGRK	VKDVEIQANL	LFDRLKPLKM	LEENLSRNLS
EIKLLISQAR	KQAASIKVAV	SADRDCIRAY	QPQISSTNYN	TLTLNVKTQE
PDNLLFYLGS	STASDFLAVE	MRRGRVAFLW	DLGSGSTRLE	FPDFPIDDNR
WHSIHVARFG	NIGSLSVKEM	SSNQKSPTKT	SKSPGTANVL	DVNNSTLMFV
GGLGGQIKKS	PAVKVTHFKG	CLGEAFLNGK	SIGLWNYIER	EGKCRGCFGS
SQNEDPSFHF	DGSGYSVVEK	SLPATVTQII	MLFNTFSPNG	LLLYLGSYGT
KDFLSIELFR	GRVKVMTDLG	SGPITLLTDR	RYNNGTWYKI	AFQRNRKQGV
LAVIDAYNTS	NKETKQGETP	GASSDLNRLD	KDPIYVGGLP	RSRVVRRGVT
TKSFVGCIKN	LEISRSTFDL	LRNSYGVRKG	CLLEPIRSVS	FLKGGYIELP
PKSLSPESEW	LVTFATTNSS	GIILAALGGD	VEKRGDREEA	HVPFFSVMLI
GGNIEVHVNP	GDGTGLRKAL	LHAPTGTCSD	GQAHSISLVR	NRRIITVQLD
ENNPVEMKLG	TLVESRTINV	SNLYVGGIPE	GEGTSLLTMR	RSFHGCIKNL
IFNLELLDFN	SAVGHEQVDL	DTCWLSERPK	LAPDAEDSKL	LPEPRAFPEQ
CVVDAALEYV	PGAHQFGLTQ	NSHFILPFNQ	SAVRKKLSVE	LSIRTFASSG
LIYYMAHQNQ	ADYAVLQLHG	GRLHFMFDLG	KGRTKVSHPA	LLSDGKWHTV
KTDYVKRKGF	ITVDGRESPM	VTVVGDGTML	DVEGLFYLGG	LPSQYQARKI
GNITHSIPAC	IGDVTVNSKQ	LDKDSPVSAF	TVNRCYAVAQ	EGTYFDGSGY
AALVKEGYKV	QSDVNITLEF	RTSSQNGVLL	GISTAKVDAI	GLELVDGKVL
FHVNNGAGRI	TAAYEPKTAT	VLCDGKWHTL	QANKSKHRIT	LIVDGNAVGA
ESPHTQSTSV	DTNNPIYVGG	YPAGVKQKCL	RSQTSFRGCL	RKLALIKSPQ
VQSFDFSRAF	ELHGVFLHSC	PGTES

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

Nissinen M., Vuolteenaho R., Boot-Handford R., Kallunki P., Tryggvason K. (1991). Primary structure of the human laminin A chain. Limited expression in human tissues. Biochem. J. 276: 369—379. PMID 2049067 doi:10.1042/bj2760369
Haaparanta T., Uitto J., Ruoslahti E., Engvall E. (1991). Molecular cloning of the cDNA encoding human laminin A chain. Matrix. 11: 151—160. PMID 1714537

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з LAMA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Сполуки, які фізично взаємодіють з Laminin subunit alpha 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6481 (англ.) . Архів оригіналу за 17 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-04-17 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, P25391 (англ.) . Архів оригіналу за 12 грудня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 18

[1] Захворювання, генетично пов'язані з LAMA1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Сполуки, які фізично взаємодіють з Laminin subunit alpha 1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[3] Human PubMed Reference:.

[4] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-5] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6481 (англ.) . Архів оригіналу за 17 квітня 2016. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2016-04-17 у Wayback Machine.]

[UniProt-6] UniProt, P25391 (англ.) . Архів оригіналу за 12 грудня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]