LAMB1

LAMB1
Наявні структури
PDB	Пошук ортологів: PDBe RCSB
Список кодів PDB
	4AQS
Ідентифікатори
Символи	LAMB1, CLM, LIS5, Laminin, beta 1, laminin subunit beta 1
Зовнішні ІД	OMIM: 150240 MGI: 96743 HomoloGene: 1722 GeneCards: LAMB1
Пов'язані генетичні захворювання
	cobblestone lissencephaly without muscular or ocular involvement
Онтологія гена
Молекулярна функція	• extracellular matrix structural constituent; • structural molecule activity; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • integrin binding;
Клітинна компонента	• laminin-8 complex; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • laminin-2 complex; • extracellular region; • базальна мембрана; • laminin-10 complex; • perinuclear region of cytoplasm; • laminin-1 complex; • екзосома; • міжклітинний простір; • endoplasmic reticulum lumen; • collagen-containing extracellular matrix; • laminin complex;
Біологічний процес	• endodermal cell differentiation; • positive regulation of epithelial cell proliferation; • positive regulation of cell migration; • neuronal-glial interaction involved in cerebral cortex radial glia guided migration; • extracellular matrix organization; • odontogenesis; • адгезія клітин; • substrate adhesion-dependent cell spreading; • neuron projection development; • посттрансляційна модифікація; • animal organ morphogenesis; • гістогенез; • cell migration; • basement membrane assembly;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ;
	Більше даних
Ортологи
	3912
	16777
	ENSG00000091136
	ENSMUSG00000002900
	P07942
	P02469
	NM_002291
	NM_008482
	NP_002282
	NP_032508
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

LAMB1 (англ. Laminin subunit beta 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 7-ї хромосоми.^[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 786 амінокислот, а молекулярна маса — 198 038^[5].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MGLLQLLAFS	FLALCRARVR	AQEPEFSYGC	AEGSCYPATG	DLLIGRAQKL
SVTSTCGLHK	PEPYCIVSHL	QEDKKCFICN	SQDPYHETLN	PDSHLIENVV
TTFAPNRLKI	WWQSENGVEN	VTIQLDLEAE	FHFTHLIMTF	KTFRPAAMLI
ERSSDFGKTW	GVYRYFAYDC	EASFPGISTG	PMKKVDDIIC	DSRYSDIEPS
TEGEVIFRAL	DPAFKIEDPY	SPRIQNLLKI	TNLRIKFVKL	HTLGDNLLDS
RMEIREKYYY	AVYDMVVRGN	CFCYGHASEC	APVDGFNEEV	EGMVHGHCMC
RHNTKGLNCE	LCMDFYHDLP	WRPAEGRNSN	ACKKCNCNEH	SISCHFDMAV
YLATGNVSGG	VCDDCQHNTM	GRNCEQCKPF	YYQHPERDIR	DPNFCERCTC
DPAGSQNEGI	CDSYTDFSTG	LIAGQCRCKL	NVEGEHCDVC	KEGFYDLSSE
DPFGCKSCAC	NPLGTIPGGN	PCDSETGHCY	CKRLVTGQHC	DQCLPEHWGL
SNDLDGCRPC	DCDLGGALNN	SCFAESGQCS	CRPHMIGRQC	NEVEPGYYFA
TLDHYLYEAE	EANLGPGVSI	VERQYIQDRI	PSWTGAGFVR	VPEGAYLEFF
IDNIPYSMEY	DILIRYEPQL	PDHWEKAVIT	VQRPGRIPTS	SRCGNTIPDD
DNQVVSLSPG	SRYVVLPRPV	CFEKGTNYTV	RLELPQYTSS	DSDVESPYTL
IDSLVLMPYC	KSLDIFTVGG	SGDGVVTNSA	WETFQRYRCL	ENSRSVVKTP
MTDVCRNIIF	SISALLHQTG	LACECDPQGS	LSSVCDPNGG	QCQCRPNVVG
RTCNRCAPGT	FGFGPSGCKP	CECHLQGSVN	AFCNPVTGQC	HCFQGVYARQ
CDRCLPGHWG	FPSCQPCQCN	GHADDCDPVT	GECLNCQDYT	MGHNCERCLA
GYYGDPIIGS	GDHCRPCPCP	DGPDSGRQFA	RSCYQDPVTL	QLACVCDPGY
IGSRCDDCAS	GYFGNPSEVG	GSCQPCQCHN	NIDTTDPEAC	DKETGRCLKC
LYHTEGEHCQ	FCRFGYYGDA	LQQDCRKCVC	NYLGTVQEHC	NGSDCQCDKA
TGQCLCLPNV	IGQNCDRCAP	NTWQLASGTG	CDPCNCNAAH	SFGPSCNEFT
GQCQCMPGFG	GRTCSECQEL	FWGDPDVECR	ACDCDPRGIE	TPQCDQSTGQ
CVCVEGVEGP	RCDKCTRGYS	GVFPDCTPCH	QCFALWDVII	AELTNRTHRF
LEKAKALKIS	GVIGPYRETV	DSVERKVSEI	KDILAQSPAA	EPLKNIGNLF
EEAEKLIKDV	TEMMAQVEVK	LSDTTSQSNS	TAKELDSLQT	EAESLDNTVK
ELAEQLEFIK	NSDIRGALDS	ITKYFQMSLE	AEERVNASTT	EPNSTVEQSA
LMRDRVEDVM	MERESQFKEK	QEEQARLLDE	LAGKLQSLDL	SAAAEMTCGT
PPGASCSETE	CGGPNCRTDE	GERKCGGPGC	GGLVTVAHNA	WQKAMDLDQD
VLSALAEVEQ	LSKMVSEAKL	RADEAKQSAE	DILLKTNATK	EKMDKSNEEL
RNLIKQIRNF	LTQDSADLDS	IEAVANEVLK	MEMPSTPQQL	QNLTEDIRER
VESLSQVEVI	LQHSAADIAR	AEMLLEEAKR	ASKSATDVKV	TADMVKEALE
EAEKAQVAAE	KAIKQADEDI	QGTQNLLTSI	ESETAASEET	LFNASQRISE
LERNVEELKR	KAAQNSGEAE	YIEKVVYTVK	QSAEDVKKTL	DGELDEKYKK
VENLIAKKTE	ESADARRKAE	MLQNEAKTLL	AQANSKLQLL	KDLERKYEDN
QRYLEDKAQE	LARLEGEVRS	LLKDISQKVA	VYSTCL

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до фосфопротеїнів. Задіяний у такому біологічному процесі, як клітинна адгезія. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Vuolteenaho R., Chow L.T., Tryggvason K. (1990). Structure of the human laminin B1 chain gene. J. Biol. Chem. 265: 15611—15616. PMID 1975589

Примітки

↑ Захворювання, генетично пов'язані з LAMB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6486 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
↑ UniProt, P07942 (англ.) . Архів оригіналу за 28 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 7

[1] Захворювання, генетично пов'язані з LAMB1 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.

[2] Human PubMed Reference:.

[3] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-4] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6486 (англ.) . Процитовано 7 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)

[UniProt-5] UniProt, P07942 (англ.) . Архів оригіналу за 28 липня 2017. Процитовано 7 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]