COL20A1

COL20A1
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи COL20A1, bA261N11.4, collagen type XX alpha 1, collagen type XX alpha 1 chain
Зовнішні ІД MGI: 1920618 HomoloGene: 75138 GeneCards: COL20A1
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
57642
73368
Ensembl
ENSG00000101203
ENSMUSG00000016356
UniProt
Q9P218
Q923P0
RefSeq (мРНК)
NM_020882
NM_028518
RefSeq (білок)
NP_065933
NP_082794
Локус (UCSC) Хр. 20: 63.29 – 63.33 Mb Хр. 2: 180.63 – 180.66 Mb
PubMed search [1] [2]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

COL20A1 (англ. Collagen type XX alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на довгому плечі 20-ї хромосоми.[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 284 амінокислот, а молекулярна маса — 135 830[4].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSSGDPAHLG LCLWLWLGAT LGREQVQASG LLRLAVLPED RLQMKWRESE
GSGLGYLVQV KPMAGDSEQE VILTTKTPKA TVGGLSPSKG YTLQIFELTG
SGRFLLARRE FVIEDLKSSS LDRSSQRPLG SGAPEPTPSH TGSPDPEQAS
EPQVAFTPSQ DPRTPAGPQF RCLPPVPADM VFLVDGSWSI GHSHFQQVKD
FLASVIAPFE IGPDKVQVGL TQYSGDAQTE WDLNSLSTKE QVLAAVRRLR
YKGGNTFTGL ALTHVLGQNL QPAAGLRPEA AKVVILVTDG KSQDDVHTAA
RVLKDLGVNV FAVGVKNADE AELRLLASPP RDITVHSVLD FLQLGALAGL
LSRLICQRLQ GGSPRQGPAA APALDTLPAP TSLVLSQVTS SSIRLSWTPA
PRHPLKYLIV WRASRGGTPR EVVVEGPAAS TELHNLASRT EYLVSVFPIY
EGGVGEGLRG LVTTAPLPPP RALTLAAVTP RTVHLTWQPS AGATHYLVRC
SPASPKGEEE EREVQVGRPE VLLDGLEPGR DYEVSVQSLR GPEGSEARGI
RARTPTLAPP RHLGFSDVSH DAARVFWEGA PRPVRLVRVT YVSSEGGHSG
QTEAPGNATS ATLGPLSSST TYTVRVTCLY PGGGSSTLTG RVTTKKAPSP
SQLSMTELPG DAVQLAWVAA APSGVLVYQI TWTPLGEGKA HEISVPGNLG
TAVLPGLGRH TEYDVTILAY YRDGARSDPV SLRYTPSTVS RSPPSNLALA
SETPDSLQVS WTPPLGRVLH YWLTYAPASG LGPEKSVSVP GARSHVTLPD
LQAATKYRVL VSAIYAAGRS EAVSATGQTA CPALRPDGSL PGFDLMVAFS
LVEKAYASIR GVAMEPSAFG GTPTFTLFKD AQLTRRVSDV YPAPLPPEHT
IVFLVRLLPE TPREAFALWQ MTAEDFQPLL GVLLDAGKKS LTYFHRDPRA
ALQEATFDPQ EVRKIFFGSF HKVHVAVGRS KVRLYVDCRK VAERPLGEMG
SPPAAGFVTL GRLAKARGPR SSSAAFQLQM LQIVCSDTWA DEDRCCELPA
SRDGETCPAF VSACSCSSET PGPPGPQGPP GLPGRNGTPG EQGFPGPRGP
PGVKGEKGDH GLPGLQGHPG HQGIPGRVGL QGPKGMRGLE GTAGLPGPPG
PRGFQGMAGA RGTSGERGPP GTVGPTGLPG PKGERGEKGE PQSLATLYQL
VSQASHVSKF DSFHENTRPP MPILEQKLEP GTEPLGSPGT RSKALVPGEW
GRGGRHLEGR GEPGAVGQMG SPGQQGASTQ GLWE

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Nagase T., Kikuno R., Ishikawa K., Hirosawa M., Ohara O. (2000). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XVII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which code for large proteins in vitro. DNA Res. 7: 143—150. PMID 10819331 doi:10.1093/dnares/7.2.143

Примітки

  1. Human PubMed Reference:.
  2. Mouse PubMed Reference:.
  3. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:14670 (англ.) . Архів оригіналу за 15 вересня 2015. Процитовано 21 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-15 у Wayback Machine.]
  4. UniProt, Q9P218 (англ.) . Архів оригіналу за 29 грудня 2016. Процитовано 21 вересня 2017.

Див. також