COL16A1

COL16A1
Ідентифікатори
Символи	COL16A1, 447AA, FP1572, collagen type XVI alpha 1, collagen type XVI alpha 1 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 120326 MGI: 1095396 HomoloGene: 1397 GeneCards: COL16A1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• integrin binding; • GO:0001948, GO:0016582 protein binding; • extracellular matrix structural constituent; • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength;
Клітинна компонента	• extracellular region; • collagen type XVI trimer; • колаген; • endoplasmic reticulum lumen; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • міжклітинний простір; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• cellular response to amino acid stimulus; • integrin-mediated signaling pathway; • жіноча вагітність; • positive regulation of focal adhesion assembly; • integrin activation; • адгезія клітин; • extracellular matrix organization; • cell adhesion mediated by integrin;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	; ; ; ;
	Більше даних
Ортологи
	1307
	107581
	ENSG00000084636
	ENSMUSG00000040690
	Q07092
	Q8BLX7
	NM_001856
	NM_028266
	NP_001847
	NP_082542; NP_001391281; NP_001391282
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

COL16A1 (англ. Collagen type XVI alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 604 амінокислот, а молекулярна маса — 157 751^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MWVSWAPGLW	LLGLWATFGH	GANTGAQCPP	SQQEGLKLEH	SSSLPANVTG
FNLIHRLSLM	KTSAIKKIRN	PKGPLILRLG	AAPVTQPTRR	VFPRGLPEEF
ALVLTLLLKK	HTHQKTWYLF	QVTDANGYPQ	ISLEVNSQER	SLELRAQGQD
GDFVSCIFPV	PQLFDLRWHK	LMLSVAGRVA	SVHVDCSSAS	SQPLGPRRPM
RPVGHVFLGL	DAEQGKPVSF	DLQQVHIYCD	PELVLEEGCC	EILPAGCPPE
TSKARRDTQS	NELIEINPQS	EGKVYTRCFC	LEEPQNSEVD	AQLTGRISQK
AERGAKVHQE	TAADECPPCV	HGARDSNVTL	APSGPKGGKG	ERGLPGPPGS
KGEKGARGND	CVRISPDAPL	QCAEGPKGEK	GESGALGPSG	LPGSTGEKGQ
KGEKGDGGIK	GVPGKPGRDG	RPGEICVIGP	KGQKGDPGFV	GPEGLAGEPG
PPGLPGPPGI	GLPGTPGDPG	GPPGPKGDKG	SSGIPGKEGP	GGKPGKPGVK
GEKGDPCEVC	PTLPEGFQNF	VGLPGKPGPK	GEPGDPVPAR	GDPGIQGIKG
EKGEPCLSCS	SVVGAQHLVS	STGASGDVGS	PGFGLPGLPG	RAGVPGLKGE
KGNFGEAGPA	GSPGPPGPVG	PAGIKGAKGE	PCEPCPALSN	LQDGDVRVVA
LPGPSGEKGE	PGPPGFGLPG	KQGKAGERGL	KGQKGDAGNP	GDPGTPGTTG
RPGLSGEPGV	QGPAGPKGEK	GDGCTACPSL	QGTVTDMAGR	PGQPGPKGEQ
GPEGVGRPGK	PGQPGLPGVQ	GPPGLKGVQG	EPGPPGRGVQ	GPQGEPGAPG
LPGIQGLPGP	RGPPGPTGEK	GAQGSPGVKG	ATGPVGPPGA	SVSGPPGRDG
QQGQTGLRGT	PGEKGPRGEK	GEPGECSCPS	QGDLIFSGMP	GAPGLWMGSS
WQPGPQGPPG	IPGPPGPPGV	PGLQGVPGNN	GLPGQPGLTA	ELGSLPIEQH
LLKSICGDCV	QGQRAHPGYL	VEKGEKGDQG	IPGVPGLDNC	AQCFLSLERP
RAEEARGDNS	EGDPGCVGSP	GLPGPPGLPG	QRGEEGPPGM	RGSPGPPGPI
GPPGFPGAVG	SPGLPGLQGE	RGLTGLTGDK	GEPGPPGQPG	YPGATGPPGL
PGIKGERGYT	GSAGEKGEPG	PPGSEGLPGP	PGPAGPRGER	GPQGNSGEKG
DQGFQGQPGF	PGPPGPPGFP	GKVGSPGPPG	PQAEKGSEGI	RGPSGLPGSP
GPPGPPGIQG	PAGLDGLDGK	DGKPGLRGDP	GPAGPPGLMG	PPGFKGKTGH
PGLPGPKGDC	GKPGPPGSTG	RPGAEGEPGA	MGPQGRPGPP	GHVGPPGPPG
QPGPAGISAV	GLKGDRGATG	ERGLAGLPGQ	PGPPGHPGPP	GEPGTDGAAG
KEGPPGKQGF	YGPPGPKGDP	GAAGQKGQAG	EKGRAGMPGG	PGKSGSMGPV
GPPGPAGERG	HPGAPGPSGS	PGLPGVPGSM	GDMVNYDEIK	RFIRQEIIKM
FDERMAYYTS	RMQFPMEMAA	APGRPGPPGK	DGAPGRPGAP	GSPGLPGQIG
REGRQGLPGV	RGLPGTKGEK	GDIGIGIAGE	NGLPGPPGPQ	GPPGYGKMGA
TGPMGQQGIP	GIPGPPGPMG	QPGKAGHCNP	SDCFGAMPME	QQYPPMKTMK
GPFG

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як клітинна адгезія. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Pan T.-C., Zhang R.-Z., Mattei M.-G., Timpl R., Chu M.-L. (1992). Cloning and chromosomal location of human alpha 1(XVI) collagen. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 89: 6565—6569. PMID 1631157 doi:10.1073/pnas.89.14.6565
Grassel S., Timpl R., Tan E.M.L., Chu M.-L. (1996). Biosynthesis and processing of type XVI collagen in human fibroblasts and smooth muscle cells. Eur. J. Biochem. 242: 576—584. PMID 9022684 doi:10.1111/j.1432-1033.1996.0576r.x

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2193 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-22 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q07092 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2193 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 25 серпня 2017. [Архівовано 2016-03-22 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q07092 (англ.) . Архів оригіналу за 25 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]