COL21A1

COL21A1
Ідентифікатори
Символи	COL21A1, collagen, type XXI, alpha 1, COLA1L, dJ682J15.1, dJ708F5.1, FP633, collagen type XXI alpha 1, collagen type XXI alpha 1 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 610002 HomoloGene: 49949 GeneCards: COL21A1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength;
Клітинна компонента	• цитоплазма; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • extracellular region; • колаген; • endoplasmic reticulum lumen; • гіалоплазма; • міжклітинний простір; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• growth plate cartilage chondrocyte morphogenesis;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Ортологи
	81578
	100333837
	ENSG00000124749
	н/д
	Q96P44
	н/д
	NM_030820; NM_001318751; NM_001318752; NM_001318753; NM_001318754
	XM_002664080; XM_017358912; XM_017358915
	NP_001305680; NP_001305681; NP_001305682; NP_001305683; NP_110447
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

COL21A1 (англ. Collagen type XXI alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 957 амінокислот, а молекулярна маса — 99 369^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAHYITFLCM	VLVLLLQNSV	LAEDGEVRSS	CRTAPTDLVF	ILDGSYSVGP
ENFEIVKKWL	VNITKNFDIG	PKFIQVGVVQ	YSDYPVLEIP	LGSYDSGEHL
TAAVESILYL	GGNTKTGKAI	QFALDYLFAK	SSRFLTKIAV	VLTDGKSQDD
VKDAAQAARD	SKITLFAIGV	GSETEDAELR	AIANKPSSTY	VFYVEDYIAI
SKIREVMKQK	LCEESVCPTR	IPVAARDERG	FDILLGLDVN	KKVKKRIQLS
PKKIKGYEVT	SKVDLSELTS	NVFPEGLPPS	YVFVSTQRFK	VKKIWDLWRI
LTIDGRPQIA	VTLNGVDKIL	LFTTTSVING	SQVVTFANPQ	VKTLFDEGWH
QIRLLVTEQD	VTLYIDDQQI	ENKPLHPVLG	ILINGQTQIG	KYSGKEETVQ
FDVQKLRIYC	DPEQNNRETA	CEIPGFNGEC	LNGPSDVGST	PAPCICPPGK
PGLQGPKGDP	GLPGNPGYPG	QPGQDGKPGY	QGIAGTPGVP	GSPGIQGARG
LPGYKGEPGR	DGDKGDRGLP	GFPGLHGMPG	SKGEMGAKGD	KGSPGFYGKK
GAKGEKGNAG	FPGLPGPAGE	PGRHGKDGLM	GSPGFKGEAG	SPGAPGQDGT
RGEPGIPGFP	GNRGLMGQKG	EIGPPGQQGK	KGAPGMPGLM	GSNGSPGQPG
TPGSKGSKGE	PGIQGMPGAS	GLKGEPGATG	SPGEPGYMGL	PGIQGKKGDK
GNQGEKGIQG	QKGENGRQGI	PGQQGIQGHH	GAKGERGEKG	EPGVRGAIGS
KGESGVDGLM	GPAGPKGQPG	DPGPQGPPGL	DGKPGREFSE	QFIRQVCTDV
IRAQLPVLLQ	SGRIRNCDHC	LSQHGSPGIP	GPPGPIGPEG	PRGLPGLPGR
DGVPGLVGVP	GRPGVRGLKG	LPGRNGEKGS	QGFGYPGEQG	PPGPPGPEGP
PGISKEGPPG	DPGLPGKDGD	HGKPGIQGQP	GPPGICDPSL	CFSVIARRDP
FRKGPNY

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, як альтернативний сплайсинг. Локалізований у цитоплазмі, позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

Fitzgerald J., Bateman J.F. (2001). A new FACIT of the collagen family: COL21A1. FEBS Lett. 505: 275—280. PMID 11566190 doi:10.1016/S0014-5793(01)02754-5
Chou M.-Y., Li H.-C. (2002). Genomic organization and characterization of the human type XXI collagen (COL21A1) gene. Genomics. 79: 395—401. PMID 11863369 doi:10.1006/geno.2002.6712
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17025 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q96P44 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:17025 (англ.) . Архів оригіналу за 10 вересня 2015. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-10 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q96P44 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]