COL9A3

COL9A3
Ідентифікатори
Символи	COL9A3, DJ885L7.4.1, EDM3, IDD, MED, collagen type IX alpha 3, collagen type IX alpha 3 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 120270 MGI: 894686 HomoloGene: 20438 GeneCards: COL9A3
Онтологія гена
Молекулярна функція	• extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength; • extracellular matrix structural constituent;
Клітинна компонента	• collagen type IX trimer; • extracellular region; • колаген; • endoplasmic reticulum lumen; • міжклітинний простір; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• male gonad development; • extracellular matrix organization; • female gonad development;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1299
	12841
	ENSG00000092758
	ENSMUSG00000027570
	Q14050
	н/д
	NM_001853
	NM_009936; NM_001378777
	NP_001844
	н/д
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

COL9A3 (англ. Collagen type IX alpha 3 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 684 амінокислот, а молекулярна маса — 63 616^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAGPRACAPL	LLLLLLGELL	AAAGAQRVGL	PGPPGPPGPP	GKPGQDGIDG
EAGPPGLPGP	PGPKGAPGKP	GKPGEAGLPG	LPGVDGLTGR	DGPPGPKGAP
GERGSLGPPG	PPGLGGKGLP	GPPGEAGVSG	PPGGIGLRGP	PGPSGLPGLP
GPPGPPGPPG	HPGVLPEGAT	DLQCPSICPP	GPPGPPGMPG	FKGPTGYKGE
QGEVGKDGEK	GDPGPPGPAG	LPGSVGLQGP	RGLRGLPGPL	GPPGDRGPIG
FRGPPGIPGA	PGKAGDRGER	GPEGFRGPKG	DLGRPGPKGT	PGVAGPSGEP
GMPGKDGQNG	VPGLDGQKGE	AGRNGAPGEK	GPNGLPGLPG	RAGSKGEKGE
RGRAGELGEA	GPSGEPGVPG	DAGMPGERGE	AGHRGSAGAL	GPQGPPGAPG
VRGFQGQKGS	MGDPGLPGPQ	GLRGDVGDRG	PGGAAGPKGD	QGIAGSDGLP
GDKGELGPSG	LVGPKGESGS	RGELGPKGTQ	GPNGTSGVQG	VPGPPGPLGL
QGVPGVPGIT	GKPGVPGKEA	SEQRIRELCG	GMISEQIAQL	AAHLRKPLAP
GSIGRPGPAG	PPGPPGPPGS	IGHPGARGPP	GYRGPTGELG	DPGPRGNQGD
RGDKGAAGAG	LDGPEGDQGP	QGPQGVPGTS	KDGQDGAPGE	PGPPGDPGLP
GAIGAQGTPG	ICDTSACQGA	VLGGVGEKSG	SRSS

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Peraelae M., Savontaus M., Metsaeranta M., Vuorio E. (1997). Developmental regulation of mRNA species for types II, IX and XI collagens during mouse embryogenesis. Biochem. J. 324: 209—216. PMID 9164858 doi:10.1042/bj3240209

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2219 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-08 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q14050 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 20

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2219 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2015. Процитовано 12 вересня 2017. [Архівовано 2015-09-08 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q14050 (англ.) . Архів оригіналу за 5 жовтня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]