COL19A1

COL19A1
Ідентифікатори
Символи	COL19A1, COL9A1L, D6S228E, collagen type XIX alpha 1, collagen type XIX alpha 1 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 120165 MGI: 1095415 HomoloGene: 55608 GeneCards: COL19A1
Онтологія гена
Молекулярна функція	• protein-macromolecule adaptor activity; • extracellular matrix structural constituent; • extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength;
Клітинна компонента	• endoplasmic reticulum lumen; • колаген; • extracellular region; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • міжклітинний простір; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• collagen catabolic process; • multicellular organism development; • skeletal system development; • диференціація клітин; • muscle organ development; • skeletal muscle tissue development; • extracellular matrix organization; • адгезія клітин; • cell-cell adhesion;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1310
	12823
	ENSG00000082293
	ENSMUSG00000026141
	Q14993
	Q0VF58
	NM_001858
	NM_007733
	NP_001849
	NP_031759
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

COL19A1 (англ. Collagen type XIX alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 6-ї хромосоми.^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 142 амінокислот, а молекулярна маса — 115 221^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MRLTGPWKLW	LWMSIFLLPA	STSVTVRDKT	EESCPILRIE	GHQLTYDNIN
KLEVSGFDLG	DSFSLRRAFC	ESDKTCFKLG	SALLIRDTIK	IFPKGLPEEY
SVAAMFRVRR	NAKKERWFLW	QVLNQQNIPQ	ISIVVDGGKK	VVEFMFQATE
GDVLNYIFRN	RELRPLFDRQ	WHKLGISIQS	QVISLYMDCN	LIARRQTDEK
DTVDFHGRTV	IATRASDGKP	VDIELHQLKI	YCSANLIAQE	TCCEISDTKC
PEQDGFGNIA	SSWVTAHASK	MSSYLPAKQE	LKDQCQCIPN	KGEAGLPGAP
GSPGQKGHKG	EPGENGLHGA	PGFPGQKGEQ	GFEGSKGETG	EKGEQGEKGD
PALAGLNGEN	GLKGDLGPHG	PPGPKGEKGD	TGPPGPPALP	GSLGIQGPQG
PPGKEGQRGR	RGKTGPPGKP	GPPGPPGPPG	IQGIHQTLGG	YYNKDNKGND
EHEAGGLKGD	KGETGLPGFP	GSVGPKGQKG	EPGEPFTKGE	KGDRGEPGVI
GSQGVKGEPG	DPGPPGLIGS	PGLKGQQGSA	GSMGPRGPPG	DVGLPGEHGI
PGKQGIKGEK	GDPGGIIGPP	GLPGPKGEAG	PPGKSLPGEP	GLDGNPGAPG
PRGPKGERGL	PGVHGSPGDI	GPQGIGIPGR	TGAQGPAGEP	GIQGPRGLPG
LPGTPGTPGN	DGVPGRDGKP	GLPGPPGDPI	ALPLLGDIGA	LLKNFCGNCQ
ASVPGLKSNK	GEEGGAGEPG	KYDSMARKGD	IGPRGPPGIP	GREGPKGSKG
ERGYPGIPGE	KGDEGLQGIP	GIPGAPGPTG	PPGLMGRTGH	PGPTGAKGEK
GSDGPPGKPG	PPGPPGIPFN	ERNGMSSLYK	IKGGVNVPSY	PGPPGPPGPK
GDPGPVGEPG	AMGLPGLEGF	PGVKGDRGPA	GPPGIAGMSG	KPGAPGPPGV
PGEPGERGPV	GDIGFPGPEG	PSGKPGINGK	DGIPGAQGIM	GKPGDRGPKG
ERGDQGIPGD	RGSQGERGKP	GLTGMKGAIG	PMGPPGNKGS	MGSPGHQGPP
GSPGIPGIPA	DAVSFEEIKK	YINQEVLRIF	EERMAVFLSQ	LKLPAAMLAA
QAYGRPGPPG	KDGLPGPPGD	PGPQGYRGQK	GERGEPGIGL	PGSPGLPGTS
ALGLPGSPGA	PGPQGPPGPS	GRCNPEDCLY	PVSHAHQRTG	GN

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

W: Триптофан

Y: Тирозин

Кодований геном білок за функцією належить до білків розвитку. Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, диференціація клітин, міогенез. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Inoguchi K., Yoshioka H., Khaleduzzaman M., Ninomiya Y. (1995). The mRNA for alpha 1(XIX) collagen chain, a new member of FACITs, contains a long unusual 3' untranslated region and displays many unique splicing variants. J. Biochem. 117: 137—146. PMID 7775380

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2196 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-22 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q14993 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.

Див. також

Хромосома 6

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2196 (англ.) . Архів оригіналу за 22 березня 2016. Процитовано 6 вересня 2017. [Архівовано 2016-03-22 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q14993 (англ.) . Архів оригіналу за 22 грудня 2016. Процитовано 6 вересня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]