LAMA5

LAMA5
Наявні структури
PDBПошук ортологів: PDBe RCSB
Ідентифікатори
Символи LAMA5, Laminin, alpha 5, laminin subunit alpha 5
Зовнішні ІД OMIM: 601033 MGI: 105382 HomoloGene: 4060 GeneCards: LAMA5
Пов'язані генетичні захворювання
колоректальний рак[1]
Реагує на сполуку
ocriplasmin[2]
Шаблон експресії
Більше даних
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
3911
16776
Ensembl
ENSG00000130702
ENSMUSG00000015647
UniProt
O15230
Q61001
RefSeq (мРНК)
NM_005560
NM_001081171
RefSeq (білок)
NP_005551
NP_001074640
Локус (UCSC) Хр. 20: 62.31 – 62.37 Mb Хр. 2: 179.82 – 179.87 Mb
PubMed search [3] [4]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

LAMA5 (англ. Laminin subunit alpha 5) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 20-ї хромосоми.[5] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 3 695 амінокислот, а молекулярна маса — 399 737[6].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MAKRLCAGSA LCVRGPRGPA PLLLVGLALL GAARAREEAG GGFSLHPPYF
NLAEGARIAA SATCGEEAPA RGSPRPTEDL YCKLVGGPVA GGDPNQTIRG
QYCDICTAAN SNKAHPASNA IDGTERWWQS PPLSRGLEYN EVNVTLDLGQ
VFHVAYVLIK FANSPRPDLW VLERSMDFGR TYQPWQFFAS SKRDCLERFG
PQTLERITRD DAAICTTEYS RIVPLENGEI VVSLVNGRPG AMNFSYSPLL
REFTKATNVR LRFLRTNTLL GHLMGKALRD PTVTRRYYYS IKDISIGGRC
VCHGHADACD AKDPTDPFRL QCTCQHNTCG GTCDRCCPGF NQQPWKPATA
NSANECQSCN CYGHATDCYY DPEVDRRRAS QSLDGTYQGG GVCIDCQHHT
TGVNCERCLP GFYRSPNHPL DSPHVCRRCN CESDFTDGTC EDLTGRCYCR
PNFSGERCDV CAEGFTGFPS CYPTPSSSND TREQVLPAGQ IVNCDCSAAG
TQGNACRKDP RVGRCLCKPN FQGTHCELCA PGFYGPGCQP CQCSSPGVAD
DRCDPDTGQC RCRVGFEGAT CDRCAPGYFH FPLCQLCGCS PAGTLPEGCD
EAGRCLCQPE FAGPHCDRCR PGYHGFPNCQ ACTCDPRGAL DQLCGAGGLC
RCRPGYTGTA CQECSPGFHG FPSCVPCHCS AEGSLHAACD PRSGQCSCRP
RVTGLRCDTC VPGAYNFPYC EAGSCHPAGL APVDPALPEA QVPCMCRAHV
EGPSCDRCKP GFWGLSPSNP EGCTRCSCDL RGTLGGVAEC QPGTGQCFCK
PHVCGQACAS CKDGFFGLDQ ADYFGCRSCR CDIGGALGQS CEPRTGVCRC
RPNTQGPTCS EPARDHYLPD LHHLRLELEE AATPEGHAVR FGFNPLEFEN
FSWRGYAQMA PVQPRIVARL NLTSPDLFWL VFRYVNRGAM SVSGRVSVRE
EGRSATCANC TAQSQPVAFP PSTEPAFITV PQRGFGEPFV LNPGTWALRV
EAEGVLLDYV VLLPSAYYEA ALLQLRVTEA CTYRPSAQQS GDNCLLYTHL
PLDGFPSAAG LEALCRQDNS LPRPCPTEQL SPSHPPLITC TGSDVDVQLQ
VAVPQPGRYA LVVEYANEDA RQEVGVAVHT PQRAPQQGLL SLHPCLYSTL
CRGTARDTQD HLAVFHLDSE ASVRLTAEQA RFFLHGVTLV PIEEFSPEFV
EPRVSCISSH GAFGPNSAAC LPSRFPKPPQ PIILRDCQVI PLPPGLPLTH
AQDLTPAMSP AGPRPRPPTA VDPDAEPTLL REPQATVVFT THVPTLGRYA
FLLHGYQPAH PTFPVEVLIN AGRVWQGHAN ASFCPHGYGC RTLVVCEGQA
LLDVTHSELT VTVRVPKGRW LWLDYVLVVP ENVYSFGYLR EEPLDKSYDF
ISHCAAQGYH ISPSSSSLFC RNAAASLSLF YNNGARPCGC HEVGATGPTC
EPFGGQCPCH AHVIGRDCSR CATGYWGFPN CRPCDCGARL CDELTGQCIC
PPRTIPPDCL LCQPQTFGCH PLVGCEECNC SGPGIQELTD PTCDTDSGQC
KCRPNVTGRR CDTCSPGFHG YPRCRPCDCH EAGTAPGVCD PLTGQCYCKE
NVQGPKCDQC SLGTFSLDAA NPKGCTRCFC FGATERCRSS SYTRQEFVDM
EGWVLLSTDR QVVPHERQPG TEMLRADLRH VPEAVPEAFP ELYWQAPPSY
LGDRVSSYGG TLRYELHSET QRGDVFVPME SRPDVVLQGN QMSITFLEPA
YPTPGHVHRG QLQLVEGNFR HTETRNTVSR EELMMVLASL EQLQIRALFS
QISSAVFLRR VALEVASPAG QGALASNVEL CLCPASYRGD SCQECAPGFY
RDVKGLFLGR CVPCQCHGHS DRCLPGSGVC VDCQHNTEGA HCERCQAGFV
SSRDDPSAPC VSCPCPLSVP SNNFAEGCVL RGGRTQCLCK PGYAGASCER
CAPGFFGNPL VLGSSCQPCD CSGNGDPNLL FSDCDPLTGA CRGCLRHTTG
PRCEICAPGF YGNALLPGNC TRCDCTPCGT EACDPHSGHC LCKAGVTGRR
CDRCQEGHFG FDGCGGCRPC ACGPAAEGSE CHPQSGQCHC RPGTMGPQCR
ECAPGYWGLP EQGCRRCQCP GGRCDPHTGR CNCPPGLSGE RCDTCSQQHQ
VPVPGGPVGH SIHCEVCDHC VVLLLDDLER AGALLPAIHE QLRGINASSM
AWARLHRLNA SIADLQSQLR SPLGPRHETA QQLEVLEQQS TSLGQDARRL
GGQAVGTRDQ ASQLLAGTEA TLGHAKTLLA AIRAVDRTLS ELMSQTGHLG
LANASAPSGE QLLRTLAEVE RLLWEMRARD LGAPQAAAEA ELAAAQRLLA
RVQEQLSSLW EENQALATQT RDRLAQHEAG LMDLREALNR AVDATREAQE
LNSRNQERLE EALQRKQELS RDNATLQATL HAARDTLASV FRLLHSLDQA
KEELERLAAS LDGARTPLLQ RMQTFSPAGS KLRLVEAAEA HAQQLGQLAL
NLSSIILDVN QDRLTQRAIE ASNAYSRILQ AVQAAEDAAG QALQQADHTW
ATVVRQGLVD RAQQLLANST ALEEAMLQEQ QRLGLVWAAL QGARTQLRDV
RAKKDQLEAH IQAAQAMLAM DTDETSKKIA HAKAVAAEAQ DTATRVQSQL
QAMQENVERW QGQYEGLRGQ DLGQAVLDAG HSVSTLEKTL PQLLAKLSIL
ENRGVHNASL ALSASIGRVR ELIAQARGAA SKVKVPMKFN GRSGVQLRTP
RDLADLAAYT ALKFYLQGPE PEPGQGTEDR FVMYMGSRQA TGDYMGVSLR
DKKVHWVYQL GEAGPAVLSI DEDIGEQFAA VSLDRTLQFG HMSVTVERQM
IQETKGDTVA PGAEGLLNLR PDDFVFYVGG YPSTFTPPPL LRFPGYRGCI
EMDTLNEEVV SLYNFERTFQ LDTAVDRPCA RSKSTGDPWL TDGSYLDGTG
FARISFDSQI STTKRFEQEL RLVSYSGVLF FLKQQSQFLC LAVQEGSLVL
LYDFGAGLKK AVPLQPPPPL TSASKAIQVF LLGGSRKRVL VRVERATVYS
VEQDNDLELA DAYYLGGVPP DQLPPSLRRL FPTGGSVRGC VKGIKALGKY
VDLKRLNTTG VSAGCTADLL VGRAMTFHGH GFLRLALSNV APLTGNVYSG
FGFHSAQDSA LLYYRASPDG LCQVSLQQGR VSLQLLRTEV KTQAGFADGA
PHYVAFYSNA TGVWLYVDDQ LQQMKPHRGP PPELQPQPEG PPRLLLGGLP
ESGTIYNFSG CISNVFVQRL LGPQRVFDLQ QNLGSVNVST GCAPALQAQT
PGLGPRGLQA TARKASRRSR QPARHPACML PPHLRTTRDS YQFGGSLSSH
LEFVGILARH RNWPSLSMHV LPRSSRGLLL FTARLRPGSP SLALFLSNGH
FVAQMEGLGT RLRAQSRQRS RPGRWHKVSV RWEKNRILLV TDGARAWSQE
GPHRQHQGAE HPQPHTLFVG GLPASSHSSK LPVTVGFSGC VKRLRLHGRP
LGAPTRMAGV TPCILGPLEA GLFFPGSGGV ITLDLPGATL PDVGLELEVR
PLAVTGLIFH LGQARTPPYL QLQVTEKQVL LRADDGAGEF STSVTRPSVL
CDGQWHRLAV MKSGNVLRLE VDAQSNHTVG PLLAAAAGAP APLYLGGLPE
PMAVQPWPPA YCGCMRRLAV NRSPVAMTRS VEVHGAVGAS GCPAA

Задіяний у таких біологічних процесах, як клітинна адгезія, альтернативний сплайсинг. Локалізований у позаклітинному матриксі, базальній мембрані. Також секретований назовні.

Література

  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
  • Nagase T., Kikuno R., Ohara O. (2001). Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. XXI. The complete sequences of 60 new cDNA clones from brain which code for large proteins. DNA Res. 8: 179—187. PMID 11572484 doi:10.1093/dnares/8.4.179

Примітки

  1. Захворювання, генетично пов'язані з LAMA5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  2. Сполуки, які фізично взаємодіють з Laminin subunit alpha 5 переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
  3. Human PubMed Reference:.
  4. Mouse PubMed Reference:.
  5. HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:6485 (англ.) . Процитовано 12 вересня 2017.{{cite web}}: Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання)
  6. UniProt, O15230 (англ.) . Архів оригіналу за 11 липня 2017. Процитовано 12 вересня 2017.

Див. також