COL23A1

COL23A1
Ідентифікатори
Символи COL23A1, collagen type XXIII alpha 1 chain
Зовнішні ІД OMIM: 610043 MGI: 2653243 HomoloGene: 72101 GeneCards: COL23A1
Пов'язані генетичні захворювання
нервова булімія, ожиріння[1]
Ортологи
Види Людина Миша
Entrez
91522
237759
Ensembl
ENSG00000050767
ENSMUSG00000063564
UniProt
Q86Y22
Q8K4G2
RefSeq (мРНК)
NM_173465
NM_153393
RefSeq (білок)
NP_775736
NP_700442
Локус (UCSC) Хр. 5: 178.24 – 178.59 Mb Хр. 11: 51.18 – 51.47 Mb
PubMed search [2] [3]
Вікідані
Див./Ред. для людейДив./Ред. для мишей

COL23A1 (англ. Collagen type XXIII alpha 1 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 5-ї хромосоми.[4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 540 амінокислот, а молекулярна маса — 51 944[5].

Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MGPGERAGGG GDAGKGNAAG GGGGGRSATT AGSRAVSALC LLLSVGSAAA
CLLLGVQAAA LQGRVAALEE ERELLRRAGP PGALDAWAEP HLERLLREKL
DGLAKIRTAR EAPSECVCPP GPPGRRGKPG RRGDPGPPGQ SGRDGYPGPL
GLDGKPGLPG PKGEKGAPGD FGPRGDQGQD GAAGPPGPPG PPGARGPPGD
TGKDGPRGAQ GPAGPKGEPG QDGEMGPKGP PGPKGEPGVP GKKGDDGTPS
QPGPPGPKGE PGSMGPRGEN GVDGAPGPKG EPGHRGTDGA AGPRGAPGLK
GEQGDTVVID YDGRILDALK GPPGPQGPPG PPGIPGAKGE LGLPGAPGID
GEKGPKGQKG DPGEPGPAGL KGEAGEMGLS GLPGADGLKG EKGESASDSL
QESLAQLIVE PGPPGPPGPP GPMGLQGIQG PKGLDGAKGE KGASGERGPS
GLPGPVGPPG LIGLPGTKGE KGRPGEPGLD GFPGPRGEKG DRSERGEKGE
RGVPGRKGVK GQKGEPGPPG LDQPCPVGPD GLPVPGCWHK

Задіяний у таких біологічних процесах, як альтернативний сплайсинг, поліморфізм. Локалізований у клітинній мембрані, мембрані.

Література

  • Banyard J., Bao L., Zetter B.R. (2003). Type XXIII collagen, a new transmembrane collagen identified in metastatic tumor cells. J. Biol. Chem. 278: 20989—20994. PMID 12644459 doi:10.1074/jbc.M210616200
  • The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504

Примітки

Див. також