COL9A2

COL9A2
Ідентифікатори
Символи	COL9A2, DJ39G22.4, EDM2, MED, STL5, collagen type IX alpha 2, collagen type IX alpha 2 chain
Зовнішні ІД	OMIM: 120260 MGI: 88466 HomoloGene: 37535 GeneCards: COL9A2
Онтологія гена
Молекулярна функція	• extracellular matrix structural constituent conferring tensile strength; • extracellular matrix structural constituent;
Клітинна компонента	• extracellular region; • endoplasmic reticulum lumen; • колаген; • collagen type IX trimer; • базальна мембрана; • міжклітинний простір; • GO:0005578 Позаклітинна матриця; • collagen-containing extracellular matrix;
Біологічний процес	• skeletal system development; • extracellular matrix organization;
	Джерела:Amigo / QuickGO
Шаблон експресії
	Більше даних
Ортологи
	1298
	12840
	ENSG00000049089
	ENSMUSG00000028626
	Q14055
	Q07643
	NM_001852
	NM_007741
	NP_001843
	NP_031767
	Вікідані
Див./Ред. для людей	Див./Ред. для мишей

COL9A2 (англ. Collagen type IX alpha 2 chain) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми. ^[3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 689 амінокислот, а молекулярна маса — 65 131^[4].

Послідовність амінокислот

10	20	30	40	50
MAAATASPRS	LLVLLQVVVL	ALAQIRGPPG	ERGPPGPPGP	PGVPGSDGID
GDNGPPGKAG	PPGPKGEPGK	AGPDGPDGKP	GIDGLTGAKG	EPGPMGIPGV
KGQPGLPGPP	GLPGPGFAGP	PGPPGPVGLP	GEIGIRGPKG	DPGPDGPSGP
PGPPGKPGRP	GTIQGLEGSA	DFLCPTNCPP	GMKGPPGLQG	VKGHAGKRGI
LGDPGHQGKP	GPKGDVGASG	EQGIPGPPGP	QGIRGYPGMA	GPKGETGPHG
YKGMVGAIGA	TGPPGEEGPR	GPPGRAGEKG	DEGSPGIRGP	QGITGPKGAT
GPPGINGKDG	TPGTPGMKGS	AGQAGQPGSP	GHQGLAGVPG	QPGTKGGPGD
QGEPGPQGLP	GFSGPPGKEG	EPGPRGEIGP	QGIMGQKGDQ	GERGPVGQPG
PQGRQGPKGE	QGPPGIPGPQ	GLPGVKGDKG	SPGKTGPRGK	VGDPGVAGLP
GEKGEKGESG	EPGPKGQQGV	RGEPGYPGPS	GDAGAPGVQG	YPGPPGPRGL
AGNRGVPGQP	GRQGVEGRDA	TDQHIVDVAL	KMLQEQLAEV	AVSAKREALG
AVGMMGPPGP	PGPPGYPGKQ	GPHGHPGPRG	VPGIVGAVGQ	IGNTGPKGKR
GEKGDPGEVG	RGHPGMPGPP	GIPGLPGRPG	QAINGKDGDR	GSPGAPGEAG
RPGLPGPVGL	PGFCEPAACL	GASAYASARL	TEPGSIKGP

A: Аланін

C: Цистеїн

D: Аспарагінова кислота

E: Глутамінова кислота

F: Фенілаланін

G: Гліцин

H: Гістидин

I: Ізолейцин

K: Лізин

L: Лейцин

M: Метіонін

N: Аспарагін

P: Пролін

Q: Глутамін

R: Аргінін

S: Серин

T: Треонін

V: Валін

Y: Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі як поліморфізм. Локалізований у позаклітинному матриксі. Також секретований назовні.

Література

The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC). Genome Res. 14: 2121—2127. 2004. PMID 15489334 doi:10.1101/gr.2596504
Peraelae M., Haenninen M., Haestbacka J., Elima K., Vuorio E. (1993). Molecular cloning of the human alpha 2(IX) collagen cDNA and assignment of the human COL9A2 gene to chromosome 1. FEBS Lett. 319: 177—180. PMID 8454052 doi:10.1016/0014-5793(93)80062-Y

Примітки

↑ Human PubMed Reference:.
↑ Mouse PubMed Reference:.
↑ HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2218 (англ.) . Архів оригіналу за 11 травня 2017. Процитовано 25 серпня 2017. [Архівовано 2017-05-11 у Wayback Machine.]
↑ UniProt, Q14055 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

Див. також

Хромосома 1

[1] Human PubMed Reference:.

[2] Mouse PubMed Reference:.

[HGNC-3] HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:2218 (англ.) . Архів оригіналу за 11 травня 2017. Процитовано 25 серпня 2017. [Архівовано 2017-05-11 у Wayback Machine.]

[UniProt-4] UniProt, Q14055 (англ.) . Архів оригіналу за 8 вересня 2017. Процитовано 25 серпня 2017.

[1]

[2]

[3]

[4]